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198401 发表于 2017-8-13 16:02

The genetic admixture in Tibetan-Yi Corridor

The genetic admixture in Tibetan-Yi Corridor
Hong-Bing Yao,Senwei Tang,Xiaotian Yao,Hui-Yuan Yeh,Wanhu Zhang,Zhiyan Xie,Qiajun Du,Liying Ma,Shuoyun Wei,Xue Gong,Zilong Zhang,Quanfang Li,Bingying Xu,Hu-Qin Zhang,Gang Chen,Chuan-Chao Wang


Abstract

Objectives

The Tibetan-Yi Corridor located on the eastern edge of Tibetan Plateau is suggested to be the key region for the origin and diversification of Tibeto-Burman speaking populations and the main route of the peopling of the Plateau. However, the genetic history of the populations in the Corridor is far from clear due to limited sampling in the northern part of the Corridor.
Materials and methods

We collected blood samples from 10 Tibetan and 10 Han Chinese individuals from Gansu province and genotyped about 600,000 genome-wide single nucleotide polymorphisms (SNPs).
Results

Our data revealed that the populations in the Corridor are all admixed on a genetic cline of deriving ancestry from Tibetans on the Plateau and surrounding lowland East Asians. The Tibetan and Han Chinese groups in the north of the Plateau show significant evidence of low-level West Eurasian admixture that could be probably traced back to 600~900 years ago.
Discussion

We conclude that there have been huge population migrations from surrounding lowland onto the Tibetan Plateau via the Tibetan-Yi Corridor since the initial formation of Tibetans probably in Neolithic Time, which leads to the current genetic structure of Tibeto-Burman speaking populations.


[url=http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/ajpa.23291/full]http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/ajpa.23291/full[/url]

198401 发表于 2017-8-13 16:03

[b] [url=http://www.ranhaer.com/redirect.php?goto=findpost&pid=514383&ptid=35758]1#[/url] [i]198401[/i] [/b][attach]52666[/attach]

lindberg 发表于 2017-8-13 16:31

[i=s] 本帖最后由 lindberg 于 2017-8-13 17:34 编辑 [/i]

藏彝走廊还有E{:8_203:},实在令人惊讶!
也许和某位E型名人的起源差不多。

我方队友 发表于 2017-8-14 14:59

[b] [url=http://www.ranhaer.com/redirect.php?goto=findpost&pid=514385&ptid=35758]3#[/url] [i]lindberg[/i] [/b]那位不是元朝时期来华当官的西域色目后裔

white2k 发表于 2017-8-14 15:54

出现E还好,但出现E1a(M132)真是令人吃惊,而且还是两例。中国的E主要是地中海周边的E1b,这支E1a主要分布在西非。或许有零星原住民通过朝觐路线进入中东,然后随蒙古元代入华成为色目,不过最后分别成了汉族和藏族不太合常理。

我方队友 发表于 2017-8-14 16:38

[b] [url=http://www.ranhaer.com/redirect.php?goto=findpost&pid=514483&ptid=35758]5#[/url] [i]white2k[/i] [/b]
被吐蕃劫掠的人口。

wanhuatong 发表于 2017-8-14 18:57

可能和取样有关吧,这组数据里比较奇怪的是没有D

lindberg 发表于 2017-8-14 18:59

[i=s] 本帖最后由 lindberg 于 2017-8-14 19:02 编辑 [/i]

[quote]出现E还好,但出现E1a(M132)真是令人吃惊,而且还是两例。中国的E主要是地中海周边的E1b,这支E1a主要分布在西非。或许有零星原住民通过朝觐路线进入中东,然后随蒙古元代入华成为色目,不过最后分别成了汉族和藏族不 ...
[size=2][color=#999999]white2k 发表于 2017-8-14 15:54[/color] [url=http://www.ranhaer.org/redirect.php?goto=findpost&pid=514483&ptid=35758][img]http://www.ranhaer.org/images/common/back.gif[/img][/url][/size][/quote]
不说还真没注意!
对E了解不多,只从Eupedia上了解过一些E1b1b下面的,西非的那就更奇怪了。
以前看过《国家地理》的一些电视片,讲的是一些西非王国的酋长把首领的位置传给后代,运着黄金到麦加朝圣,然后留在了那里。

imvivi001 发表于 2017-8-14 23:00

[attach]52672[/attach]

.
从图中可以看出,东亚民系的第一成分是傣族特异的浅肉色,不过这种成分在雅库特人中几乎缺失,显示这个民系在东亚欧民系的特殊性。  另外令人惊奇的是,这种东亚标志性成分在大洋洲的美兰尼西亚人群中频度不低,提示南岛人对美兰尼西亚人群的巨大影响。总的来说,这种东亚标志性成分在东亚民系中的普遍性,显示东亚人群的‘南方血统’影响,应该与进入新石器时期之后农业人群大扩散密切相关。
而雅库特较为高频的紫蓝色,在东亚民系中也不容忽视,不过主要是体现在东北亚与北亚民系之中。提示旧石器北方猎人的影响力。
藏族中比较高频的深褐色在东亚人群中也比较普遍,不过在日本人与台湾土著中几乎缺失,一时难以理解。可能这是一种比较晚近形成的成分,难道与南北朝时期的民族大融合有关...?

white2k 发表于 2017-8-14 23:09

[quote]
不说还真没注意!
对E了解不多,只从Eupedia上了解过一些E1b1b下面的,西非的那就更奇怪了。
以前看过《国家地理》的一些电视片,讲的是一些西非王国的酋长把首领的位置传给后代,运着黄金到麦加朝圣,然后留在了 ...
[size=2][color=#999999]lindberg 发表于 2017-8-14 18:59[/color] [url=http://www.ranhaer.org/redirect.php?goto=findpost&pid=514492&ptid=35758][img]http://www.ranhaer.org/images/common/back.gif[/img][/url][/size][/quote]
是的,那个国家叫马里,黄金大国巨有钱,EU4玩两牙属于必占的地方。不过第一次酋长的朝觐应该是14世纪的事情了,考虑到色目人来华的时间,这些E1a应该是更早时期前往麦加的人群。

当然还有一种可能,就是测错了。好像其他数据里没有提到过中国存在E1a吧?

lindberg 发表于 2017-8-14 23:19

[b] [url=http://www.ranhaer.org/redirect.php?goto=findpost&pid=514522&ptid=35758]10#[/url] [i]white2k[/i] [/b]
孤陋寡闻,没听说过。

lindberg 发表于 2017-8-14 23:24

[i=s] 本帖最后由 lindberg 于 2017-8-14 23:26 编辑 [/i]

[b] [url=http://www.ranhaer.org/redirect.php?goto=findpost&pid=514520&ptid=35758]9#[/url] [i]imvivi001[/i] [/b]
可能是某种藏人土著成分,藏人不是传说由来自藏南的亚隆土著和高大美丽的羌人结合而成的吗。

豢龙氏 发表于 2017-8-15 09:36

[i=s] 本帖最后由 豢龙氏 于 2017-8-15 10:03 编辑 [/i]

[quote]52672

.
从图中可以看出,东亚民系的第一成分是傣族特异的浅肉色,不过这种成分在雅库特人中几乎缺失,显示这个民系在东亚欧民系的特殊性。  另外令人惊奇的是,这种东亚标志性成分在大洋洲的美兰尼西亚人群中频 ...
[size=2][color=#999999]imvivi001 发表于 2017-8-14 23:00[/color] [url=http://www.ranhaer.org/redirect.php?goto=findpost&pid=514520&ptid=35758][img]http://www.ranhaer.org/images/common/back.gif[/img][/url][/size][/quote]
可以先参考K=8与K=9的两张图。在K=8时,东亚地区包括雅库特地区都是以浅肉色为主。在K=9时出现了蓝紫色成分,对比其他成分,可以看出蓝紫色成分几乎是直接从浅肉色成分里分出来的。
这说明相对于其他成分,K=9时的浅肉色和蓝紫色成分有着更近的亲缘关系,同属于K=8时的浅肉色所代表的东欧亚成分。在分开后,浅肉色代表了一种偏南的东欧亚成分,蓝紫色代表了一种偏北的东欧亚成分。所以这种成分在美洲和俄罗斯出现,并完全取代了之前浅肉色的东欧亚成分。
在K=11时,出现了褐色成分,这种成分可以看出是从蓝紫色成分里分出来的。以尼泊尔和青藏高原地区最高,在彝族、纳西族、拉祜族及青藏高原地区民族里大比例取代了蓝紫色成分。但对日本、俄罗斯、美洲的蓝紫色成分没有影响。这说明偏北的东欧亚成分又进行了二分,一种是偏东、北两个方向的蓝紫色成分,一种是偏西、南方向的褐色成分。所以这一成分很可能就是自新石器时代晚期以来从藏彝走廊扩张的西北种系成分。
不过还要注意的一点是褐色成分出现的时候除了取代了蓝紫色成分外,还吸收了一些代表南部东亚的肉色成分,暗示了其起源可能也并不单纯。

lindberg 发表于 2017-8-15 10:47

[i=s] 本帖最后由 lindberg 于 2017-8-15 11:04 编辑 [/i]

[b] [url=http://ranhaer.com/redirect.php?goto=findpost&pid=514564&ptid=35758]13#[/url] [i]豢龙氏[/i] [/b]

一直下该文没下来,感觉你说的挺有道理。

但我感觉藏人应该有一种土著成分比例应该不低,不知对应哪种颜色?

是否还需要把K值加大。

豢龙氏 发表于 2017-8-15 11:25

[quote] 13# 豢龙氏

一直下该文没下来,感觉你说的挺有道理。


但我感觉藏人应该有一种土著成分比例应该不低,不知对应哪种颜色?
[size=2][color=#999999]lindberg 发表于 2017-8-15 10:47[/color] [url=http://www.ranhaer.org/redirect.php?goto=findpost&pid=514577&ptid=35758][img]http://www.ranhaer.org/images/common/back.gif[/img][/url][/size][/quote]
不好说,如果说藏人真的有一种土著底层的话,肯定是被包含在棕色里了。这一棕色成分总的来说还是属于东欧亚类型,也就是说如果有这种底层的话可能也是与东欧亚成分亲缘关系非常接近的。藏族地区和其他东亚地区在K降低时的区别是出现了蓝色的南亚成分,考虑到纳西和彝族中并没有出现这一成分,这一成分很可能是晚近时期才融入的。

imvivi001 发表于 2017-8-15 14:05

[b] [url=http://www.ranhaer.org/redirect.php?goto=findpost&pid=514564&ptid=35758]13#[/url] [i]豢龙氏[/i] [/b]
你的分析颇有道理,褐色成分应该是一种是偏西、南方向的成分。不过考虑到这种成分在列岛与台湾土著中几乎缺失,提示这种成分的真正扩散可能是非常晚近的事情。

在看到原文之前,暂时不过多阐释。如小王博士有空,不妨在此为大家答疑~

guwei0001 发表于 2017-8-15 15:11

[quote]52672

.
从图中可以看出,东亚民系的第一成分是傣族特异的浅肉色,不过这种成分在雅库特人中几乎缺失,显示这个民系在东亚欧民系的特殊性。  另外令人惊奇的是,这种东亚标志性成分在大洋洲的美兰尼西亚人群中频 ...
[size=2][color=#999999]imvivi001 发表于 2017-8-14 23:00[/color] [url=http://ranhaer.com/redirect.php?goto=findpost&pid=514520&ptid=35758][img]http://ranhaer.com/images/common/back.gif[/img][/url][/size][/quote]这张图里汉人的结果和yayul的图很接近——主要分为三大成份。

geoanth 发表于 2017-8-15 15:18

[i=s] 本帖最后由 geoanth 于 2017-8-15 15:19 编辑 [/i]

甘肃汉族和甘肃藏族几乎重叠,跟北方汉族接近。甘肃的藏族跟其他藏族的差别大于南北汉族之间的差别。FIGURE 2 Principal Component Analysis (PCA) of Tibetan and Han Chinese samples in Gansu Province with other East Asian populations.
CHB: Han Chinese in Beijing, China; CHD: Chinese in metropolitan Denver, CO, United States; JPT: Japanese in Tokyo, Japan; Han—NChina: Han Chinese in northern China

geoanth 发表于 2017-8-15 15:29

[quote]出现E还好,但出现E1a(M132)真是令人吃惊,而且还是两例。中国的E主要是地中海周边的E1b,这支E1a主要分布在西非。或许有零星原住民通过朝觐路线进入中东,然后随蒙古元代入华成为色目,不过最后分别成了汉族和藏族不 ...
[size=2][color=#999999]white2k 发表于 2017-8-14 15:54[/color] [url=http://www.ranhaer.com/redirect.php?goto=findpost&pid=514483&ptid=35758][img]http://www.ranhaer.com/images/common/back.gif[/img][/url][/size][/quote]
上面的表里列出的是甘肃汉族和甘肃藏族。从原文图2的主成分分析来看,甘肃汉族和甘肃藏族几乎重叠,二者与其他藏族差别较大。甘肃汉族和甘肃藏族中出现西欧亚或非洲成分不奇怪,丝绸之路不就是让人流动的吗。

geoanth 发表于 2017-8-15 15:35

For the West Eurasian admixture, we com-
puted weighted LD curves with Han_Gansu and Tibetan_Gansu as the
test populations and CEU and CHB as the sources. The average admix-
ture times for Han Chinese and Tibetan in Gansu range from about 20
to 30 generations ago (about 600 to 900 years assuming 30 years a
generation), suggesting relatively recent gene flow from West Eurasia
to northwest China. We also estimated mixture fractions of at least
2.4% to 3.3% CEU-related ancestry for those populations.

guwei0001 发表于 2017-8-15 16:15

[quote] 13# 豢龙氏

一直下该文没下来,感觉你说的挺有道理。

但我感觉藏人应该有一种土著成分比例应该不低,不知对应哪种颜色?

是否还需要把K值加大。
[size=2][color=#999999]lindberg 发表于 2017-8-15 10:47[/color] [url=http://ranhaer.com/redirect.php?goto=findpost&pid=514577&ptid=35758][img]http://ranhaer.com/images/common/back.gif[/img][/url][/size][/quote]连接里面有K值图,PDF版

[url=http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/ajpa.23291/full#footer-support-info]Supporting Information[/url][size=12px][size=1.4em]Additional Supporting Information may be found in the online version of this article.[/size]
[td][table=560][tr][td]Filename[/td][td]Description[/td][/tr][tr][td][url=http://onlinelibrary.wiley.com/store/10.1002/ajpa.23291/asset/supinfo/ajpa23291-sup-0001-suppfig1.pdf?v=1&s=9847871e827962f1d5d5c295462441d19eb370ff]ajpa23291-sup-0001-suppfig1.pdf[/url][/td][td]Supporting Information Figure 1.[/td][/tr][/table]
[/size]

geoanth 发表于 2017-8-15 16:31

[quote]可能和取样有关吧,这组数据里比较奇怪的是没有D
[size=2][color=#999999]wanhuatong 发表于 2017-8-14 18:57[/color] [url=http://www.ranhaer.com/redirect.php?goto=findpost&pid=514491&ptid=35758][img]http://www.ranhaer.com/images/common/back.gif[/img][/url][/size][/quote]
的确是取样的问题,前面表里给的甘肃汉族和甘肃藏族,跟其他藏族很不一样。

guwei0001 发表于 2017-8-15 17:01

图中两个古人的Y
尼泊尔古DNA:[b]Chokhopani[/b] C1 1.209x 样本Y-SNP分析、
[url]http://ranhaer.com/thread-35717-1-1.html[/url]

尼泊尔古DNA:[b]Mebrak[/b] M240 0.007x覆盖度Y-SNP分型
[url]http://ranhaer.com/thread-35715-1-1.html[/url]

lindberg 发表于 2017-8-15 18:37

[b] [url=http://ranhaer.com/redirect.php?goto=findpost&pid=514650&ptid=35758]21#[/url] [i]guwei0001[/i] [/b]
谢谢。

lindberg 发表于 2017-8-15 20:46

[i=s] 本帖最后由 lindberg 于 2017-8-15 21:14 编辑 [/i]

[b] [url=http://www.ranhaer.org/redirect.php?goto=findpost&pid=514473&ptid=35758]4#[/url] [i]我方队友[/i] [/b]
我也是听说,那是什么人的后裔呢?

hercules 发表于 2017-8-15 22:29

标题

[quote] 5# white2k
被吐蕃劫掠的人口。
[size=2][color=#999999]我方队友 发表于 2017-8-14 16:38[/color] [url=http://www.ranhaer.com/redirect.php?goto=findpost&pid=514487&ptid=35758][img]http://www.ranhaer.com/images/common/back.gif[/img][/url][/size][/quote]
吐蕃曾是中亚一霸,东坑大唐,西压大食,北抗回鹘,南欺印度。大唐强的时候联合大食对抗大唐,大食强的时候联合葛逻禄抗大食。

hercules 发表于 2017-8-15 23:47

忽然想起,吐蕃强大的时候曾在西方俘虏不少大食军队然后放到东方对付大唐,然后又被大唐俘虏。

Yungsiyebu 发表于 2017-8-16 08:42

甘肃藏族与华北汉祖的主成分组成基本没有什么差异,我认为,其主成分基本可以代表青铜时代西北羌戎系族群的基本血统特征。

M117+样本,是M1532+,此前西南样本也测到过。我推测西南藏羌因奠基人效应,M117+多态性较低,代表人群迁徙的末端。而西北藏羌当有些极高的m117+多态性,这里当为M117+的发迹地。

风虎云龙 发表于 2017-8-16 09:15

汉藏各10个人的数据,看看就算了。不知道的还以为汉族和藏族交叉的E才是汉藏核心呢。另外,深度怀疑E是不是有测错的。王传抄不差论文啊,为什么非要背这个锅。

豢龙氏 发表于 2017-8-16 09:39

[quote]忽然想起,吐蕃强大的时候曾在西方俘虏不少大食军队然后放到东方对付大唐,然后又被大唐俘虏。
[size=2][color=#999999]hercules 发表于 2017-8-15 23:47[/color] [url=http://www.ranhaer.com/redirect.php?goto=findpost&pid=514691&ptid=35758][img]http://www.ranhaer.com/images/common/back.gif[/img][/url][/size][/quote]其实本来不想说的,不过看大家猜测的那么积极我觉得还是要提醒一下。
这篇文章用的是微基因的芯片。我在四月份统计微基因数据的时候,5个E里面有3个E1a,看姓氏都是中国人。在6月份第二次统计的时候,E全是E1b,看姓氏有大量外国朋友。而且之前E1a的那三个姓氏都不见了。
这说明微基因在至少今年四月份之前测到的E1a可能都不是真的E1a,甚至可能都不是E,而是其他单倍群。在六月份重新分析后修正了。

white2k 发表于 2017-8-16 11:55

[quote]其实本来不想说的,不过看大家猜测的那么积极我觉得还是要提醒一下。
这篇文章用的是微基因的芯片。我在四月份统计微基因数据的时候,5个E里面有3个E1a,看姓氏都是中国人。在6月份第二次统计的时候,E全是E1b,看姓 ...
[size=2][color=#999999]豢龙氏 发表于 2017-8-16 09:39[/color] [url=http://www.ranhaer.org/redirect.php?goto=findpost&pid=514705&ptid=35758][img]http://www.ranhaer.org/images/common/back.gif[/img][/url][/size][/quote]
果然如此。我刚刚去wegene姓氏溯源查看了一下,目前E1a的数量是0。E1b1a是数量是5(都是外国人),E1b1b的数量是6(至少1个外国人)。

看来这个论文中引用的E1a数据有相当可能是测错了。

white2k 发表于 2017-8-16 11:55

[quote]其实本来不想说的,不过看大家猜测的那么积极我觉得还是要提醒一下。
这篇文章用的是微基因的芯片。我在四月份统计微基因数据的时候,5个E里面有3个E1a,看姓氏都是中国人。在6月份第二次统计的时候,E全是E1b,看姓 ...
[size=2][color=#999999]豢龙氏 发表于 2017-8-16 09:39[/color] [url=http://www.ranhaer.org/redirect.php?goto=findpost&pid=514705&ptid=35758][img]http://www.ranhaer.org/images/common/back.gif[/img][/url][/size][/quote]
果然如此。我刚刚去wegene姓氏溯源查看了一下,目前E1a的数量是0。E1b1a是数量是5(都是外国人),E1b1b的数量是6(至少1个外国人)。

看来这个论文中引用的E1a数据有相当可能是测错了。

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