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楼主: 风虎云龙

O3a1c-002611新文章

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发表于 2013-3-29 14:01 | 显示全部楼层
Region,PopulationSample sizeN%
Han(Mouping,Shandong,China)HanN.Han481020.83
Han(Ningjin,Shandong,China)HanN.Han45920
Han(Anhui,China)HanC.Han721216.67
Han(Shandong,China)HanN.Han54916.67
Han(Zhitai,Shandong,China)HanN.Han43613.95
Han(Jiangsu,China)HanC.Han1792413.41
Han(Sichuan, China)HanC.Han1371813.14
Han(Dezhou,Shandong,China)HanN.Han51611.76
Han(Penglai,Shandong,China)HanN.Han87910.34
Han(Dongming,Shandong,China)HanN.Han40410
Han(Pingliang,Gansu,China)HanN.Han203209.85
Han(Heilongjiang,China)HanN.Han4149.76
Han(Lijin,Shandong,China)HanN.Han5958.47
Han(Zhangqiu,Shandong,China)HanN.Han4848.33
Han(Qingyang,Gansu,China)HanN.Han6158.2
Han(Tianshui,Gansu,China)HanN.Han353257.08
Han(Wuwei,Gansu,China)HanN.Han6446.25
Han(Shanghe,Shandong,China)HanN.Han4836.25
Han(Lanzhou,Gansu,China)HanN.Han10066
Han(Baiyin,Gansu,China)HanN.Han10165.94
Han(Dingxi,Gansu,China)HanN.Han16684.82
Han(Longnan,Gansu,China)HanN.Han12154.13
Han(Cangshan,Shandong,China)HanN.Han5223.85
Pinghua-Han(Guangxi, China)HanS.Han10132.97
Han(Linshu,Shandong,China)HanN.Han5311.89
Han(Guangxi, China)HanS.Han5911.69
Han(Zhejiang,China)HanS.Han70

低于40个样本,去除。002611明显北高南低,东南亚起源无的放矢。东西方向上,东高西低,特别是西北、西南藏羌系族群比例非常低,此基因型与黄河中下游古族的关联性还是更强,但应当与汉藏语族始祖人群无关。

Region,PopulationSample sizeN%
Baima(Wenxian,Gansu,China)QiangicQiangic13685.88
Queyu(Sichuan,Yajiang, China)QiangicQiangic14842.7
Qiang(Sichuan,Aba, China)QiangicQiang17031.76
Tibetan,Amdo(Gannan,Gansu,China)QiangicTibet26541.51
Muyag(Sichuan,Kangding, China)QiangicQiangic15821.27
Jiarong(Sichuan,Danba, China)QiangicC.Han10410.96
Tibetan(Qinghai,Xi'ning,  China)QiangicTibet12810.78
Tibetan,Khams(Tibet,Qamdo,  China)QiangicTibet27920.72
Tibetan,Khams(Tibet,Nyingchi,  China)QiangicTibet14010.71
Tibetan,Central(Tibet,Shannan,  China)QiangicTibet25110.4
Tibetan,Central(Tibet,Shigatse,  China)QiangicTibet25810.39
Tibetan,Central(Tibet,Lhasa,  China)QiangicTibet27810.36
Luoba(Tibet,Milin, China)QiangicLuoba114
Deng(Tibet,Chayu, China)QiangicDeng66
Tibetan,Amdo(Tibet,Nagqu,  China)QiangicTibet204


东南亚方面:

Region,PopulationSample sizeN%
Lao(Vientiane, Laos)SE.AsiaSE.Asia5935.08
Rien(Xaignabouri,Laos)SE.AsiaSE.Asia4924.08
Sô(Boualapha,Laos)SE.AsiaSE.Asia5012
Laven(Thateng,Laos)SE.AsiaSE.Asia5012
Lamet(Nale,Laos)SE.AsiaSE.Asia42
Oy (Samakhixai,Laos)SE.AsiaSE.Asia50
Katu(Thateng,Laos)SE.AsiaSE.Asia46
Tai Dam(Xam-Tai,Laos)SE.AsiaSE.Asia50
Khmu(Luang-Prabang, Laos)SE.AsiaSE.Asia52
Tai Deang(Huaphuan, Laos)SE.AsiaSE.Asia48
发表于 2013-3-29 14:43 | 显示全部楼层
从分布特征看,推测002611还是更可能与大汶口一系文化相关,关中地区的仰韶文化缺失或者极为罕见,河南、冀南区域当介于二者之间,语言上当与汉藏语系关联性不大,其始祖语言可能伴随东夷族的消亡而消失了。
发表于 2013-3-29 21:55 | 显示全部楼层
本帖最后由 Yungsiyebu 于 2013-3-29 21:58 编辑

安徽是一个002611较高的区域,看一下相关考古和古生态方面的内容。

8000-6500年前,安徽处于石山子文化时期,生产方式以渔猎为主,少量原始农业因素,大暖季来临之时,安徽地区气候较今天更温湿,洪涝灾害频繁,土地盐碱化,不宜与农耕文化,直到6500之后,其后干冷话,大汶口文化南下,原始农业发展起来。安徽淮河流域新石器文化兴衰与自然环境变迁关系研究

很显然,在渔猎时期的石山子文化不似产生较大的人口规模,其人口膨胀当在6500年之后,即大汶口文化南下之后,而更大的人口扩张则要延迟到龙山文化时代,大体与F11在汉族中4800年的估算吻合。
在处于原始农耕文明的古代人类社会,人口数量的变化以及社会的兴衰与气候是息息相关的:夏季风越强,人口数量就越多,社会就越繁荣.孢粉分析结果表明4400年左右的气候事件,导致尉迟寺遗址地区的大汶口文化与龙山文化的更替,蒙城尉迟寺文化层的地质地球化学研究。
发表于 2013-3-31 03:14 | 显示全部楼层
这是广西汉族和少数民族的数据。虽然O3在汉族和少民中的比例普遍不低,但是002611确实极度缺乏,很多少民干脆就是测不出。这和邻近的湖南汉族甚至广东汉族都是有重大差异的。wolfgang 发表于 2013-3-25 22:42

说明一下,我在数据中被归为了广西汉族(编号164),根据的是三代祖居地的原则。但是我家祖上实际是在粤西,所以广西汉族中除了平话人群外其实没有测到。
发表于 2013-3-31 03:25 | 显示全部楼层
本帖最后由 baiyueren 于 2013-3-31 03:27 编辑

不好意思!重新看了一下数据,广西的164号还不是我,但是跟我STR最接近的个体,只差一步DYS391。他跟我同属F11+,而且都有罕见的DYS438=11数值。看来我们是同宗的可能性很大。
发表于 2013-3-31 12:19 | 显示全部楼层
本帖最后由 baiyueren 于 2013-3-31 12:22 编辑

还有当把F11的STR中心值(对应网络图里的中心节点)筛选出来之后,结果如图。可以看到只有2个山东和1个甘肃,山东和甘肃两地巨大的样本量基本上被无视了。这应该是说明了F11的最初人口膨胀的地点不在这两地。
F11-STR.png
发表于 2013-3-31 21:36 | 显示全部楼层
111# sahaliyan
今天看了下familytree,上面印度的R1a可以分为两类,一类是已经测过SNP证实是L342+的,即可以确认为Z93下游的,另外一类是还没有测L342和L657的,我以为这些类型是否确实属于Z93还不一定,不知道和老萨、老永查到的结果是不是同一处?我看的是
India subcontinent DNA Project (incl. India, Pakistan,Bangladesh,Nepal,Bhutan) - Y-DNA Classic Chart,http://www.familytreedna.com/public/India/default.aspx?vgroup=India&vgroup=India&vgroup=India&section=yresults
发表于 2013-3-31 22:27 | 显示全部楼层
121# sahaliyan
老萨能否发一下familytree相关查询结果的链接?我今天查了一下没找到关于Z93的。
发表于 2013-4-3 08:50 | 显示全部楼层
F11在汉族中的年龄只有4.8ky左右,而整个F11年龄有12.1ky之多。鉴于汉族中的F11占了整体F11的绝大不多,可以认为是少数几十例非汉族样本使得整体F11的年龄大幅上升。那么这些样本在何处呢?在F11的average gene diversity的数据中,采样较多的东部汉族和西北汉族的diversity是差不多的,大约是0.38,而采样较少的中部汉族和东北汉族都只有0.33左右。西南汉族很特殊,达到最高的0.47,在整个群体中都是最高的,可以认为是混入了外族样本,即有非汉族血统融入了汉族中。altaic的F11的diversity最低,只有0.28左右,可见都是来自于历史时期的分支。altaic包括青海的土族,吉林和辽宁的满族,内蒙古的蒙古族。由此可见,满族中的那个辽宁新宾的002611大簇很可能很可能来自于F11,是龙山文化的后裔。韩国人和羌族的F11年龄和汉族类似,都是0.38左右,可见和汉族的F11都是来自于龙山时期的大扩张。和F11类似,韩国人中的M117,F444,部分C3,看起来大部分可能和汉族有着同样的来源。在那张表中,藏族和老挝的F11的diversity是比较高的,和西南汉族类似,达到0.46左右。藏族和老挝的F11有些类似,即有部分样本和汉族重合,有部分样本和汉族没有相似性。可见重合的样本属于历史时期的融入,而没有相似性的样本则是远古时期的分离。有的样本,譬如藏族的来自拉萨的3537,在DYS438这个极低变位点上数值居然达到14,和一般的10相去甚远,看起来很像是非Oy的样本。但更多的,我无力判别。现在就有个问题,就是那些非Oy的样本,到底在藏族,西南汉族和老挝人群中是分布在哪里?当然,就以非Oy样本的分布来看,F11南方起源还是可信的。
发表于 2013-4-3 10:02 | 显示全部楼层
F238在藏族中的样本和汉族分离并不明显,至少从树形图上是如此。所以我认为这些F238是后来历史时期融入的结果,而不是远古时期的分离。F238在5000年左右的那场大变动中可能位于关中一带,属于被同化的族群。我们虽然广义的说002611代表东夷,实际上只能确定的说Oy肯定代表东夷,那些非Oy的F11其实更大的可能不属于东夷。F238,002611(XF11,F238)还难以判定。
发表于 2013-4-3 10:37 | 显示全部楼层
y-str多态性判断起源地的方法基本可以无视。
发表于 2013-4-3 10:49 | 显示全部楼层
本帖最后由 wolfgang 于 2013-4-3 10:54 编辑

125# Yungsiyebu
频度法更加荒诞。非Oy的F11的分布还是很能说明问题的,少数几十个(确切的说,可能也就十个左右)急剧加大F11整体年龄的样本都在西南方向。从北方起源一路南迁不会有这个效果。
发表于 2013-4-3 10:58 | 显示全部楼层
本帖最后由 Yungsiyebu 于 2013-4-3 11:08 编辑

这组数据是有些问题的,南方002611是否具备较独特的支系,要看具体的snp分析。

至于F11,绝大多数只有5000上下的共祖年代,具体到每个样本,南北样本最低可以低至千年一下,包括西南样本,南来还是北上,要考虑考古、古生态因素和文史资料。

举一个y-str簇的例子,大约分享2000年上下共祖,甚至更低,其始祖是在这个时期内容北方南下,还是从西南北上,一目了然。


refSAMPNAMEPopulationlocation,freSNPHGSNP excepted

5904Tibetan,KhamsNyingchi, Tibet, China1F11+O3a1c1 

GSH3088HanDingxi, Gansu, China1F11+O3a1c1 

SC91416694HanSichuan, China1F11+O3a1c1 

317HanYunnan, China1F11+O3a1c1 

DYS388DYS19DYS389ABDYS389CDDYS390DYS391DYS392DYS393DYS426DYS437DYS438DYS439
 16121625101412 141012
 16121625101512 141011
 16121625101412 141012
 16121525101412 141013
发表于 2013-4-3 11:08 | 显示全部楼层
127# Yungsiyebu
我们现在要考察的就是非Oy的F11样本,从diversity可知,那些样本,可能也就十个左右都分布在藏族,老挝,西南汉族中。就是这十个左右的样本急剧抬升了整体F11的年龄。仅以我目前的能力,大致可以判断拉萨3537那个样本属于此列。Oy是北方起源,确切的说,是河南山东一带起源,但是F11,可以肯定的说不是。3537那个样本肯定是汉藏分离前的结果,而Oy,是标志汉藏分离的一个标志。
发表于 2013-4-3 11:12 | 显示全部楼层
127# Yungsiyebu
我前面就说过了,藏族和老挝人群中,有些样本是和汉族共享或接近的,有些则距离很远。那些和汉族共享或接近的样本可以用历史时期的融入解释,但是距离很远的样本则不能。
发表于 2013-4-3 11:15 | 显示全部楼层
还有当把F11的STR中心值(对应网络图里的中心节点)筛选出来之后,结果如图。可以看到只有2个山东和1个甘肃,山东和甘肃两地巨大的样本量基本上被无视了。这应该是说明了F11的最初人口膨胀的地点不在这两地。
baiyueren 发表于 2013-3-31 12:19

所谓y-str中心值始祖型一类东西本来就是想当然的。
发表于 2013-4-3 11:18 | 显示全部楼层
127# Yungsiyebu  
我前面就说过了,藏族和老挝人群中,有些样本是和汉族共享或接近的,有些则距离很远。那些和汉族共享或接近的样本可以用历史时期的融入解释,但是距离很远的样本则不能。
wolfgang 发表于 2013-4-3 11:12

首先,未必与汉族的混合相关。
第二,002611如果确与大汶口-龙山一系文化相关,不见得一定所有支系都在北方留下痕迹,毕竟汉族所有F11样本只有4800历史。
发表于 2013-4-3 11:27 | 显示全部楼层
132# Yungsiyebu
我的看法是,目前只能确定Oy是龙山文化扩张的主流,F238更像是关中被龙山文化同化的部分。至于非Oy的002611,我认为更大的可能是和龙山文化无关。譬如拉萨藏族的3537样本,就应该和龙山文化无关。
发表于 2013-4-3 11:41 | 显示全部楼层
本帖最后由 Yungsiyebu 于 2013-4-3 13:12 编辑
127# Yungsiyebu  
我前面就说过了,藏族和老挝人群中,有些样本是和汉族共享或接近的,有些则距离很远。那些和汉族共享或接近的样本可以用历史时期的融入解释,但是距离很远的样本则不能。
wolfgang 发表于 2013-4-3 11:12

具体看老挝样本的分析,2例F11与北方样本具有一致的Y-str,而距离很远的样本,就如从前shi那组样本一样,根本不是O3,而是M95。

http://www.ranhaer.com/thread-24096-1-1.html
发表于 2013-4-3 11:51 | 显示全部楼层
132# Yungsiyebu  
我的看法是,目前只能确定Oy是龙山文化扩张的主流,F238更像是关中被龙山文化同化的部分。至于非Oy的002611,我认为更大的可能是和龙山文化无关。譬如拉萨藏族的3537样本,就应该和龙山文化无关 ...
wolfgang 发表于 2013-4-3 11:27

3537就是438这个点特殊,值非常大,其他位点很常见的组合。大多数测试有误或者录入有误。


refSAMPNAMEPopulationlocation,freSNPHGSNP excepted

3537Tibetan,KhamsLhasa, Tibet, China1F11+O3a1c1 

GSH1422HanDingxi, Gansu, China1F11+O3a1c1 

SD2257HanGuangrao, Shandong, China1F11+O3a1c1 

SD2510HanDezhou, Shandong, China1F11+O3a1c1 

SD2524HanDezhou, Shandong, China1F11+O3a1c1 

LAO45LaoSisattanak,Laos1F11+O3a1c1 

148HanHunan, China1F11+O3a1c1 

1061HanJiangsu, China1F11+O3a1c1 


DYS19DYS389ABDYS389CDDYS390DYS391DYS392DYS393DYS426DYS437DYS438DYS439
15121725101312 1414 ?12
15121725101312 141012
15121725101312 141012
15121725101312 141112
15121725101312 141112
15121725101312 141012
15121725101312 141012
15121725101312 14812
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