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楼主: 一统浆糊

一统浆糊的23andme结果

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 楼主| 发表于 2013-11-11 10:28 | 显示全部楼层
根据23安得米,U2e最高比例出现在印度=巴铁交界的地方。
实际上多数测到是欧洲人,可能是因为欧洲测序的最多。
我仔细研究过母系的传承,可以保证200年之内没有任何非汉甚至可以说非本地人的血统。再古一点,跟任何印欧的关联的可能也很低。
真是百思不得其解。
发表于 2013-11-11 10:33 | 显示全部楼层
根据23安得米,U2e最高比例出现在印度=巴铁交界的地方。
实际上多数测到是欧洲人,可能是因为欧洲测序的最多。
我仔细研究过母系的传承,可以保证200年之内没有任何非汉甚至可以说非本地人的血统。再古一点,跟任 ...
一统浆糊 发表于 2013-11-11 10:28
不用其解,理由可以有无数,在山东可以有无限的遐想。。。
发表于 2013-11-11 10:34 | 显示全部楼层
41# wolfgang 我也不太相信是啥古老遗存,近几百年交流的可能性最大。
发表于 2013-11-11 11:52 | 显示全部楼层
28# 一统浆糊 都替我说了,现在就等严博那边的中通出来,还有23andMe自己的计算结果出来一起公布。
发表于 2013-11-11 11:54 | 显示全部楼层
为什么人是宁财神

我这个病应该是先天的,没法治疗。
好在并不严重,大家也不用太担心,我要是该死早就死了。
打一出生就有这个问题。我娘那时候就发现我睡着了有时候会哼哼地吐很长时间气然后再大口喘气。就象 ...
一统浆糊 发表于 2013-11-11 09:11
宁财神就是写“武林外传”的,他小时候有多动症,注意力不能集中,也是靠吃药,现在好像不吃了。
发表于 2013-11-11 11:54 | 显示全部楼层
42# 一统浆糊 你测到的是更细化的U2e1,印度次大陆U2很多,但子类型和欧洲并不一致。你可以再看看u2e1的样本主要在哪里出现。
发表于 2013-11-11 12:32 | 显示全部楼层
有意思 有意思 搞得我也想测测了
发表于 2013-11-11 12:36 | 显示全部楼层
48# 性手枪 看看dhl最近的受理点,因为样本文件袋在柜台是不收的,必须要亲自跑到最近的express station,http://www.dhl.de/de/express/pop ... onen.html#dhl_00001
发表于 2013-11-11 12:40 | 显示全部楼层
49# Kunsito
这样啊 谢谢
发表于 2013-11-11 13:14 | 显示全部楼层
42# 一统浆糊
可惜我没测MTdna。等细分好了再测之
 楼主| 发表于 2013-11-12 01:06 | 显示全部楼层
整理了我自己所有的mt突变:
位置        个人值        标准值        突变定义的支系
73        G        A        R0-R
152        C        C        U2-U2cde(回复突变)
208        A        T        23andMe bad calls reported by the v3 chip
217        C        T        U2e-U2e123
228        A        G        唯一有价值的个人突变
263        G        A        H2a2a(rCRS)-H2a2
300        C        A        23andMe bad calls reported by the v3 chip
340        T        C        U2e123-U2e1
469        G        C        23andMe bad calls reported by the v3 chip
508        G        A        U2cde-U2e
750        G        A        H2a2-H2a
1438        G        A        H2-H
1811        G        A        U-U234789
2706        G        A        H-HV
3720        G        A        U2cde-U2e
4769        G        A        H2a-H2
5390        G        A        U2cde-U2e
5426        C        T        U2cde-U2e
5820        G        C        23andMe bad calls reported by the v3 chip
5877        G        C        23andMe bad calls reported by the v3 chip
6045        T        C        U2cde-U2e
6152        C        T        U2cde-U2e
7028        T        C        H-HV
8285        I        C        Wrong
8860        G        A        H2a2a(rCRS)-H2a2
10388        T        A        23andMe bad calls reported by the v3 chip
10876        G        A        U2cde-U2e
11467        G        A        R-U
11719        A        G        R0-R
12308        G        A        R-U
12372        A        G        R-U
13020        C        T        U2cde-U2e
13734        C        T        U2cde-U2e
14290        A        T        23andMe bad calls reported by the v3 chip
14422        A        T        23andMe bad calls reported by the v3 chip
14766        T        C        HV-R0
15072        T        A        23andMe bad calls reported by the v3 chip
15326        G        A        H2a2a(rCRS)-H2a2
15907        G        A        U2cde-U2e
16051        G        A        U234789-U2
16129        C        G        U2cde-U2e
16179        T        C        23andMe bad calls reported by the v3 chip
16180        C        A        23andMe bad calls reported by the v3 chip
16362        C        T        U2cde-U2e
16392        A        T        23andMe bad calls reported by the v3 chip
16519        C        T        Not considered in Mtdna Tree
 楼主| 发表于 2013-11-12 01:11 | 显示全部楼层
太坑人,本以为发现了一堆个人突变。最后发现全是测序错误。。。。。。。

到U2e1下面,无法判断细分类型了。除了有点可能是U2e1d之外,可以排除其它分枝。最有可能的是U2e1*。但因为有228a突变,没准可以当作一个新类型。

看上去跟别的U2e1相差都很远。。。。。
发表于 2013-11-12 09:41 | 显示全部楼层
對於線粒體來說,二代測全序效果好於芯片,畢竟芯片不是窮舉,沒法測出沒有設探針的位點,而且可能因爲接連的突變導致探針結合不牢而出不了結果。還有,如果有體細胞突變(就是不是所有細胞的DNA都相同,有百分之幾不同的話),也只有二代測序能測出來,Sanger或芯片都測不了。
 楼主| 发表于 2013-11-13 02:53 | 显示全部楼层
本帖最后由 一统浆糊 于 2013-11-13 10:23 编辑

看来我还有有空把MT全序测了吧。
 楼主| 发表于 2013-11-13 02:54 | 显示全部楼层
本帖最后由 一统浆糊 于 2013-11-13 02:56 编辑

SNP编号Y位置祖先单倍群突变名
i40000952649694TG不知
rs352849702734854TCCM130
i40002756740172GT不知
i40001658685038AGCP255
rs414188614197867AGCF-CP143
i400018914484394TCI1P40
i400019414495251AGC3P44
rs203259514813991TCCTM168
i400015214819693TGM3P117
rs203266815437333CAC3M217
rs203266615437564TCCM216
i400014015478017GAA1b1b2a1aP102
rs978627415810962TGIJKL69
i400016717286006CACP260
i400028717287673TGE1b1b1a1d
V65
i400005317398597IDFP14
i400012719092559CGF2M428
rs448179121409706GCR1bP277
i400007721706386DIBTM139
i400006521765281TAD2a1bM116.1
i400008621866675AGE1b1b1b1a2aM165
rs203263021866840TABTM42
rs203265121907538DIBTM91
rs203264721938158ACBTM94
rs934131222741728TAA1b?M276?
rs934131722744945TCCTM294
rs1344734722748506GTBTM299
rs226859124464597GCD2a1bIMS-JST022457
 楼主| 发表于 2013-11-13 02:58 | 显示全部楼层
楼上把自己所有的Y染色体突变总结了一下。
看来我除了是C3的可能最大之外,也有一定的可能性是D2a。
发表于 2013-11-13 07:10 | 显示全部楼层
57# 一统浆糊
That is a lot of false positives.  They should have eliminated those by now since the V3 chip has been out for a couple years now.
发表于 2013-11-13 11:20 | 显示全部楼层
楼上把自己所有的Y染色体突变总结了一下。
看来我除了是C3的可能最大之外,也有一定的可能性是D2a。
一统浆糊 发表于 2013-11-13 02:58
23andMe的Y-SNP不是確認的嗎??
 楼主| 发表于 2013-11-13 23:00 | 显示全部楼层
我用www.isogg.org的Y-DNA SNP Index - 2013对比了下,
19092559、21409706、21866675、22741728这4个应该没有突变吧
17287673、17398597、21706386这3个的Y位置和突变名好像不一致
但15478017(A1b1b2a1a)、2649694(B1)、21765281(D2a1b)、24464597(D2a1b)、15810962(IJK)、14484394(I1)、14819693(M3)这7个突变都确实存在,这咋回事呢,这很正常吗,各位请给我扫个盲
ccdk 发表于 2013-11-13 17:12


很努力。不错,有大进步,知道到SNP index去查但是这个不是唯一的,我搞这个表查了上百种文献呢。
这都不是重点。
我的意思是说23andme的结果有很大问题。错误率太高了。
我的Y,是C3无疑的。除了STR人作证之外。本次测序中C3也是唯一整个系列突变都存在的。
只是原来想能否看下C3以下的分枝是不可能了。
 楼主| 发表于 2013-11-13 23:50 | 显示全部楼层
基因相似图
sim1.jpg
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