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肺结核杆菌“北京簇”最近两百年在全世界范围的扩散

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发表于 2015-1-30 20:18 | 显示全部楼层 |阅读模式
Nature Genetics

(2015)

doi:10.1038/ng.3195
Evolutionary history and global spread of theMycobacterium tuberculosis Beijing lineage
Matthias Merker, et al.


Mycobacterium tuberculosis strains of the Beijing lineage are globally distributed and are associated with the massive spread of multidrug-resistant (MDR) tuberculosis in Eurasia. Here we reconstructed the biogeographical structure and evolutionary history of this lineage by genetic analysis of 4,987 isolates from 99 countries and whole-genome sequencing of 110 representative isolates. We show that this lineage initially originated in the Far East, from where it radiated worldwide in several waves. We detected successive increases in population size for this pathogen over the last 200 years, practically coinciding with the Industrial Revolution, the First World War and HIV epidemics. Two MDR clones of this lineage started to spread throughout central Asia and Russia concomitantly with the collapse of the public health system in the former Soviet Union. Mutations identified in genes putatively under positive selection and associated with virulence might have favored the expansion of the most successful branches of the lineage.

Figure 1

Figure 2




3.
  • Figure 3


http://www.nature.com/ng/journal/vaop/ncurrent/full/ng.3195.html
 楼主| 发表于 2015-1-30 20:25 | 显示全部楼层
通过结核杆菌的全序和序列片段,计算得到 结核杆菌“北京簇”在最近两百年内有三次较大范围的扩散,分别对应工业革命,二次世界大战和HIV流行的年代。肺结核杆菌“北京簇”以其耐药性而备受关注。

此外,在苏联解体之后,随着医疗体系的崩溃,有两种耐药菌株在中亚和俄罗斯境内大规模扩散。通过对与病菌毒性相关以及受到正向选择的突变位点的识别,我们能够追溯晚近发生的病菌的这些扩散事件。

评:TB有很大耐药性,已经与人体免疫系统共生了数千年。TB与人体免疫系统一定程度上已经达成了某种妥协。目前人类难以应对这种病菌。
发表于 2015-1-30 20:43 | 显示全部楼层
起源于哪里?真的是北京吗?
 楼主| 发表于 2015-1-30 20:51 | 显示全部楼层
不是。它在华北高发。
发表于 2015-1-31 06:43 | 显示全部楼层
可以介绍下如何预防肺结核吗?
发表于 2015-2-2 19:56 | 显示全部楼层

标题

不是。它在华北高发。
Ryan 发表于 2015-1-30 20:51

啥时传到西方的?
 楼主| 发表于 2015-2-2 21:05 | 显示全部楼层
北京型在欧洲病例中占的比例不高,主要出现在前苏联国家或周边地区。欧洲的单倍型都是北京型下游的两个小支系。Mokrousov et al. Genome Res 15(10):1357-1364. 推测是伴随蒙古人的历史活动而传播去的。据最新的计算,确实很晚近,相当吻合。

TB北京型在南非也极为流行,是近几百年才穿过去的。非洲土著对这种耐药性很强的TB 类型没有什么免疫力。
发表于 2015-2-4 10:07 | 显示全部楼层
可以介绍下如何预防肺结核吗?
Kunsito 发表于 2015-1-31 06:43
卡介苗。。。。。。。。。。。。
发表于 2015-2-4 10:07 | 显示全部楼层
肺结核是病菌,不是病毒。

评分

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发表于 2015-2-4 10:09 | 显示全部楼层
起源于哪里?真的是北京吗?
hercules 发表于 2015-1-30 20:43
正确说法是在北京病人体内最早提取识别出来。以发现地起名,和起源地无关。
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