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楼主: cpan0256

Ancient Genomics Reveals Four Prehistoric Migration Waves into Southeast Asia

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发表于 2018-3-11 00:21 | 显示全部楼层
本帖最后由 大昊 于 2018-3-11 01:13 编辑

同样,两份苗族族群看起来有差异,其实没差异。
一个是100%的“2”,一个是80%的“2”+10%的“1”+10%的“3”,本质上是极其接近甚至一样的。

888副本_副本.jpg
差异在于,机器把其中一个苗族族群的成分当100%的单一标杆。
于是稍有差异(这种差异是平行的,而非南北的)的另一个苗族族群,就成了80%的苗族成分,加上10%更北的成分,再加上10%更南的成分。
其实,这10%更北的成分和10%更南的成分,也可以大体上合成苗族成分。
只是,合成的准确比例可能是是11%+9%,又可能是9%+11%,所以机器认为另一个苗族族群没法100%合成苗族成分(因为机器认为合成后总有零头,比如98%苗族成分+2%的X零头,而这2%的X零头找不到合适的成分表示。)
所以,机器认为另一个苗族族群的常染里小部分分开呈现更合适,于是就呈现出上面的这种状况。
 楼主| 发表于 2018-3-11 04:28 | 显示全部楼层
本帖最后由 cpan0256 于 2018-3-11 04:36 编辑

帝国大反击!

几天之内,另一个研究组也出了一篇相似的文章(链接和摘要加在1楼)。

下面列的是1楼第2篇文章测的样本:

Lt1.jpg
 楼主| 发表于 2018-3-11 04:33 | 显示全部楼层
顶楼第2篇文章的一张图:

Lf1.jpg
发表于 2018-3-11 06:54 | 显示全部楼层
帝国大反击!

几天之内,另一个研究组也出了一篇相似的文章(链接和摘要加在1楼)。

下面列的是1楼第2篇文章测的样本:

56516
cpan0256 发表于 2018-3-11 04:28

居然测出了青铜初期的I2a2, 真的令人不敢相信! 昨晚还在讨论赛姨妈流寇,难道真是他们?
发表于 2018-3-11 06:57 | 显示全部楼层
顶楼第2篇文章的一张图:

56517
cpan0256 发表于 2018-3-11 04:33

从这张图可以看出作者团队的大脑有问题,既然已经测出了I2a2,那干嘛不把西亚欧人群加入进来一起比对呢...?
发表于 2018-3-11 07:32 | 显示全部楼层
居然是莱希-Lipson等大牛们的最新作品,阵容超级豪华吖

Ancient genomes document multiple waves of migration in Southeast Asian prehistory | bioRxiv  https://www.biorxiv.org/content/early/2018/03/10/279646

Abstract

Southeast Asia is home to rich human genetic and linguistic diversity, but the details of past population movements in the region are not well known. Here, we report genome-wide ancient DNA data from thirteen Southeast Asian individuals spanning from the Neolithic period through the Iron Age (4100-1700 years ago). Early agriculturalists from Man Bac in Vietnam possessed a mixture of East Asian (southern Chinese farmer) and deeply diverged eastern Eurasian (hunter-gatherer) ancestry characteristic of Austroasiatic speakers, with similar ancestry as far south as Indonesia providing evidence for an expansive initial spread of Austroasiatic languages. In a striking parallel with Europe, later sites from across the region show closer connections to present-day majority groups, reflecting a second major influx of migrants by the time of the Bronze Age.
发表于 2018-3-11 07:36 | 显示全部楼层
居然测出了青铜初期的I2a2, 真的令人不敢相信! 昨晚还在讨论赛姨妈流寇,难道真是他们?
imvivi001 发表于 2018-3-11 06:54

看错了,作者团队依然把这个样品归为‘新石器末期采猎者’,看来古代西亚欧人还是真能跑的,呵呵
 楼主| 发表于 2018-3-11 07:40 | 显示全部楼层
有人猜145楼的表里的I2a2a2a是因为打错字把O打成了I,在键盘上I和O靠在一起。有没有可能因为另一个小组的预印本已经出了所以赶紧把本组的文章打完字上传造成的?
发表于 2018-3-11 07:46 | 显示全部楼层
Rice farming began in the region approximately 4500–4000 yBP and was accompanied by a relatively uniform and widespread suite of tools and pottery styles showing connections to southern China [4–6]
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难道之前的土著真的这么笨? 连种水稻都学不会? 我怀疑之前的农业可能与巴布亚地区一样,是根茎类作物,产量低,比较原始,因此难以形成东亚农业社会那种高度社会组织化的组织,因此最后落败了
发表于 2018-3-11 07:48 | 显示全部楼层
拿一万年前的C2证明三四万年前的C2也总比你拿现代的C2证明三四万年前的C2强
MNOPS 发表于 2018-3-10 22:31
我拿现代的C2?把你的缅甸老师叫出来解释一下我认为后来在北方起源的C2如何说明其走南方路线的?
发表于 2018-3-11 08:15 | 显示全部楼层
Our results provide strong genetic support for the hypothesis that agriculture was first practiced in Mainland Southeast Asia by (proto-) Austroasiatic-speaking migrants from southern China [4–6, 11–13]. We find that all seven of our sampled individuals from Man Bac are closely related to present-day Austroasiatic speakers, including a shared pattern of admixture, with one, VN29, showing significantly elevated indigenous ancestry.(似乎与新石器开始西亚农夫替代当地采猎者土著的模式惊人的一致)
     By comparison, studies of cranial and dental morphology have placed Man Bac either close to present-day East and Southeast Asians (“Neolithic”), intermediate between East Asians and a cluster containing more ancient hunter-gatherers from the region plus present-day Onge and Papuan (“indigenous”), or split between the two clusters [7,9,27].(很明显,此时华南的新石器农夫是典型的东亚人种而不是澳美人种,尽管极个别的不排除混有澳美人种的成分)
    The simplest explanation for our results is that the majority of our samples represent a homogeneous Neolithic cluster, with recent local contact between farmers and hunter-gatherers leading to additional hunter-gatherer ancestry in VN29 and perhaps VN40 [7, 9]. This model would imply that the incoming farmers had already acquired 25–30% hunter-gatherer
ancestry, either in China or Southeast Asia, establishing the characteristic Austroasiaticaffiliated genetic profile seen in multiple populations today.(依然与欧洲发展模式一样,这些南下的华南农夫开始一定程度的与当地人混合,并且把农业技术以及华南南亚语传输给当地土著。不过问题来了,之前土著说什么语言呢? 巴布亚语?达罗吡荼语? 安达曼语?or 某种混合语?)
     The symmetric position with respect to Native Americans of (1) the majority East Asian ancestral lineage in Man Bac,
and (2) aboriginal Taiwanese, points to an origin for the farming migration specifically in southern China (contrasting with f4(X, Atayal; Mixe, Dinka) > 0 for northern East Asians X = Han, Japanese, or Korean, Z > 4.5).(可能小濮同学要表示抗议,明明是来自戎狄,怎么只有华南农夫呢?
发表于 2018-3-11 08:21 | 显示全部楼层
我可没说过早期的南亚语系人群或澳泰语系人群是戎狄,他们无疑是来自中国中南部地区。

我说的戎狄跟起源于西北的汉藏的关系更大。
发表于 2018-3-11 08:23 | 显示全部楼层
153# hercules
不明白你要表达什么,你还是先组织一下你自己的话语吧,我看你的中文水平还不如缅甸人
发表于 2018-3-11 08:28 | 显示全部楼层
出现严重错误的南亚-东南亚人群发育树图(原文Figure S2),如下:

error-南亚-东南亚-发育树-lipson2018.png
发表于 2018-3-11 08:47 | 显示全部楼层
本帖最后由 imvivi001 于 2018-3-11 08:49 编辑
有人猜145楼的表里的I2a2a2a是因为打错字把O打成了I,在键盘上I和O靠在一起。有没有可能因为另一个小组的预印本已经出了所以赶紧把本组的文章打完字上传造成的?
cpan0256 发表于 2018-3-11 07:40

的确有这个可能,我也觉得I2a2那个吊样子不太可能扩展的这么远,除非跟着R1人群还差不多
俺也经常是把I和O混打的
发表于 2018-3-11 09:10 | 显示全部楼层
不是的,新图墨绿色对应的才是原K14深蓝色。

而洋红色(苗族成分)是新拼凑出来的一种成分,由原K14的深蓝色+绿色南岛成分拼凑而来(注意,原K14的淡蓝色的苗瑶成分就含一半左右的南岛成分)。

也可以说,洋 ...
大昊 发表于 2018-3-10 23:41

我用绘图软件量过了,苗族深蓝色高的有7成,不是6成。
lanse3.png
lanse4.png
发表于 2018-3-11 09:25 | 显示全部楼层
我用绘图软件量过了,苗族深蓝色高的有7成,不是6成。
guwei0001 发表于 2018-3-11 09:10

泰国苗与中国苗常染相差不大,神奇,说明这是一个非常孤傲的民族,和我之前近距离的观察是一致的
发表于 2018-3-11 09:30 | 显示全部楼层
泰国苗与中国苗常染相差不大,神奇,说明这是一个非常孤傲的民族,和我之前近距离的观察是一致的
imvivi001 发表于 2018-3-11 09:25


泰国苗与中国苗常染相差不大
----------------
确实
发表于 2018-3-11 09:37 | 显示全部楼层
151# cpan0256
我也觉得这种可能性比较大,错把O打成了I
发表于 2018-3-11 09:52 | 显示全部楼层
有人猜145楼的表里的I2a2a2a是因为打错字把O打成了I,在键盘上I和O靠在一起。有没有可能因为另一个小组的预印本已经出了所以赶紧把本组的文章打完字上传造成的?
cpan0256 发表于 2018-3-11 07:40

如果是CTS1602则很正常,这个在现代华南依然有一些比例,其兄弟支系在现代京族中很常见。
另外,我怀疑这个支系本来应该是南亚语族的主要支系之一,其与M95一道共同构成汉语的南亚语底层的逻辑基础(当然还会有其他支系以及mt的某些类型)
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