Google

蓝海人类学在线 Ryan WEI's Forum of Anthropology

 找回密码
 注册
楼主: 一统浆糊

一统浆糊全基因组测序结果

[复制链接]
 楼主| 发表于 2018-7-15 07:38 | 显示全部楼层
40# c3e


 楼主| 发表于 2018-8-11 21:47 | 显示全部楼层
更新,测序已经完成。数据陆续放出,现在拿到SNP 列表 的VCF, 先自己研究一下。
 楼主| 发表于 2018-8-12 01:24 | 显示全部楼层
手工看了一下Y上的SNP,居然有些新发现,confirming......
 楼主| 发表于 2018-8-12 10:08 | 显示全部楼层
崩溃崩溃,唯有流泪!
发表于 2018-8-12 10:39 | 显示全部楼层
实在忍不住了,关心地问一声:“兄弟,你这是喜悦的泪水吗?”
 楼主| 发表于 2018-8-12 12:43 | 显示全部楼层
根据我简单的手工查对的结果,我是CTS2657下面的一个新支系。
传闻金母猪族中有古墓测DNA,可能也是CTS2657下的一个新支系。
万一真的对上了,可就是上苍对人类开的一个大玩笑了。
 楼主| 发表于 2018-8-12 12:46 | 显示全部楼层
当然,这个方面我并不是很熟,看错了也有可能 。需要一点儿时间学习些新东西进行深入查对。
发表于 2018-8-12 13:13 | 显示全部楼层
本帖最后由 双头鹰 于 2018-8-12 13:28 编辑
当然,这个方面我并不是很熟,看错了也有可能 。需要一点儿时间学习些新东西进行深入查对。
一统浆糊 发表于 2018-8-12 12:46


看一下这些点位的情况,哪些有突变的


SNP
2803242GA14895
2831668AA14896
6924203GA14897
17425417GA14909
7399476CMF1549
14264476CMF1551
14637315CMF1553
14832289TMF1555
14429495GMF1552
14776690GMF1554
23366812GMF1571
 楼主| 发表于 2018-8-12 22:39 | 显示全部楼层
看一下这些点位的情况,哪些有突变的


SNP2803242GA148952831668AA148966924203GA1489717425417GA149097399476CMF154914264476CMF155114637315CMF155314832289TMF155514429495GMF155214776690GMF15542336681 ...
双头鹰 发表于 2018-8-12 13:13


除了第1,3,4 是正的,其余全负。
看来我不是2657下面的,可能是平级的。
测序质量不高也有可能,这个我就不是很懂了。
发表于 2018-8-12 23:20 | 显示全部楼层
我觉得还是 2657下面的,很有可能是 A14985下面的,C-A14985*吧,A14896这个位点很有可能不是A14985等价的,有可能是YFULL错了,是A14985下面的位点
 楼主| 发表于 2018-8-12 23:58 | 显示全部楼层
我觉得还是 2657下面的,很有可能是 A14985下面的,C-A14985*吧,A14896这个位点很有可能不是A14985等价的,有可能是YFULL错了,是A14985下面的位点
大凌河 发表于 2018-8-12 23:20


是的,我看错了。
如果是A14895,那必然是cts2657下面的。如果cts2657的一些位点没有测到,那一定是测序问题。
发表于 2018-8-13 13:44 | 显示全部楼层
是的,我看错了。
如果是A14895,那必然是cts2657下面的。如果cts2657的一些位点没有测到,那一定是测序问题。
一统浆糊 发表于 2018-8-12 23:58

你很可能是A14909,你看一下这些A14909等价点位的情况

17425417GCA14909
17913745TCA14912
22618490GTA14919
17714832TAMF1548
 楼主| 发表于 2018-8-14 08:37 | 显示全部楼层
本帖最后由 一统浆糊 于 2018-8-14 08:38 编辑
你很可能是A14909,你看一下这些A14909等价点位的情况

17425417GCA1490917913745TCA1491222618490GTA1491917714832TAMF1548
双头鹰 发表于 2018-8-13 13:44


非常感谢毛兄。

现在我已经确定自己是C-Y13673。即C2(原C3)南支-cts2657-A14985-A14909-Y13673。


Yquanxu上Y13673列有4个SNP:TM19264934,TM23453064,Y13673,TM19370348。 我全部是阳性,确凿无疑,在结难逃。


Yquanxu上Y13673之下有一个可能比较晚近的支系,增加了23个SNP。即FGC24136支系。我只有TM15824454是阳性,FGC24136和SK756不知道位点信息。


在我确定是阳性的突变中,90%测出都是阳性。说明是我的确不是FGC24136。我确定应该是一个Y13673之下与FGC24136平行并且共享TM15824454的支系。
发表于 2018-8-14 15:46 | 显示全部楼层
53# 一统浆糊 那你是Y13673*,和完颜小王分开有6000年了。
 楼主| 发表于 2018-8-14 21:11 | 显示全部楼层
知道FGC24136和SK756的位点信息么?
 楼主| 发表于 2018-8-14 21:13 | 显示全部楼层
53# 一统浆糊 那你是Y13673*,和完颜小王分开有6000年了。
双头鹰 发表于 2018-8-14 15:46


金国墓的DNA有最终结果了,是A14985?
发表于 2018-8-14 21:17 | 显示全部楼层
56# 一统浆糊
不是古DNA,只是一名满族完颜网友的结果,他是A14912的下游
 楼主| 发表于 2018-8-14 22:05 | 显示全部楼层
53# 一统浆糊 那你是Y13673*,和完颜小王分开有6000年了。
双头鹰 发表于 2018-8-14 15:46

也不是说是Y13763*,应该是TM15824454*。
发表于 2018-8-14 22:05 | 显示全部楼层
大神,这两天霸屏了!
 楼主| 发表于 2018-8-15 01:38 | 显示全部楼层
大神,这两天霸屏了!
清秋 发表于 2018-8-14 22:05


不好意思这几天说多了。

事实上除了大方向没错之外(最可能 是一个不是M407但比较接近的支系),从STR预测我的SNP的给出具体支系名的全都错了。

事实上是因为我这一支人太少,没有可以参考的STR。只记得在一份济宁的上千人的数据中,有几个跟我17STR比较接近,最近的一个也相差3个点。可能这几个人都是A14985下面的。
您需要登录后才可以回帖 登录 | 注册

本版积分规则

小黑屋|手机版|Archiver|人类生物学在线 ( 苏ICP备16053048号 )

GMT+8, 2018-12-14 23:10 , Processed in 0.129203 second(s), 15 queries .

Powered by Discuz! X3.4

© 2001-2017 Comsenz Inc.

快速回复 返回顶部 返回列表