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Mos4&Mos5:7000年前阿穆尔细石器猎人对东亚各民族的潜在血统影响

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发表于 2018-6-17 11:25 | 显示全部楼层 |阅读模式
本帖最后由 Yungsiyebu 于 2018-6-20 13:46 编辑

尝试将7000年前阿穆尔河流域的Mos5细石器猎人,在admixture的supersived模式下,设置为“pure”,并以华中地区苗族和西伯利亚极北部雅库特设置为参照系,考察三种模拟始祖成分对今天东亚地区人群的血统影响。请注意,admixture算法,请关注相对值,pure是不真正存在的。

merge样本包括hgdp的东亚和东北亚地区样本。结果如下:

一、西南地区彝族、纳西族的类mos5血统信号极为微弱,西北地区的蒙古语族土族也很弱,而东北亚阿尔泰语系诸民族则普遍很强。

二、日本值得关注,类雅库特、类苗族的血统因素都很微弱(有一个样本可能编号有问题,请忽略,其他计算器计算接近美洲人),而表现为近于单纯的类Mos5血统成分。

三、南北汉族的区分主要表现为类雅库特血统,北方普遍有一定比例,南方则普遍信号很弱。类Mos5血统在北方平均在1/5上下,南方更低一些,一些样本缺失信号。
Mos5_east_north.png
发表于 2018-6-17 13:23 | 显示全部楼层
这不就是以前老生常谈的东西,东亚人遗传三分的现象。南北东西。南方以苗为代表似乎不够准确,用傣族更好一些。
 楼主| 发表于 2018-6-17 15:13 | 显示全部楼层
这不就是以前老生常谈的东西,东亚人遗传三分的现象。南北东西。南方以苗为代表似乎不够准确,用傣族更好一些。
hercules 发表于 2018-6-17 13:23

尽管从体质特征上,东亚腹地新石器时代古人跟现代任何一个民族都相差万里,但在东亚现代民族中找一个最少受南方、北方、西北方影响的族群,我想,苗族仍然为最理想的模型。
发表于 2018-6-17 20:54 | 显示全部楼层
用supervised 设置参考人群的,感觉总有点主观选择的问题。

这些算法不知道有没有按照等遗传距离来分人群的算法。
具体这些算法好像都是把巨量的数据按某几个参考人群压缩,如果选的参考人群不一样,这个结果还是有差异的。

有没我懂这些算法的讲一下。

最好有不用选参考人群的直接根据遗传距离聚类分析的算法,这样就不主管
 楼主| 发表于 2018-6-17 21:48 | 显示全部楼层
用supervised 设置参考人群的,感觉总有点主观选择的问题。

这些算法不知道有没有按照等遗传距离来分人群的算法。
具体这些算法好像都是把巨量的数据按某几个参考人群压缩,如果选的参考人群不一样,这个结果还是 ...
skyyrie 发表于 2018-6-17 20:54


unsupervised版本:

http://www.ranhaer.com/viewthread.php?tid=37703

两种算法均有意义,unsupervised得到的pure样本,也不是真的pure。
发表于 2018-6-17 23:05 | 显示全部楼层
unsupervised版本:

http://www.ranhaer.com/viewthread.php?tid=37703

两种算法均有意义,unsupervised得到的pure样本,也不是真的pure。
Yungsiyebu 发表于 2018-6-17 21:48




他这个unsupervised 具体不知道怎么算的,需要搞清楚
 楼主| 发表于 2018-6-18 11:45 | 显示全部楼层
Mos4的遗传结构类似,对于携带类mos4血统的样本,要比mos5平均高3-5%。
Mos4_east_north.png

Mos5_Mos4_compare_east_north.txt

35.25 KB, 下载次数: 12

 楼主| 发表于 2018-6-28 22:27 | 显示全部楼层
加入东北亚隔绝族群的样本,Mos5代表的古东北亚人表现出与现代东北亚更强的相似性,与日本的差距出现,而此时出现在东亚普遍的POP,与西伯利亚极北POP的Fst数值最低,最接近.



类东亚类西伯利亚极北类阿穆尔


Pop0Pop1Pop2
类东亚Pop0


类西伯利亚极北Pop10.126

类阿穆尔Pop20.1580.157
类乌拉尔Pop30.1580.1410.169
Mos5_compare.png

Mos5_compare.4.xlsx

20.35 KB, 下载次数: 9

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