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东南亚前农业时代古DNA:Ma911&La368

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发表于 2018-8-20 10:10 | 显示全部楼层 |阅读模式
本帖最后由 Yungsiyebu 于 2018-8-20 10:36 编辑

The prehistoric peopling of Southeast Asia
http://www.ebi.ac.uk/ena/data/view/PRJEB26721

首先提取Bam文件中的23andme位点信息,并上传gedmatch,Ma911: M777094,看一下各种流行计算器的结果。如Harappa。

数据下载:http://www.ranhaer.com/thread-38456-1-1.html

Iadmix,以Hapmap基因频度为参照系,跑出来的结果如下:~30%非洲马萨人成分,其它为类华南和类日本。


YRI:0.0000

CHB:0.0000

CHD:0.3921

TSI:0.0000

MKK:0.2946

LWK:0.0000

CEU:0.0000

JPT:0.3134
Ma911-Harappa.png

Iadmix.Ma911.input.ancestry

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发表于 2018-8-20 13:11 | 显示全部楼层
Iadmix,以Hapmap基因频度为参照系,跑出来的结果如下:~30%非洲马萨人成分,其它为类华南和类日本。

YRI:0.0000

CHB:0.0000

CHD:0.3921

TSI:0.0000

MKK:0.2946
...
Yungsiyebu 发表于 2018-8-20 10:10

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    小云老师表现不错,昨日我一提醒你,今天你就跑一次,真是部队好战士,呵呵

     不过还是需要提醒你,你的近30%的‘非洲成分’肯定是唔啱’的,因为我之前多次提醒你,要掌握全面选取不同的族群样品参照,不然就会‘张冠李戴’,就像你之前多次在本版贴出的运算结果所出现的那种情况~

  关于田园洞古人的‘非洲成分’,我之前在本坛多次提及并有展示,你这次再次展示,正好可以印证。

      就像我之前多次提及的,亚欧与非洲之间的基因交流一直未曾中断,不过随着亚欧大陆农业逐步完全成熟,人口急剧膨胀,这样,来自非洲的基因输入就显得微不足道了。   不过尽管如此,我们依然可以在3千年前的东南亚地区观察的到~
imvivi001 发表于 2018-8-19 14:15
 楼主| 发表于 2018-8-20 13:21 | 显示全部楼层
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    小云老师表现不错,昨日我一提醒你,今天你就跑一次,真是部队好战士,呵呵

     不过还是需要提醒你,你的近30%的‘非洲成分’肯定是唔啱’的,因为我之前多次提醒你,要掌握全面选取不同的族群样品参照 ...
imvivi001 发表于 2018-8-20 13:11

这是方法问题,因为儿子侄子决定不了爸爸的种系,分析方法要倒置。
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