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楼主: imvivi001

我认为的全球各地成分的正确分类

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 楼主| 发表于 2018-9-20 09:21 | 显示全部楼层
和平古人还有Papuan成分吧,就是30#楼色谱图上特意划圈的黑色成分。很有意思,如果去掉东亚成分(绿&粉),和平古人很像Onge。
w_howard 发表于 2018-9-20 08:02
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      更准确的说,是类巴布亚成分或古南东亚成分,因为onge人群的丹人成分似乎不算太高,回头再去查查
发表于 2018-9-20 15:39 | 显示全部楼层
今天我在30#楼的色谱图中,发现了一个ghost,然后我心中的诸多疑团豁然开朗!哈哈!
其实也不是什么新发现,很可能就是imvivi01常说的aEE。
发表于 2018-9-20 17:24 | 显示全部楼层
也许之前有过类似的讨论,但我没有看到,我只管把我的思路一口气讲完!

一直有个疑问,Onge的三种成分是怎么形成的?先后顺序如何?Onge有三种成分,蓝色ASE,黑色类Papuans,暗紫色Jehai或称古华南、古孟高棉。今天忽然发现,如果去掉蓝色ASE,那么剩下的黑+紫色成分就变成了一个ghost魔鬼,色谱图中无处不在!黑色:紫色比例大约1:1,暂时简称黑紫人群。(很可能对应imvivi001说的aEE,他还特意修改迁徙路线图,把ASE独立出去。)

先看古印度土著,蓝色ASE把黑紫人群等比例压缩成一个窄条,这说明黑紫人群曾广泛分布在印度次大陆,后来ASE强势入侵,只保留了少量黑紫成分。为什么说黑紫人群来的更早,因为黑色类Papuans与丹人是衔接的。而在ASE到来之前,黑色与紫色已经长时间深度混合了。

再看东部的南岛族群(Ami、泰雅和igonot为代表)就更神奇了。上面一排低K值时,可以区分出黑色和紫色,但下面几排K值升高后,黑色和紫色却不见了,几乎变成了纯粉色。咋回事?

这个问题一直困扰着我,几乎失去了对色谱图的信任。后来受以前帖子的启发,终于想通了。因为黑紫色与粉色之间的遗传距离一定非常接近,当低K值时,算法强制把相近的成分拆分成多种颜色,当K值升高后,因为引入了遗传距离更远的参照物,所以算法认为没必要再区分粉色和黑紫色,于是就全部归类为粉色。而印度土著的ASE遗传距离与黑紫人群较远,所以不会有颜色合并的现象。




这也说明一个重要问题,Ami与黑紫人群非常相似!很可能只是分离时间太久,各自有了少量基因突变。我们东亚人的原型,可能就是这些黑紫人群。

《史前东南亚人群起源》一文中,有一个qpGraph源流图,说Ami有79%的基因来源于Onge,把ASE去掉后的Onge成分,差不多就剩下70%。

可惜这些黑紫人群长啥样,已经无从推测了,因为几万年时间里,他们变成了粗密黑直的头发,蒙古褶厚眼帘,肤色也变浅了……
发表于 2018-9-20 19:13 | 显示全部楼层
37# lll
你指的东南是哪里?福建?浙江?还是江苏?其实这些省份ASE少更有可能是跟来自北方人群不断的影响有关,从新石器晚期华东人群就已经受到北方影响开始逐渐偏向北方了。
发表于 2018-9-20 19:21 | 显示全部楼层
43# w_howard
可以看到在K值低的第一幅图当中,东北亚人群的紫色(达斡尔,赫哲,日韩)还是要比东亚其他人群低了不少的,联系到东北亚人的蒙古人种特征更显著,我觉得紫色成分或黑+紫可能跟东亚南部一些非典型蒙古人种性状有关,比如湿耳垢和双眼皮。估计这个黑紫人群最早的长相很可能跟绳纹柳江甄皮岩之类的差不多。
发表于 2018-9-20 20:45 | 显示全部楼层
本帖最后由 lll 于 2018-9-20 20:50 编辑

44# MNOPS 不仅是中国大陆的东南部,连台湾土著阿美族和泰雅族也是几乎没有,而台湾土著保留了近100%的EAS2成分,几乎没有来自黄河流域的EAS1成分
发表于 2018-9-20 20:47 | 显示全部楼层
本帖最后由 lindberg 于 2018-9-20 20:48 编辑
也许之前有过类似的讨论,但我没有看到,我只管把我的思路一口气讲完!

一直有个疑问,Onge的三种成分是怎么形成的?先后顺序如何?Onge有三种成分,蓝色ASE,黑色类Papuans,暗紫色Jehai或称古华南、古孟高棉。今 ...
w_howard 发表于 2018-9-20 17:24

这个问题一直困扰着我,几乎失去了对色谱图的信任。后来受以前帖子的启发,终于想通了。因为黑紫色与粉色之间的遗传距离一定非常接近,当低K值时,算法强制把相近的成分拆分成多种颜色,当K值升高后,因为引入了遗传距离更远的参照物,所以算法认为没必要再区分粉色和黑紫色,于是就全部归类为粉色。而印度土著的ASE遗传距离与黑紫人群较远,所以不会有颜色合并的现象。


很受教啊,阁下的话堪称看图利器!

虽然不完全同意贵看法,但提供了方法论,也是很赞的!
发表于 2018-9-20 20:59 | 显示全部楼层
本帖最后由 lll 于 2018-9-20 21:00 编辑
37# lll
你指的东南是哪里?福建?浙江?还是江苏?其实这些省份ASE少更有可能是跟来自北方人群不断的影响有关,从新石器晚期华东人群就已经受到北方影响开始逐渐偏向北方了。
MNOPS 发表于 2018-9-20 19:13
有时候并不是因为靠近北方ASE成分就会少,这个图中印巴人群高频的蓝色或许和ASE有很大关系,Onge和和平古人也有这种蓝色成分,而北方的达乌尔族、赫哲族、土族都有一些蓝色的成分,反倒是东南部的苗族、畲族、土家族、台湾的阿美族、泰雅族没有此蓝色成分,或许ASE曾经通过河西走廊来影响部分北方人群
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发表于 2018-9-20 23:21 | 显示全部楼层
43# w_howard
可以看到在K值低的第一幅图当中,东北亚人群的紫色(达斡尔,赫哲,日韩)还是要比东亚其他人群低了不少的,联系到东北亚人的蒙古人种特征更显著,我觉得紫色成分或黑+紫可能跟东亚南部一些非典型蒙 ...
MNOPS 发表于 2018-9-20 19:21

我觉得黑紫人群形成的时间很早,后来ASE才到来,那时黑紫人群还没有东亚人群的典型特征,比如头发、肤色和眼帘等,这些特征的形成以前有过比较充分的讨论,都是后期基因变异的结果。所以我不认为黑色或紫色决定这些东亚相貌特征。

具体到达斡尔、赫哲等族群,他们的色谱图中有明显的蓝色成分,形成过程应该比Ami复杂了。
发表于 2018-9-20 23:22 | 显示全部楼层
很受教啊,阁下的话堪称看图利器!

虽然不完全同意贵看法,但提供了方法论,也是很赞的!
lindberg 发表于 2018-9-20 20:47

我后面有些推论确实有些仓促,我会继续研究的。
发表于 2018-9-21 00:48 | 显示全部楼层
49# w_howard
蓝色成分更有可能代表着一种西欧亚成分,印巴和北亚都受到过一定程度的西欧亚影响。
发表于 2018-9-21 02:23 | 显示全部楼层
51# MNOPS 南欧亚成分就是一种由东欧亚和西欧亚混合形成的成分,本身就与西欧亚成分有很大的关联
发表于 2018-9-21 09:23 | 显示全部楼层
49# w_howard
蓝色成分更有可能代表着一种西欧亚成分,印巴和北亚都受到过一定程度的西欧亚影响。
MNOPS 发表于 2018-9-21 00:48

蓝色是ASE,我是听imvivi001说的,我好像被他洗脑了,哈哈!
发表于 2018-9-21 09:27 | 显示全部楼层
51# MNOPS 南欧亚成分就是一种由东欧亚和西欧亚混合形成的成分,本身就与西欧亚成分有很大的关联
lll 发表于 2018-9-21 02:23

现在问题是偏偏北方的达斡尔、赫哲出现了蓝色ASE(古南欧亚),就比较费解了。
发表于 2018-9-21 09:45 | 显示全部楼层
本帖最后由 lll 于 2018-9-21 10:08 编辑

54# w_howard ASE南欧亚成分就是由西欧亚和东欧亚成分混合形成的,有可能形成于南亚,北方的达乌尔、赫哲族、土族的南欧亚成分应该是从中亚过去的
发表于 2018-9-21 09:56 | 显示全部楼层
本帖最后由 lll 于 2018-9-21 09:59 编辑

54# w_howard 在genetiker的k=17的数据中,达乌尔族有少量的蓝绿色中东成分,赫哲族确实有部分样品有少量绿色的南欧亚成分,土族有很稳定的绿色成分,这种绿色成分在孟加拉人中极为高频
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发表于 2018-9-21 09:58 | 显示全部楼层
东南部的苗族、汉族、畲族、土家族则没有这种绿色成分
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 楼主| 发表于 2018-9-21 10:36 | 显示全部楼层
蓝色是ASE,我是听imvivi001说的,我好像被他洗脑了,哈哈!
w_howard 发表于 2018-9-21 09:23 ?

  .
      看来你还没有完全理解ADM算法。在某些情况下(如低k值或西方族群种类较少),西亚欧成分会统归为一类,用一种颜色表示。
发表于 2018-9-21 10:52 | 显示全部楼层
也许之前有过类似的讨论,但我没有看到,我只管把我的思路一口气讲完!

一直有个疑问,Onge的三种成分是怎么形成的?先后顺序如何?Onge有三种成分,蓝色ASE,黑色类Papuans,暗紫色Jehai或称古华南、古孟高棉。今 ...
w_howard 发表于 2018-9-20 17:24
这个k值不知道是按什么原则规划的?按我以前的理解,就是k值越高,参与比对的参照物越多,看来还是想错了。
发表于 2018-9-21 11:14 | 显示全部楼层
感觉基因学家很想模拟人类历史上血统混合的真实进程。

比如说K值加大,会出现几种颜色合一的情况,是不是代表了某个历史阶段一个新的原始人群的产生。

虽然可能效果不见得如此,但感觉还是很想逼近这个效果,不过也需要更大量的数据、更广泛的测试范围和测试来源。
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