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单倍群C在全球的分布揭示人类出非洲的早期历史以及定居东亚的过程

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发表于 2010-5-9 09:43 | 显示全部楼层 |阅读模式
Journal of Human Genetics advance online publication 7 May 2010; doi: 10.1038/jhg.2010.40

Global distribution of Y-chromosome haplogroup C reveals the prehistoric migration routes of African exodus and early settlement in East Asia
Hua Zhong1,2,5, Hong Shi1, Xue-Bin Qi1, Chun-Jie Xiao3, Li Jin4, Runlin Z Ma2 and Bing Su1


Abstract
The regional distribution of an ancient Y-chromosome haplogroup C-M130 (Hg C) in Asia provides an ideal tool of dissecting prehistoric migration events. We identified 465 Hg C individuals out of 4284 males from 140 East and Southeast Asian populations. We genotyped these Hg C individuals using 12 Y-chromosome biallelic markers and 8 commonly used Y-short tandem repeats (Y-STRs), and performed phylogeographic analysis in combination with the published data. The results show that most of the Hg C subhaplogroups have distinct geographical distribution and have undergone long-time isolation, although Hg C individuals are distributed widely across Eurasia. Furthermore, a general south-to-north and east-to-west cline of Y-STR diversity is observed with the highest diversity in Southeast Asia. The phylogeographic distribution pattern of Hg C supports a single coastal ‘Out-of-Africa’ route by way of the Indian subcontinent, which eventually led to the early settlement of modern humans in mainland Southeast Asia. The northward expansion of Hg C in East Asia started ~40 thousand of years ago (KYA) along the coastline of mainland China and reached Siberia ~15 KYA and finally made its way to the Americas.

发表:http://www.nature.com/jhg/journa ... abs/jhg201040a.html
附件:
http://www.nature.com/jhg/journa ... abs/jhg201040a.html

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发表于 2010-5-9 09:45 | 显示全部楼层
恭喜昆明所啊,終於發出來了
 楼主| 发表于 2010-5-9 09:47 | 显示全部楼层
有新的STR数据,这个我喜欢。

原文我这里下载不到,请polyhedron 帮忙下载刊出的PDF.
我想这应该是基于那篇硕士论文的,但是最终可能修改过很多地方。
发表于 2010-5-9 09:50 | 显示全部楼层
强!这是我一直期盼的论文,对我的古亚洲mtDNA研究会有很大的帮助。
 楼主| 发表于 2010-5-9 10:31 | 显示全部楼层
本帖最后由 ranhaer 于 2010-5-9 10:35 编辑

摘要大意:

详尽地研究了Y-SNP单倍群C的分布。结果显示,尽管分布很广泛,单倍群C的各个下游单倍群有不同的分布,都经历过长时间的隔离。在东亚,大致按照自南向北,自东向西的一个扩散过程。单倍群C的系统发育结构支持经由印度洋海岸的走出非洲模式,是早期定居东亚的现代人父系单倍群。单倍群C在东亚向北的扩散,开始于约4万年前,沿海岸线迁徙并在约1.5万年的时候到达西伯利亚,并最终到达美洲西北部。
 楼主| 发表于 2010-5-9 10:39 | 显示全部楼层
云南大学谭思杰硕士论文的摘要:

Y染色体多态性与东亚人群的遗传结构

Y染色体多态性与东亚人群的遗传结构

     群体的遗传结构因其在人群起源和进化上的应用而受到广泛关注。Y染色体非重组区具有严格父系遗传、有效群体小等优点而成为用来研究群体的遗传结构的有效标记,为人群起源和进化提供遗传学上的证据。东亚地区人群的起源和进化目前已经有较多的研究,但还存在很大争议。利用Y染色体标记对东亚人群进行系统的研究可为解决这些争论提供遗传学上的证据。
    本研究采集了来自东亚地区36个少数民族群体的1365份男性无关个体样本,利用PCR-RFLP和DNA测序的方法对东亚现代人常见的单倍群C-M130下的10个特征双等位基因位点进行基因分型,按照最新的Y染色体系统树定义单倍群。
     结果发现,单倍群组C-M130在东亚地区的平均频率为13.3%,其中在北方组中频率达到了20.7%,是南方组9.30%的二倍多。
     根据M130下各位点的基因分型结果,可以将所有样本定义为三个单倍群C*-M130、C3*-M217和C3c-M48。
    其中祖先单倍群C*-M130只在南方地区检测到,C3*-M217的呈现了南北两个分布中心,而C3c-M48只分布在东北以及西伯利亚地区。
     在基于Y-STRs的数据构建的各单倍群NETWORK系统树也在南方的样本内也观察到了较大的变异,其多态性高于北方。利用SNPs-STRs相结合的遗传学分析手段,估算东亚地区单倍群C3*-M217起源时间范围在30,000-37,000年之间,而单倍群C3c-M48的起源时间在15,000年左右。 总之,Y染色体单倍群C的基因地理分布和Y-STRs的分析结果表明该单倍群从南方进入东亚地区,进而支持东亚人群的南方起源观点。现代人在30,000年前到达东亚南部,在距今15,000年左右向北方扩张,群体在南、北方各自的扩张事件造成了东亚遗传结构南北差异的格局。

http://konglong.5d6d.com/thread-3722-5-6.html
 楼主| 发表于 2010-5-9 10:40 | 显示全部楼层
现在C3下分辨到这种程度了,1958还会不会考虑有更大的阴谋在里面呢?

http://konglong.5d6d.com/viewthread.php?tid=7672&extra=&page=1
发表于 2010-5-9 13:29 | 显示全部楼层
本帖最后由 polyhedron 于 2010-5-9 13:36 编辑

纔注意到,這裏面北方漢的C真高啊,北方漢全都在10%以上,山西19%,遼寧22%。而漢人裏幾乎完全沒有C3c。不過樣本也不是太大。
发表于 2010-5-9 13:34 | 显示全部楼层
 楼主| 发表于 2010-5-9 14:10 | 显示全部楼层
C3c的网络图不是很清晰。我有时间的时候,会加上新的数据,再画一遍。
发表于 2010-5-9 14:45 | 显示全部楼层
C3*的支系繁杂,细化工作远远不够。旧石器时代沿海迁徙的由南至北的路线不成问题,但我坚信肯定还有一条由北至南的路线伴随着细石器工业由北向南传播。除了要注意到沿海人群的C3比例较高之外,藏彝走廊路线上的很多人群比例也不低。
 楼主| 发表于 2010-5-9 15:37 | 显示全部楼层
14# 反恐精英

主题文献和我提到的硕士论文,并不完全是同一组数据,请看清楚主题文献。
发表于 2010-5-9 15:44 | 显示全部楼层
回13楼

文中说的是“分布中心”。

从str网络结构上看,有两个c3*中心一步的支系,其原始性在北汉和藏-缅,支系广泛分布在南汉和苗瑶等人群,估计为华北细石器文化人群演藏彝走廊南下的结果。
发表于 2010-5-9 15:46 | 显示全部楼层
4万年前开始在东亚向北扩散,看来 C 出非洲的时间确实很早,李辉估计的10万年左右是比较准确的。
反恐精英 发表于 2010-5-9 15:25


从非洲到东亚走了6万年? ;PP
发表于 2010-5-9 16:36 | 显示全部楼层
呵呵,小反总能带来快乐,逻辑傻的可爱,笑死了~ 多看一两眼文献中的其他文字而不是只是看其中喜欢

的一句话。是至少1.5万年,推测的依据是,缺失于南方的C3c有1.5万年的起源背景。
发表于 2010-5-9 16:46 | 显示全部楼层
问个问题,c什么时候诞生的啊,现在又新数据吗
发表于 2010-5-9 16:47 | 显示全部楼层
4万年前C开始在东亚扩张,1.5万年前才到达北亚,这么一段路走了约2.5万年,那么C从非洲走到东亚花了6万年有什么可奇怪
反恐精英 发表于 2010-5-9 16:20

出非洲的時候是M168, 還沒有C, C的起源地應該是在印度或東南亞。
发表于 2010-5-9 16:52 | 显示全部楼层
小反向来感觉良好,所以我们一直也不用担心今后笑料的源头会断,呵呵。
发表于 2010-5-9 17:09 | 显示全部楼层
24# natsuya
C就是指包括C的祖先在内的这一支出非洲人群,这下行了吧。说“C”不是简洁一些嘛
反恐精英 发表于 2010-5-9 17:00


小反的意思说,CF分离的年代超过10万年,呵呵。
发表于 2010-5-9 17:47 | 显示全部楼层
27# Yungsiyebu

你理解错了,才说完你就忘了,是C的祖先与F的祖先分离10万年了
反恐精英 发表于 2010-5-9 17:25


看,我说小贩只要一直感觉良好,包袱也就不断吧?恐坛有富了。呵呵。
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