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2000年前蒙古北部Egyin Gol河谷的匈奴时代古代DNA:mt & Y-STR

Am. J. Hum. Genet., 73:000, 2003
Nuclear and Mitochondrial DNA Analysis of a 2,000-Year-Old Necropolis in the Egyin Gol Valley of Mongolia
Christine Keyser-Tracqui et al.
Abstract
DNA was extracted from the skeletal remains of 62 specimens excavated from the Egyin Gol necropolis, in northern Mongolia. This burial site is linked to the Xiongnu period and was used from the 3rd century B.C. to the 2nd century A.D. Three types of genetic markers were used to determine the genetic relationships between individuals buried in the Egyin Gol necropolis. Results from analyses of autosomal and Y chromosome short tandem repeats, as well as mitochondrial DNA, showed close relationships between several specimens and provided additional background information on the social organization within the necropolis as well as the funeral practices of the Xiongnu people. To the best of our knowledge, this is the first study using biparental, paternal, and maternal genetic systems to reconstruct partial genealogies in a protohistoric necropolis.
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"Although the mtDNA sequences obtained could not be assigned with certainty to mtDNA haplogroups (since they encompassed only the HVI of the control region), three (A, C, and D) of the four major haplogroups observed in Native American (Torroni et al. 1993) and Siberian (Starikovskaya et al. 1998; Schurr et al. 1999) populations were detected in the ancient samples tested (with haplogroup D being the most prevalent). A few sequences belonging to subclusters B4b, D5 or D5a, F1b, J1, G2a, U2 or U5a1a—and some that probably belonged to cluster M—were also observed (Richards et al. 2000; Yao et al. 2002). No member of the major European cluster H, which occurs in >40% of most European populations (Richards et al. 1996) was found. Interestingly, some of the haplotypes reported here are similar to those found in previous studies of the area (Kolman et al. 1996; Comas et al. 1998)."
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"A majority (89%) of the Xiongnu sequences can be classified as belonging to an Asian haplogroup (A, B4b, C, D4, D5 or D5a, or F1b), and nearly 11% belong to European haplogroups (U2, U5a1a, and J1). This finding indicates that the contacts between European and Asian populations were anterior to the Xiongnu culture, and it confirms results reported for two samples from an early 3rd century B.C. Scytho-Siberian population (Clisson et al. 2002)."

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当时明月在,曾照彩云归
这篇文献在我们的"人类学讨论区"中,被讨论得相当广泛.

根据Y-STR推断的Y-SNP:

A组:公元前300年左右,父系可能为E3b或C3,J2的26号其母系mtdna没有成功提取;父系可能为西欧亚I1的28号和36号,前者为东欧亚的D、后者为东欧亚的A。 其他为东欧亚的A、C、D、G,以及西欧亚的J一例。

B组:公元前200年-公元100年,此组成功提取的样本最多,主要为东欧亚常见的A、B、C、D、F,以及少量西欧亚常见的U、J。对比Y-dna,很可能父系为西欧亚J2的57号母系为东欧亚D;很可能父系为西欧亚R1a的70号、72号、73号其母系也都为东欧亚D;父系为东欧亚N的84号母系mtdna没有成功提取;父系美洲Q的92号其母系为东欧亚M;很可能为父系南亚L的95号其母系为西欧亚U。

C组:公元200年,Y-DNA据说都可能为C,母系成功提取的为东欧亚的C、D。

图为Yungsiyebu的标注.
mtDNA in egyin gol.jpg
当时明月在,曾照彩云归
Y-SNP测试6例,有3例有结果---Elizabet Petkovski的法文博士论文P114:


Polymorphismes ponctuels de séquence et identification génétique: étude par spectrométrie de masse MALDI-TOFPETKOVSKI, Elizabet (2006) Polymorphismes ponctuels de séquence et identification génétique: étude par spectrométrie de masse MALDI-TOF. Thèses de doctorat, Université Louis Pasteur.
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RésuméL'investigation des polymorphismes du génome humain permet d'identifier les individus avec certitude et d'établir des relations de parenté. L'étude des polymorphismes ponctuels de séquence (SNP) présente un réel intérêt dans les domaines de la médecine légale et de l'anthropologie moléculaire. En effet, les SNP autosomaux réunissent les avantages des méthodes appliquées aujourd'hui et permettent d'atteindre un haut pouvoir discriminant à partir d'échantillons dégradés par l'analyse de fragments d'ADN courts. Nous avons sélectionné 50 SNP autosomaux et une différence de séquence entre les copies du gène de l'amélogénine porté par les gonosomes. La définition de cet ensemble de marqueurs est un travail original tant d'un point de vue quantitatif, menant à un pouvoir de discrimination élevé, que d'un point de vue qualitatif, ne considérant que des marqueurs non codants en accord avec la législation française en vigueur. Les marqueurs ont été étudiés par détection des produits d'extension allèles spécifique d'amorce par spectrométrie de masse MALDI-TOF. L'étude d'un échantillon de la population française a permis de fournir des informations sur la distribution allélique de ces marqueurs, de valider l'ensemble des SNP sélectionnés comme outil pour la filiation et l'identification génétique et de développer une méthode d'analyse directe, sensible et rapide permettant l'analyse simultanée d'un grand nombre de molécules de manière reproductible. L'analyse des marqueurs bialléliques validés représente un outil complémentaire à celle des microsatellites dans le cadre d'échantillons fortement dégradés tels qu'ils sont fréquemment rencontrés sur les scènes de crimes ou lors de catastrophes de masse. La définition d'un protocole de routine permettra d'introduire cette technique basée sur les marqueurs SNP au niveau des laboratoires d'identification génétique.
Type d'EPrint:Thèse de doctorat
Informations complémentaires:8,11 Mo
Sujets:UNERA Classification UNERA > DISC Discipline UNERA > DISC-16 Sciences de la vie et de la santé, psychologie
UNERA Classification UNERA > ACT Domaine d'activité UNERA > ACT-2 Bio-industries, biotechnologies
CL Classification > DDC Dewey Decimal Classification > 500 Sciences de la nature et mathématiques > 570 Sciences de la vie. Biologie > 576 Génétique et évolution > 576.5 Génétique
Code ID:496
Mise en ligne:29 Mai 2006
Y-SNP egyin gol xiongnu.jpg
当时明月在,曾照彩云归
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