返回列表 回复 发帖

靑島漢族的mtDNA

本帖最后由 Anthro 于 2015-5-28 11:46 编辑

Mitochondrial DNA copy number, but not haplogroup is associated with keratoconus in Han Chinese population

Abstract

Oxidative stress may play a role in the pathogenesis of keratoconus (KC). Mitochondrial DNA (mtDNA) is closely related to mitochondrion function, and variations may affect the generation of reactive oxygen species (ROS) and be involved in the pathogenesis of KC. To test whether mtDNA background and copy number confer genetic susceptibility to KC in the Han Chinese population, we performed this association study. We analyzed mtDNA sequence variations in 210 KC patients and 309 matched individuals from China, and classified each subject by haplogroup. Mitochondrial DNA copy number was measured in a subset of these subjects (193 patients and 103 controls). Comparison of matrilineal components of the cases and control populations revealed no significant difference. However, measurement of mtDNA copy number showed that KC patients had significantly lower mtDNA copy numbers than controls (P = 0.0002), even when age, gender, and mtDNA background were considered. Our results suggest that mtDNA copy number, but not haplogroup, is associated with keratoconus, and may contribute to its pathogenesis.

http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0014483515000238   
Mitochondrial DNA copy number, but not haplogroup is associated with keratoconus in Han Chinese population

Abstract

Oxidative stress may play a role in the pathogenesis of keratoconus (KC). Mito ...
Anthro 发表于 2015-2-11 10:21
1) B的比例不如预期的高,奇怪

Distribution.png
2015-2-11 10:45


2) 不全是青岛样本。有泰安样本等
很类波的种系?在眯缝眼人群里相对较独特?

13168311_235408.jpg
2015-2-11 10:53


002564c0c0ac0ec41e9e1f.jpg
2015-2-11 10:55
3# snelheid
没觉得类波,起码鼻根不低陷,鼻翼不宽,鼻孔较小。另外眼部化妆太过,根本看不清原来的特点。
青岛这种山东沿海地区,又是近代的殖民地城市,外来人口是很多的,跟省会济南相比差别很大。
NRY: O2a1c1a1a1a1a1a1-002611,F11,F17,F856,F1495(源自粤西云浮)
mtDNA:B4d1(源自浙北慈溪)
百越人的人类学文集 http://blog.sina.com.cn/baiyueren
3# snelheid
没觉得类波,起码鼻根不低陷,鼻翼不宽,鼻孔较小。另外眼部化妆太过,根本看不清原来的特点。
baiyueren 发表于 2015-2-11 11:08
眉骨呢?眼裂形态呢?

U4885P841DT20101207175819.jpg
2015-2-11 11:22


6554391838068161477.jpg
2015-2-11 11:22
青岛这种山东沿海地区,又是近代的殖民地城市,外来人口是很多的,跟省会济南相比差别很大。
不好意思,这种特征我在吉林人里见过。不是“近代的殖民”吧

>>跟省会济南相比差别很大。

有多大?近代有多少“外来殖民”?你说的是五口通商时期的那两三撮人?

区别是当然有,但顶多不外乎同省范围内非典型冀鲁和非典型胶辽的区别,还有什么?

济南青岛
19.32%110.58%
28.57%26.55%
38.07%36.32%
46.95%46.26%
52.91%53.69%
62.82%62.55%
72.64%72.41%
82.59%82.35%
91.75%92.16%
101.65%102.14%
111.63%111.59%
121.53%121.47%
131.47%131.40%
141.30%141.31%
151.30%151.09%
161.20%161.03%
171.20%171.03%
180.99%181.02%
190.95%190.99%
200.92%200.99%
210.84%210.97%
220.79%220.94%
230.70%230.92%
240.68%240.91%
250.65%250.90%
260.64%260.85%
270.63%270.79%
280.58%280.76%
290.56%290.76%
300.56%300.70%


你说的“外来移民”在何处?河北枣强 vs 成都铁碓臼 +“云南”乌撒卫?从上表你能看出多少“乌撒卫”成分?“云南”人不会把母系也迁去了吧。泰安可没有“云南”人
我在网上见过有人用哈尔滨人比沈阳白皙高挑论证沈阳人山东河北等“侉“成分多,而黑龙江“东北亚”土著成分多,真是无语了。
4# baiyueren

典型冀鲁(如保定和滨州)的田、董、崔、冯、曹、魏等姓,典型胶辽(如烟台东部和威海大部)的于、姜、宋、曲、吕、宫等姓的排名和比例确实分别比这两个城市要高

但从整体看来,这两个城市的冀鲁、胶辽架子还是放在那里,“外来移民”的比例并不特别大。上表非常明显,五口通商时期的外来移民几乎可忽略不计,现代的外来移民无非也就鲁西南移民,别的没了。没你说的那么夸张
我在网上见过有人用哈尔滨人比沈阳白皙高挑论证沈阳人山东河北等“侉“成分多,而黑龙江“东北亚”土著成分多,真是无语了。
yingchuan 发表于 2015-2-11 12:00
这个还真没看出来。从现有基于Y-STR的PC图以及基于姓氏构成及源流的综合指标来看,辽宁中西部(阜新这些地方)和河北东北部的西欧亚成分应当显著多于黑龙江大中城市

但辽宁南部(如大连等地)西欧亚成分确实非常低。他们跟山东沿海类似(大连农村没辽中那么多关、佟这类东北官话特征姓氏。更多的是曲(鞠)、宫、隋、栾、迟、毕、牟、丛、原、战、衣、初、冷、矫等“东夷”类胶辽官话特征姓氏),更接近典型东亚,而很少有西欧亚成分。当然比南方还是高一些

黑龙江大城市主要还是关内移民为主,没看出有多少“土著”成分。土著大多在乡下。哈尔滨市区肯定比沈阳市区要更近“关内”,也更接近山东。哈尔滨市区的于、姜、曲等山东沿海特征大姓排名更高,孙姓也领先赵姓,宋对韩的劣势也更小(农村则宋更是领先韩,但不是所有农村),更近山东沿海。而沈阳则反过来,赵多于孙,韩明显领先宋,更接近河北辽西土著。“盛京”的关、白、金、佟、宁、付、包等姓以及大姓中的赵(很多满族归化)、吴(很多蒙古族归化)等的比例也要高于哈尔滨,而不是他们想象中的反过来。另外,东北三省都是越靠近西侧土著成分越多,而不是越靠北越多。首先是东西差异而不是南北差异
恩,我在沈阳时候的亲戚、同学、朋友里曲(鞠)、宫、隋、栾、迟、毕、牟、丛、战、冷这几个姓全见过,到上海后只遇到过一个姓栾的同学,祖籍还是苏北的。另外你说的辽中西部西欧亚成分较高包括锦州葫芦岛吗?河北东北部是指关内唐山秦皇岛等地还是关外承德那边?
恩,我在沈阳时候的亲戚、同学、朋友里曲(鞠)、宫、隋、栾、迟、毕、牟、丛、战、冷这几个姓全见过,到上海后只遇到过一个姓栾的同学,祖籍还是苏北的。
yingchuan 发表于 2015-2-11 13:09
我在这个帖子里说过,这些人祖籍几乎都是辽南的。或者直接来自胶东

论“典型”分布区和源头,他们都不是土著
辽足的曲乐恒,虽然是沈阳人,但其实祖籍大连。天津的曲波,其实祖籍山东烟台黄县(龙口)。

二曲都是胶辽官话区的人。
雄镇散人 发表于 2013-2-8 16:22
“盛京”的关、白、金、佟、宁、付、包等姓
这里的宁貌似原来是汉旗?清初的宁完我。
另外你说的辽中西部西欧亚成分较高包括锦州葫芦岛吗?
yingchuan 发表于 2015-2-11 13:09
我说的不严密吧,我指的西更偏指阜新、朝阳一带的东蒙结合部,而不是西南部。不过这不妨碍整个冀辽交汇区都是高西欧亚成分区
到上海后只遇到过一个姓栾的同学,祖籍还是苏北的。
yingchuan 发表于 2015-2-11 13:09
栾菊杰江苏南京人。但姜姓栾氏的典型势力范围还是在山东沿海一带。齐公卿
河北东北部是指关内唐山秦皇岛等地还是关外承德那边?
yingchuan 发表于 2015-2-11 13:09
整个滦河流域都是吧
论“典型”分布区和源头,他们都不是土著
snelheid 发表于 2015-2-11 13:12
同理,于、姜、曲的典型分布区是胶辽官话区,但这并不妨碍于姜在东北官话区同样算是大姓,曲姓在东北官话区同样算较常见姓。只是高频和更高频、首位和更首位的区别。这类特征姓氏在东北官话区的首位度要低于胶辽官话区,但高于包括冀鲁官话区在内的所有其他地方。典型案例如东北的于姓、林姓比例低于山东胶东半岛,但高于山东全省平均(林姓在北方其他地区整体低频或罕见,但偏偏就是在威海全境、烟台东部和东三省不算罕见。福建妈祖文化北上胶东并向东北扩散的结果。山东、辽宁的林姓大部分是靠威海、烟台、大连三市支撑起来的比例。演员林青霞等人都是这一地区人)。这是因为东北一带并不是只有胶辽移民,也有大量的鲁中、冀东等地移民。被冀鲁官话低“于”区中和后的结果

姜姓除了胶辽和东北,北方其他地区都是小姓。于姓除了胶辽、东北和冀东,其他地区也都是小姓。宋姓主要在华北东半部,扩张半径大一些,当然主力极值点还是在胶辽官话区
“盛京”的关、白、金、佟、宁、付、包等姓
这里的宁貌似原来是汉旗?清初的宁完我。
yingchuan 发表于 2015-2-11 13:14
你是说此间的Ningguta Hala改的寧(Níng。注意繁体不能写作“甯”,“寧古塔”改的“寧”Níng氏跟汉族的“甯”Nìng氏是两码事)也是汉旗吗?

汉族的“甯”字已经成为独立的姓氏专用汉字,收入简体字库,跟江苏安徽沿江个别地区以及浙江个别地区可偶见的“於”氏不同于“邘”->于氏一个道理。五四遗毒
疾病组和对照1组可以合并,没有统计学差异,只是线粒体数量有差异。总样本接近~400,有高变区raw data,不错。2组是本研究的合并组,1组来自另一篇文献,样本量~50例。
山东2500,2000到现代青岛组的变化,从开始接近新石器时代黄河中下游古代族群,向接近西北和长城沿线地区族群的区间演化。

西欧亚类型比例2.04%。因为缺少明确的1/32、1/16、1/8欧亚混血儿样本,常染色体水平估算华北地区人群西欧亚混血比例很困难,目前常用的K7b程序等,是将北京组、华南组、丹佛市华人组的西欧亚混血比例计算为零(这显然是不可能的),然后得出的欧亚混血比例,汉族极少1%。有一位自述1/16混血儿样本K7b得出来的值是0.83%,缺少更多样本比例。

我估计华北汉族常染色体西欧亚混血比例1-5%,是比较合理的。


28Qingdao Han J069 126 145 222  261 73 295 309+CC  315+C 462 489
177Qingdao Han J069 126 186 193  519 73 152 263 295 462
161Qingdao Han R0304263 309+CC 315+C
175Qingdao Han H6362 482 239 263 315+C
72Qingdao Han HV8311 354 263 315+C
JK190Qingdao Han W223 292 519 73 93 189 194 195 204  207 263 309+C 315+C
QK86Qingdao Han HV311 354 519 73 94 146 263 309+C  315+C
JK149Qingdao Han J069 126 145 261 73 185 263 295 309+CC  315+C
qingdao mtdna pca.jpg
新技术方案尝试:低覆盖全基因组,最低成本深度解析父系源流,略有成效,大家一起摸索。微博@基因人王冰 QQ群:387100816。
6# yingchuan
一个自卑的南蛮才会变出一个侉字,笑而不语!
返回列表
baidu
互联网 www.ranhaer.org