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原奥瑞文化人群, mtDNA of the Protoaurignacian

本帖最后由 Ryan 于 2015-10-31 09:48 编辑

Science 15 May 2015:Vol. 348 no. 6236 pp. 793-796 DOI: 10.1126/science.aaa2773

The makers of the Protoaurignacian and implications for Neandertal extinction

S. Benazzi1,2,*, V. Slon3, S. Talamo2, F. Negrino4, M. Peresani5, S. E. Bailey2,6, S. Sawyer3, D. Panetta7, G. Vicino8, E. Starnini9,10, M. A. Mannino2, P. A. Salvadori7, M. Meyer3, S. Pääbo3, J.-J. Hublin2

The Protoaurignacian culture is pivotal to the debate about the timing of the arrival of modern humans in western Europe and the demise of Neandertals. However, which group is responsible for this culture remains uncertain. We investigated dental remains associated with the Protoaurignacian. The lower deciduous incisor from Riparo Bombrini is modern human, based on its morphology. The upper deciduous incisor from Grotta di Fumane contains ancient mitochondrial DNA of a modern human type. These teeth are the oldest human remains in an Aurignacian-related archaeological context, confirming that by 41,000 calendar years before the present, modern humans bearing Protoaurignacian culture spread into southern Europe. Because the last Neandertals date to 41,030 to 39,260 calendar years before the present, we suggest that the Protoaurignacian triggered the demise of Neandertals in this area.                     

全文:
http://www.sciencemag.org/content/348/6236/793.full
人类之子全都是为死而生。
              --------《阙特勤碑》
貌似铲形门齿。
Bombrini tooth, Protoaurignacian.gif
人类之子全都是为死而生。
              --------《阙特勤碑》
The Fumane2 mitochondrial genome falls within the variation of modern humans (Fig. 2) and basally in haplogroup R (table S6), as also observed for the ~45,000-year-old AMH specimen from Ust’-Ishim [in western Siberia (26)], a major group of related mtDNAs in Eurasia (27)intowhichmostpreagricultural mtDNAs in Europe fall (28).
人类之子全都是为死而生。
              --------《阙特勤碑》
人类之子全都是为死而生。
              --------《阙特勤碑》
欧洲古人的基因组数据,隔些日子就能出一个啊,这进展远超国内啊。

793.full.pdf (776.07 KB)

新技术方案尝试:低覆盖全基因组,最低成本深度解析父系源流,略有成效,大家一起摸索。微博@基因人王冰 QQ群:387100816。
137x 倍,这个质量够高,覆盖量非常强,mtdna R。擦,线粒体dna数据格式倒来倒去,玩的不顺,否则亲自跑跑数据,据说4.5万年前的西伯利亚古人是pre-B组合,田园洞也是pre-B,文献建的树是田园洞和这个欧洲样本关系更近一些,而西伯利亚古人更远,这个有意思。
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貌似铲形门齿。
Ryan 发表于 2015-10-30 19:24
很弱的铲形
NRY: O2a1c1a1a1a1a1a1-002611,F11,F17,F856,F1495(源自粤西云浮)
mtDNA:B4d1(源自浙北慈溪)
百越人的人类学文集 http://blog.sina.com.cn/baiyueren
proto应翻译成原更好,pre翻译为前。两者概念不同,哥伦布前的北美印第安人可称为前美国人,同时期英格兰人可称为原美国人。欧洲早期现代人有前奥瑞纳和原奥瑞纳两种。故而区分开更好。
O3a3c* (M134+, M117-)
8# hercules
谢谢指正,已修改。



这篇文章除了描述这个古DNA之外,还重点讨论了现代人迁至欧洲与尼人灭绝之间的关联。因为之前有学者怀疑,Protoaurignacian(原奥瑞那文化)是尼人创造的考古文化。此文章正好处在 4万年前后这段时间。这一时段现代人来到欧洲,尼人也广泛存在。现代人创造的这个Protoaurignacian(原奥瑞那文化),并不比尼人的文化进步很多。对此,文章的结论认为,现代人迁入欧洲,是尼人灭绝的直接诱因之一。
人类之子全都是为死而生。
              --------《阙特勤碑》
本帖最后由 Yungsiyebu 于 2015-10-31 18:13 编辑
We thus conclude that the Fumane 2 individual

carried amitochondrial genome of amodern

human type. This shows that this individual was

a modern human or had at least some ancestors

who were modern humans.




话说的好含蓄,让人浮想联翩,这颗牙齿解剖学特征还是更接近尼安德特人。结果mtdna测试结果是R,那么,全基因组如何呢,期待。


The tooth crown has a MD diameter of 5.9 mm (minimum estimation due to wear) and a BL diameter of 5.5 mm (Table S1). At the cervix, MD is 4.2 mm and BL is 4.9 mm. The computed Z-score for BL crown diameters shows that Fumane 2 is closer to the Neandertal mean (Table S1).

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本帖最后由 Yungsiyebu 于 2015-10-31 18:32 编辑

这个类型怎么看都像是跟田园洞和UST样本一样,都是Pre-B啊!最近接近的样本是Banshan 11所代表的B系现代及新石器时代样本,文献描述现代比对样本为“54 present-day humans”,理论上应当包含各种R,聚类图未见欧洲样本,应当是就是最接近B,为Pre-B可能性很大。
All expected mutations for this haplogroup (73G, 263G, 750G, 1438G, 2706G, 4769G,

7028T, 8860G, 11719A, 14766T and 15326G) were found in the Fumane 2 genome. The

three remaining mutations (5585A, 16129A and 16304C) are known polymorphisms

which are not associated with haplogroup R.

Fumane.jpg
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这个4.1万年前的奥瑞纳文化人牙齿发现于Grotta di Fumane (western Lessini
Mountains, Italy)。我查了一下,是在意大利北部、阿尔卑斯山南麓的维罗纳地区一个主要的古生物化石出土地点。
要真是pre-B那就搞笑了!因为欧洲奥瑞纳文化人群一般被认为是属于克罗马农人及形态上接近克人的史前欧洲人文化。

Lessini.png
2015-12-9 11:56
NRY: O2a1c1a1a1a1a1a1-002611,F11,F17,F856,F1495(源自粤西云浮)
mtDNA:B4d1(源自浙北慈溪)
百越人的人类学文集 http://blog.sina.com.cn/baiyueren
本帖最后由 baiyueren 于 2016-1-8 20:45 编辑

之前对意大利南部两具2.3和2.5万年历史克罗马农人遗骨检测结果是:一具的母系属于HV or pre-HV,一具属于N*。看来mt-N* & R*在中亚和西欧的扩张也有至少两波之多。

4fb8a26144be9e449d56f.jpg
2016-1-8 20:45
NRY: O2a1c1a1a1a1a1a1-002611,F11,F17,F856,F1495(源自粤西云浮)
mtDNA:B4d1(源自浙北慈溪)
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