返回列表 回复 发帖

跑了跑,gedmatch

比论坛里几个闽台籍网友偏南一些,多一些西欧亚的成分,美洲的成分......
worlld9.JPG
world22.JPG
punt k12.JPG
world.JPG
k13JPG.JPG
k12b.JPG
k7b.JPG
2

评分次数

楼主的K12b比我更远东一些(类日本),缺少了西伯利亚的北极成分。
闽民系基因交流群 209955432
M117交流群 O2a2b1a1-M117 7425996
M8母系群 585843910
R父系基因研究交流群 543365293
Y-高通量发布 271838550
郑氏基因交流群 574991236

附上和人群的接近程度,8个计算器,4个最接近Han,1个最接近naxi,1个最接近yizu,1个最接近Han_chinese,1个最接近tujia..........看来,我比较偏西南......
dv3_rel.JPG
k7b_rel.JPG
k12_rel.JPG
k12b_rel.JPG
k13_rel.JPG
world_rel.JPG
world9_rel.JPG
world22_rel.JPG
想问一下,这几个图中设置的参照标准是哪些?
3# 无诸王 恭喜兄台,加入西南
没啥事
QQ截图20160913131511.png
2016-9-13 13:15

QQ截图20160913131519.png
2016-9-13 13:15
没啥事
litis的gedmatch也贴出来看看呗呗
7# 无诸王 刚刚有事出门了。还不太熟悉该怎么用,工具太多了。你用的哪一个?
另外注意把kit number打个码吧,这样不太好。。
没啥事
本帖最后由 无诸王 于 2016-9-13 13:58 编辑

xxx heritage下的dedocad下的k7b和k12b是论坛通用的标准好像,不用打码,发布之前,就把kit number对应的genome删掉
本帖最后由 litis 于 2016-9-13 19:35 编辑

9# 无诸王 我弄到另外一个帖子了。
没啥事
K7b折算,北方血统,在以往几例福建样本的下限,接近广东样本。

样本东方血统南北比例
No.北(鄂伦春)南(傣族)
福建汉族2920.3879.62
广东汉族4113.1486.86
福建汉族7125.1274.88
广东梅州汉族7413.7186.29
广东韶关汉族  外婆福建8316.1483.86
江西汉族8421.7478.26
福建汉族8524.0375.97
广东梅州汉族9020.479.6
福建汉族10020.1479.86
新技术方案尝试:低覆盖全基因组,最低成本深度解析父系源流,略有成效,大家一起摸索。微博@基因人王冰 QQ群:387100816。
老永要是能直接注明网友名字就好了。
K7b折算,北方血统,在以往几例福建样本的下限,接近广东样本。

       样本    东方血统南北比例    No.  北(鄂伦春)  南(傣族)    福建汉族  29  20.38  79.62    广东汉族  41  13.14  86.86    福建汉族  ...
Yungsiyebu 发表于 2017-1-13 19:03
K7b.png
2018-1-2 15:05


我是济南人,山东+山西
Admix Results (sorted):

#PopulationPercent
1East_Asian76.50
2Siberian21.29
3West_Asian1.34


Finished reading population data. 223 populations found.
7 components mode.

--------------------------------

Least-squares method.

Using 1 population approximation:
1 Naxi_HGDP @ 2.859164
2 Yizu_HGDP @ 3.167749
3 Korean_Dodecad @ 5.145256
4 Naga_Metspalu @ 7.207039
5 JPT30_Behar @ 7.532046
6 Japanese_HGDP @ 8.075626
7 CHB30_Metspalu @ 8.205142
8 Chinese_Dodecad @ 8.752164
9 Japanese_Dodecad @ 9.445940
10 Tu_HGDP @ 10.923648
11 Tujia_HGDP @ 13.045659
12 Han_HGDP @ 15.281797
13 CHD30_Metspalu @ 15.421812
14 Miaozu_HGDP @ 17.945866
15 CHS30_SGVP @ 19.491108
16 Mongola_HGDP @ 19.800190
17 She_HGDP @ 20.194014
18 Lahu_HGDP @ 22.461250
19 Xibo_HGDP @ 22.517376
20 Garo_Chaubey @ 24.674875

Using 2 populations approximation:
1 50% CHS30_SGVP +50% Mongola_HGDP @ 1.074589


Using 3 populations approximation:
1 50% Chinese_Dodecad +25% JPT30_Behar +25% Tu_HGDP @ 0.864660


Using 4 populations approximation:
+++++++++++++++++++++++++++++++
1 CHS30_SGVP + Tu_HGDP + Tujia_HGDP + Xibo_HGDP @ 0.858037
2 Chinese_Dodecad + Chinese_Dodecad + JPT30_Behar + Tu_HGDP @ 0.864660
3 CHS30_SGVP + CHS30_SGVP + Hezhen_HGDP + Tu_HGDP @ 0.864660
4 CHS30_SGVP + Hezhen_HGDP + She_HGDP + Tu_HGDP @ 0.864660
5 CHS30_SGVP + Korean_Dodecad + Korean_Dodecad + Tu_HGDP @ 0.864660
6 CHB30_Metspalu + Chinese_Dodecad + JPT30_Behar + Tu_HGDP @ 0.901802
7 Chinese_Dodecad + Chinese_Dodecad + Japanese_HGDP + Tu_HGDP @ 0.901802
8 Han_HGDP + Miaozu_HGDP + Tu_HGDP + Xibo_HGDP @ 0.903757
9 She_HGDP + Tu_HGDP + Tujia_HGDP + Xibo_HGDP @ 0.903757
10 CHD30_Metspalu + Miaozu_HGDP + Tu_HGDP + Xibo_HGDP @ 0.914679
11 Mongola_HGDP + She_HGDP + She_HGDP + Xibo_HGDP @ 0.922172
12 Hezhen_HGDP + She_HGDP + She_HGDP + Tu_HGDP @ 0.933235
13 Korean_Dodecad + Korean_Dodecad + She_HGDP + Tu_HGDP @ 0.933238
14 CHB30_Metspalu + CHB30_Metspalu + JPT30_Behar + Tu_HGDP @ 0.935134
15 CHB30_Metspalu + Chinese_Dodecad + Japanese_HGDP + Tu_HGDP @ 0.935134
16 Hezhen_HGDP + Miaozu_HGDP + She_HGDP + Tu_HGDP @ 0.944938
17 Korean_Dodecad + Korean_Dodecad + Miaozu_HGDP + Tu_HGDP @ 0.944939
18 CDX30_1000Genomes + CHD30_Metspalu + Xibo_HGDP + Xibo_HGDP @ 0.958335
19 CDX30_1000Genomes + Han_HGDP + Xibo_HGDP + Xibo_HGDP @ 0.958335
20 Miaozu_HGDP + Tu_HGDP + Tujia_HGDP + Xibo_HGDP @ 0.963183
感觉您应该是南亚成分带入的西欧亚和非洲。
Dodecad K7b Admixture Proportions


The K7b admixture calculator is courtesy of Dienekes Pontikos and was developed as part of the Dodecad Ancestry Project; more information here.

K7b is an update of the eurasia7 calculator. It has been built on exactly the same dataset as K12b but at a lower (K=7) level of detail.

Kit Number: Z623272   Elapsed Time: 1.85 seconds


Population         
South_Asian        -   
West_Asian        -   
Siberian        18.63
African        1.19
Southern        0.69
Atlantic_Baltic        1.34
East_Asian        78.14

Dodecad K12b Admixture Proportions


The K12b admixture calculator is courtesy of Dienekes Pontikos and was developed as part of the Dodecad Ancestry Project; more information here.

Kit Number: Z623272   Elapsed Time: 3.35 seconds


Population         
Gedrosia        -   
Siberian        2.90
Northwest_African        1.28
Southeast_Asian        28.70
Atlantic_Med        0.29
North_European        0.99
South_Asian        -   
East_African        -   
Southwest_Asian        -   
East_Asian        64.89
Caucasus        -   
Sub_Saharan        0.95

这是我的
返回列表
baidu
互联网 www.ranhaer.org