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这篇文章里有几个新测现代人基因组数据值得挖掘一下。

文章是A High-Coverage Genome Sequence from an Archaic Denisovan Individual,关心的人也不多,估计是因为该讨论的早已讨论过了。supplementary data里有一组现代人和建人基因组数据对比,很惊艳。说说惊艳之处,一是几个新测现代人和建人是同一批次,用了同一,也是最新的测序技术。而以前的测序结果,你也可以看出来,质量不是很高,同时系统性偏差也可能存在。二是,以前测序结果公布时,也会有与已有的数据对比。但是只对比基因组上snps差异,而这次对比时还考虑到突变点的homo-和hetero-的差异,经过这一修正后,原先隐藏的规律立即浮现。
这么好的数据居然论坛上没人注意到,我也是在查找田园洞文章里数据的时候追查到这里的。先上图,手机截图,看不清可以直接看原文。页码截图里有。
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这里数据的规律性相当明显,我以前看测序结果对比时从来没见过有这么规律的。说说这里的整齐之处:法国人(应是巴黎人,当然巴黎人来源也很杂)和撒丁人,距离巴布亚人一样远,距离汉人差不多一样,距离傣族人差不多一样。汉人(应是北京人,但北京人也不简单)和傣族人,距离巴布亚人差不多远,距离法国人差不多,距离撒丁人还是差不多。尤其是汉傣和法撒,四条距离都差不多,这很难说是偶然形成的。加上上面这一条条,说明,这就是基因世界的真实体现。而且这完全符合现实世界的观感。
好了,现在可以发掘这里的有意思之处。首先,在出非洲人里,西欧人与巴布亚人差异最大。而汉人傣人和亚马逊土著卡里提亚那人介乎其间。这是排除了杂交的模型所不能解释的。排除杂交模型就应该是汉傣和法撒这样的分布。汉人接近巴布亚人可以,你离欧洲人应该和巴布亚人一样远。反过来也是一样,你总不能离巴布亚人没离欧洲人远,离欧洲人又没有离巴布亚人那么远。这说明,在汉傣卡人的祖先身上发生了杂交事件,在西欧人与巴布亚人分化之后,两支又有部分融合到一起形成了蒙古人种的汉傣卡的祖先。
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同样的事情又发生在巴西亚马逊土著Karitiana人身上。该土著是上世纪才从丛林中被现代人发现的与世隔绝的部落。该土著距离汉人傣人和法人撒人,小于汉傣和法撒之间的距离。很显然,除了个别人,我们知道,美洲土著形成时,是西欧亚人和蒙古人种融合来的。不特卡人如此,哪怕是挖掘出来的完全不用担心现代人混血的美洲古人也是如此。不过仔细看,卡人离巴黎人略近一点,而影响拉美的南欧人应该更接近撒丁人。这就排除了近代以来的混血,说明美洲土著的西方血统更靠北一点。
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由于数据非常简单,准确计算混血比例是不可能的。不过有个简单的估计方法,拿汉巴法来说,查找三个差异是600,587,616。616-600=16,616-587=29,汉傣祖先人群形成时西欧亚贡献了16/45,澳美人提供了剩下的。这就使得汉人还是更接近巴布亚人。
用这个估算方法估算美洲土著的西方血统,这一值为14%。是所有已发表数据中最小的。一方面固然是因为这是毛估。另一方面,我对有些人动辄40%47%的贡献率不感冒。不可能有这么高的。综合一下20%的比例还是可以接受的。
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美洲土著介于蒙古人种和西欧人之间。相当多的文章已经证明其西方血统来自ANE。我不知道无视ANE的西欧亚血统的人还能当多长时间的鸵鸟。
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