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我的结果和额金河匈奴58、59两例F1b完全一致~ 16189C, 16232A, 16249C, 16291T, 16304C, 16311C
新技术方案尝试:低覆盖全基因组,最低成本深度解析父系源流,略有成效,大家一起摸索。微博@基因人王冰 QQ群:387100816。
什么叫“问题不大”呢?永谢布既然知道南方F1b很少,为什么认定是“新石器时代之后从北方向南迁徙”。还有永谢布是否分析过HVI数据,是否支持F1b的南方类型是北方类型的下游分支呢?
baiyueren 发表于 2011-3-18 11:18
这个北我指西伯利亚,南也不一定南到长江以南。
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F1d是个很独特的类型,它在尼泊尔thuras人中的出现证明那里的M117确实是很早就和中国大陆的M117分离了。如果f1b的年龄估计不错的话,那么它确实有可能来源于贝加尔湖边的新石器人群,然后其中的部分人又被阿尔泰系的北亚人同化,然后随着部分北亚人群的南下又进入中国和朝鲜。
这个工作没白做,刚刚接到poly博士通知,我的也mtdna也测了一部分,16189C, 16232A, 16249C, 16291T, 16304C, 16311C ,我还没去匹配,poly判断F1b。先贴出来。

P.S. 老鲜同学啊,我算是跟你干上了!
Yungsiyebu 发表于 2011-3-18 10:45
我的mt应是F1d,HVR-II区估计是有146的,不是F1b,与F1b(232, 249, 311)的最近共祖年代也得推到F1b'd从F1b'd'e下游某个点分化出来的那时候。
我对诸位动辄万年以上的云里雾里,没兴趣,F1b高频见于shorian塔塔尔最高43%,Kets24%,巴什科尔人14%,图瓦8%+,布里亚特5%,而东亚很少见,古代DNA见于egyin gol匈奴4例,而西伯利亚目前已知最早的新石器文化古代d ...
Yungsiyebu 发表于 2011-3-18 11:09
绍尔人、哈卡斯人里高频的F1*-16189应是“漂”出来的。多样性不高。

而且不是F1b,而应是F1*-16189或F1d,具体要看高变II区和编码区的情况。

无非是早期的(好像是Release 8之前?)系统树里没有分出F1d,所以和(232 249 311)定义下的F1b被合并在了一起,而事实上那些早期paper里的不带232 249 311的“F1b”其实都是F1b'd'e下的其他子类。但是新的F1b定义位点出来后像F1d这种就独立了。
绍尔人、哈卡斯人里高频的F1*-16189应是“漂”出来的。多样性不高。

而且不是F1b,而应是F1*-16189或F1d,具体要看高变II区和编码区的情况。

无非是早期的(好像是Release 8之前?)系统树里没有分出F1d, ...
雄镇散人 发表于 2011-3-18 14:09
mtdna关注的不多,抽空,我把f1b的资料汇总分析一下。
新技术方案尝试:低覆盖全基因组,最低成本深度解析父系源流,略有成效,大家一起摸索。微博@基因人王冰 QQ群:387100816。
F1d是个很独特的类型,它在尼泊尔thuras人中的出现证明那里的M117确实是很早就和中国大陆的M117分离了。如果f1b的年龄估计不错的话,那么它确实有可能来源于贝加尔湖边的新石器人群,然后其中的部分人又被阿尔泰系的 ...
wolfgang 发表于 2011-3-18 12:50
隔了一小时,终于又能发帖了。

你错了,F1d并不是什么独特的类型。中国大陆普遍都有低频的存在。藏区门巴人(只是不清楚是仓洛/墨脱门巴还是错那门巴?)里的F1b'd'e应主要就是F1d,除了汉族外,西南的彝族、纳西族、拉祜族等藏缅系民族以及部分苗瑶系民族,甚至东南亚的老挝人里也存在F1d的某些分支,还有西北甘青地区的回族土族等,还有闽西客家人,四川成都人,山西人,山东青岛人、日本人等,比如Tanaka2004里的两例。以前提过一次了。

无非是中国在线粒体的很多子领域普遍落后于日本、蒙古,乃至印度等国,很多细化都要比别人晚一拍,所以很多中国人写的文献里F1d都被隐藏在了F1b下或者F1*下罢了(它与中国很多老文献里的F1b是包含关系,不是平行关系。实际上老文献里的所谓老版F1b,等于新树定义下的F1b+F1d+F1b'd'e*+F1e)。日本的F1e早已细分到F1e1下游型了,中国的paper连F1e到现在都还在很多论文里只被归入F1*等,而F2b也往往被并隐藏在F*里了。
老鲜发个帖子不容易啊,呵呵。忍不住,先到本人博客聊着,然后转过来。

我汇总一下数据,弄个F1b的科普简图。
http://hi.baidu.com/%CD%E4%D4%C2 ... 58b4fbf01f36d3.html
新技术方案尝试:低覆盖全基因组,最低成本深度解析父系源流,略有成效,大家一起摸索。微博@基因人王冰 QQ群:387100816。
28# 雄镇散人
我对各种单倍群的最新细化不了解,看来弄错时间对象了。
老鲜发个帖子不容易啊,呵呵。忍不住,先到本人博客聊着,然后转过来。
我汇总一下数据,弄个F1b的科普简图。
http://hi.baidu.com/%CD%E4%D4%C2 ... 58b4fbf01f36d3.html
Yungsiyebu 发表于 2011-3-18 15:36
这些老文献里的F1b,大部分是包含F1d、F1b'd'e*和F1e等子类型的。前面说了,老文献的F1b=新定义中的F1b+F1d+F1b'd'e*+F1e,包括青海陶家寨的那4/29例F1b'd'e(含F1b、F1d等)。

最近的一篇东西很有意思,《Larger mtDNA than Y-chromosome differences between matrilocal and patrilocalgroups from Sumatra》里面有一例岛屿东南亚的F1e,这是我首次在文献中看到岛屿东南亚地区的F1b'd'e下游分支,你有时间可以整点资料,看看它们和大陆东南亚人群以及日本人群F1e*、F1e1等的匹配关系啊,呵呵。

总的来说,岛屿东南亚地区,除掉庞大的F1a及其下游分支(尤其是F1a1*、F1a1a、F1a4等)以外,包括可能与华南-大陆东南亚一线南迁的F3(F3a好像被划成R9a了?)、F4b等在内都是相对较低频,而F1xF1a从整体上来说则是极低频的,从分化时间和规模的角度来看,理论上说几乎可以完全排除印尼的这例F1e是其原生类型的可能性。这例F1e是否暗示晚近的大陆东南亚影响,也可以找些数据匹配和考察一下。
这些老文献里的F1b,大部分是包含F1d、F1b'd'e*和F1e等子类型的。前面说了,老文献的F1b=新定义中的F1b+F1d+F1b'd'e*+F1e,包括青海陶家寨的那4/29例F1b'd'e(含F1b、F1d等)。

最近的一篇东西很有意思,《Larg ...
雄镇散人 发表于 2011-3-18 16:06
我这次整理会加入HV-1高变区的数据,根据最新的树,能分型的我会尝试分一下型。
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看来老永父系母系都是纯种“新亚洲人”,呵呵
三界无安,犹如火宅。众苦充满,甚可怖畏
                            --------《法华经》
是以法从心生。名因法立
                      ------------《宗镜录》
F1d是个很独特的类型,它在尼泊尔thuras人中的出现证明那里的M117确实是很早就和中国大陆的M117分离了。如果f1b的年龄估计不错的话,那么它确实有可能来源于贝加尔湖边的新石器人群,然后其中的部分人又被阿尔泰系的 ...
wolfgang 发表于 2011-3-18 12:50
我觉得我画的图已经满清楚了。F1b‘d'e突变到F1b的路径上的中间类型,目前大部分出现在藏族,白族和普米族中。这些人群中也有真正的F1b。我画图的原始数据也已经给出了。大家最好还是看看原始数据。
F1b'd'e network.jpg
自问,于民于家何用?
http://www.ranhaer.com/viewthrea ... p;extra=&page=1

8#是我根据分布图和原始数据画的迁徙图。虽然缺日韩的数据,但我认为大致偏差不大,除了F1b'd'e的最初诞生地还是待定之外。
自问,于民于家何用?
《广西仫佬族Y染色体和mtDNA的遗传结构分析》

王晓庆1 , 王传超2 , 邓琼英1 , 李辉2 , 2012年

广西仫佬族Y染色体和mtDNA的遗传结构分析.pdf (687.6 KB)

线粒体有高变I区但无II区数据,无法判型:见到一例被标作"F1b"的高变I区为189 304的样本,应当是老标法下的F1b'd'e,故此应为F1d/F1e/F1b'd'e*中的一种。
中亚和兰银官话区的部分母系,不是与川西相关又是来自何处呢?

journal.pone.0103772.g005.png
2015-7-28 10:45
本帖最后由 xavierxh 于 2015-9-25 13:29 编辑

我觉得大家不都能太关注自己所在的线粒体类型,其实每个人可以更客观公正点。因为:1、我们相对于未来的人类,就像鱼类进化到两栖类再到爬行类时的唯一那条始祖鱼,我们可能就是那条鱼或者这条鱼的叔叔、远亲或者别的种类的鱼,我们依然为此高兴。2、我们最近的亲人比如奶奶或者儿子,他们的线粒体类型或许就是与我们差别很大的别的M或者N大系下的。3、中国人这么多年代的进化和混血,其实常染色体、X染色体的差异都缩得越来越小,优秀的基因团如智商的、体能的都在不断扩散,不同的大类线粒体一样都拥有这些优秀的基因团。4、欧洲人命名的字母代表线粒体不同进化阶段存在不合理性,这种不合理情况太多,举1个例子(括号里为始诞生年代):M东亚(60.6)-M7东亚(54.8千年)-M7a东亚(27.5)-M7a1东亚(18.9),R欧洲(59.1)-R0欧洲(38.8)-HV欧洲(27.1)-H欧洲(18.6)换成M7式的代表字母那应该是R欧洲(59.1)-R7欧洲(38.8)-R7a欧洲(27.1)-R7a1欧洲(18.6),就是说与M7a1诞生年代相近的H相当于R7a1。5、以字母代表线粒体的进化排序因为存在不合理性无法比较进化的快慢和智商进化的高低,同样的时间里非洲L3系各支系后代都在进化,比较进化的优劣势和进化快慢最重要的指标还是比较智商。
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