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本帖最后由 一统浆糊 于 2011-4-26 07:20 编辑

母亲姓翟,但这跟track MT的起源没有关系。
外婆去世得早,妈妈三岁时就走了,家里已经不是很知道外婆的上一辈了。
请妈妈问了他的表哥,唯一还知道上一辈的事情的,可惜晚了一点点,他已经有一些阿兹默了。
但基本上可以确定外婆的母亲也是附近村里的人,也就是说近百年之内我的母系没有什么奇怪的。
我曾想这个问题想了很久,以至于梦见去问早已过世的外公。他老人家说妈妈其实是他早年在海外留学时生的。其实他虽然是老革命,但非常local,没出过山东。
不过有个事情倒是真的,妈妈家里的人眼睛是黄色的,以至于她和她的兄弟从小被笑话成鞑子。我也从未注意过自己的眼睛,直到我去考架照,那黑妞要我填eye color,我说黑的,她说是黄的,最后被定为棕的。
现在非常相信自己是匈奴后裔了,不得不佩服自己以前在天涯国观上的预见。可见发贴一定要小心。

可能我还是要再确定一下自己的MT,我已经同意了索伦森将我的DNA用于研究,也就是说他们会去测我的MT,但的到现在还没在公开的DATA内发现自己的数据。
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八代贫农根正苗
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PS: 才注意要LS这是suerte是处女贴呀,有礼有礼!速儿贴?这么像成吉思汗他娘,蒙古人?
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母亲姓翟,但这跟track MT的起源没有关系。
外婆去世得早,妈妈三岁时就走了,家里已经不是很知道外婆的上一辈了。
请妈妈问了他的表哥,唯一还知道上一辈的事情的,可惜晚了一点点,他已经有一些阿兹默了。
但基 ...
一统浆糊 发表于 2011-4-26 06:57
幫看不懂的(相信有很多)人解讀一下:阿茲默應該是Alzheimer's disease(老年癡呆)的漿糊式縮寫。

你意思是說,你媽和你親舅舅其實可能是你姥爺去國外時候和未知的姥姥生出來的?如果是這樣,不妨去做一下23andMe看看常染的比例。或者也可以在你老家採一下理論上和你共享mt的血樣。
目前在復旦已經停止對外的收費服務,只做科硏項目。測試可以找源基因 www.yoogene.com 。
新浪微博@polyhedron
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谢谢,和蒙古人没关系,Suerte是一首歌的名字。mtDNA不一定只来自你母亲那边,也可能来自你奶奶那边,对吗?淄博好象有很多翟姓和王姓,我以前有同学那边的
suete童靬生物学基础要加强呀。MT只能从母亲传给子女,父亲是不会传下去的,也就是说奶奶的MT是不会传给孙子的。这是在本坛混基础的基础,切记切记。
本地是有不少翟姓,比如我外公一整个村。王姓实在没什么好说的,有中国人的地方就有很多。可能当年封的王过多过滥了。
另外要跟S童鞋共免的是:从几个人的来推测一个三百万人的大群体,非有大智慧不可。否则很容易犯已偏盖全,管中窥犳,以犁测海的毛病。

回POLY,阿兹默其实是这边老美这么念的,我语言学七窍通六窍,是不是听得不对也未可知。
那个海外神马的是个DREAM,可以无视,尽管我回想起来当时的梦境是去问外太公(姥姥的父亲)。
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本帖最后由 雄镇散人 于 2011-4-27 13:50 编辑
王姓实在没什么好说的,有中国人的地方就有很多。可能当年封的王过多过滥了。
一统浆糊 发表于 2011-4-27 13:11
王姓在两广--除90年代以后的广州以及现在的深圳勉强排入前十大姓之外--大部分县市都不入前十大甚至前十五大姓。在福建,王姓是第四~第八大姓。

举个典型的例子,直到现在,王姓在广东省中山市都很难排入前五十大姓。属于当地罕见姓氏。

整体来说,全国范围内王姓在两广最低,福建次低,这与北方地区王居第一或第二大姓(居第二大姓的情况下多数是少于张,少数是少于李)是构成鲜明对比的。

王姓在江浙也很集中,一般是第一或第二大姓(嘉兴、湖州东部、吴江除外,那里的前两大姓是张沈或沈张)。但是江浙王张多而李刘杨赵却很一般。李刘属于南北两头多(尽管就绝对数来说是一边倒的北多于南)、华中和西部地区也较多而华东较少的姓氏(但是刘姓在江淮属于大姓。此外刘在江西湖南,以及客家人里都是超级大姓。此外刘姓在西北的影响力是远低于华北东部的,这与李姓不同),赵属于北方型姓氏(北方的中西部尤占优势。但是在广西的一些地区也相当常见)而杨属于中北+西南型姓氏。
王姓在两广--除90年代以后的广州以及现在的深圳勉强排入前十大姓之外--大部分县市都不入前十大甚至前十五大姓。在福建,王姓是第四~第八大姓。

举个典型的例子,直到现在,王姓在广东省中山市都很难排入前五十 ...
雄镇散人 发表于 2011-4-27 13:16
这些我也大概略知一二,只是大概的说王姓分布之广。
鲜鱼没帮我仔细分析一下我的STR,反而在这儿浪费发贴数。不值得。
不多说了,省得又是灌水。
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远山劲松傲然孤独千秋万代一统浆糊
多谢指教,俺是门外汉,不过对这方面很有兴趣
这些我也大概略知一二,只是大概的说王姓分布之广。
鲜鱼没帮我仔细分析一下我的STR,反而在这儿浪费发贴数。不值得。
不多说了,省得又是灌水。
一统浆糊 发表于 2011-4-27 13:32
浆糊,不是我不帮你推测,一来坛子上STR达人也济济一堂,我不敢随便造次,二来目前掌握的C3的STR资料确实还不够全,细分度不高就算我分析了对你也没用。

现在只能说,从你的DYS388、DYS393来看可以基本排除C3-star cluster、C3c-M48的可能性,其实不考虑DYS388的话一些重量级位点(392 393 437 438 448,以及19 389I 390等)上与C3d-M407是有些共通的(当然DYS385b=16这个值是略微偏低的),但是因为你的388是13,这在目前我见过的M407里似乎没有(此外汉族本身也应该是有一些M407的),所以暂时只能笼统地说你应该还是汉族人里特有的C3*-M217+(star cluster- M48- M407-)的未定义分支的可能性最大。
1

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  • owen

根据最近加入的数据重新匹配一下,强烈建议一统同学测一下M407这个点,很像是C3d。
一统糊涂c3.jpg
新技术方案尝试:低覆盖全基因组,最低成本深度解析父系源流,略有成效,大家一起摸索。微博@基因人王冰 QQ群:387100816。
本帖最后由 Yungsiyebu 于 2011-5-12 20:56 编辑

很累,且没什么意义,追求准确性,多尝试几种不同的组合进行匹配,细致分析一下,就搞定了,搞一批本来就没什么规律可循的所谓规律,自己洋洋万字也讲不明白,更不可能有人看的所谓规律,无用功。
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PS:“拿一个点说事”的范围可以有很广,还要看怎么个“拿”法。

首先,3-STR中有2-STR匹配或者7-STR中有6-STR匹配,而独独差了个392,这种情况就和17-STR中有16-STR匹配,独独差了个392的情形完全没有可比性。虽然这两者都是永谢布所说的所谓“拿一个点说事”。理由不解释。

其次,理论上任何位点无论多么低变,突变随时可以发生,但是从概率上说,低突变率的点在群体中表现出比高突变率的点更大的多态性,这就是不正常的现象。这个时候,必须追加考虑SNP的情况。

其三,两个人“在某低变点(比如388)上差1”,跟两人“在所有位点里只在这个点上差了1”不是一回事。对于既测点总数偏少的情况,比如7差1低变点或者6差1低变点,这种情况下这两者共SNP的可能性甚至比两者差了好几个点时共SNP的可能性还低。更有可能距离更远而不是更近。理由不解释。

其四,即使同为低变点,也是要分级的,426、388、438这种点差1,跟437、448等点上差1,这两者仍然是有着质的区别而不仅仅是量的区别的。至于392、393,其性质介于两者之间。不懂的人永远看不懂这是什么意思。

思维方式差异太大。解释太累。我想平均智力水平以上的理科出身、且有STR匹配经验者都应该能悟透这里说的这几句话的意思。不赘。
1

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  • owen

一统兄这个有没有看了,格式转换的方法,可能有用
http://www.smgf.org/ychromosome/marker_standards.jspx
owen 发表于 2011-7-18 00:06
谢谢,没太仔细看,好在GENETREE的数据不需要怎么处理就直接可用。
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我的母系也能追溯到山东半岛,等结果看吧
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mzzk 发表于 2012-1-18 12:14
不知道这位兄弟测出没有。
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爸爸来访,俺又把奶奶的MT测了一下。峰图在此。先不多说,请感兴趣的童协看看是什么HAP.给大家练练手,如果能十分钟之内看出的就不用说了。

NN-MTF.ab1 (282.03 KB)

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把序列也贴上吧,万一有些同志不能看峰图。虽然极少情况下序列会有些不清楚的地方,但一般没有问题。

>NN-MTF_B11.ab1
NNNNNNNNNNNNNTNNNNNNNNNNNNNNNCTNNNNANNNNNNNNNNNNNNNNGGGGAAGCAGATTTGGGTACCACCCAAG
TATTGACTCACCCATCAACAACCGCTATGTATTTCGTACATTACTGCCAGCCACCATGAATATTGTACGGTACCATAAAT
ACTTGACCACCTGTAGTACATAAAAACCCAATCCACATCAAAATCCCCCCCCCATGCTTACAAGCAAGTACAGCAATCAA
CCTTCAACTATCACACATCAACTGCAACTCCAAAGCCACCCCTCACCCACTAGGATACCAACAAACCTACCCACCCTCAA
CAGTACATAGTACATAAAACCATTTACCGTACATAGCACATTACAGTCAAATCCCTTCTCGTCCCCATGGATGACCCCCC
TCAAATAGGGGTCCCTTGACCACCATCCTCCGTGAAATCAATATCCCGCACAAAAGTGCTACTCTCCTCGCTCCGGGCCC
ATAACACTTAAAAGTGGCTAAAGTGAACTGTATCCGACATCTGGTTCCTACTTCAGGGTCATAAAGCCTAAATAGCCCAC
ACGTTCCCCTTAAATAANACATCACGATGGATCACAGGTCTATCACCCTATTAACCACTCACGGGAGCTCTCCATGCATT
TGGTATTTTCGTCTGGGGGGTGTGCACGCGATAGCATTGCGAGACGCTGGAGCCGGAGCACCCTATGTCGCAGTATCTGT
CTTTGATTCCTGCCTCATCCCATTATTTATCGCACCTACGTTCAATATTACAGGCGAACATACTTACTAAAGTGTGTTAA
TTAATTAATGCTTGTAGGACATAATAATAACAATTGAATGTCTGCACAGCCGCTTTCCACACAGACATCATAACAAAAAA
TTTCCACCAAACCCCCCCCTCCCCCCNGCTTCTGGNCNNCAGNNNNTTAAACNACATCTNTGCCAAACCCCAAAANCAAA
NANCCTAACACCAGCCTANCAGANTTCNANTTTTATCNTTTTGNNGNNGCNNNTTTANAGTCACCCCCCANTAANNNCNT
NATTTCCCCNNNCCNNNTCCCNNACNN
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其中的突变位点有:
C16223T
T16298C
G16319A
G16384A
G16434A
G16470A
G16471A
G16472A
G16473A
A16476G
A73G   
T152C  
A263G
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没人接招啊。
俺自己认为是M8a2a,请高手帮俺验证一下是不是。
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把序列也贴上吧,万一有些同志不能看峰图。虽然极少情况下序列会有些不清楚的地方,但一般没有问题。

>NN-MTF_B11.ab1
NNNNNNNNNNNNNTNNNNNNNNNNNNNNNCTNNNNANNNNNNNNNNNNNNNNGGGGAAGCAGATTTGGGTACCACCCAAG
TAT ...
一统浆糊 发表于 2012-6-21 00:06
可以试试转化为氨基酸序列
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