返回列表 回复 发帖

從細菌基因看亞太人群遷徙定居史 (Moodley et al. 2010)

全文:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2827536/pdf/nihms178138.pdf

The Peopling of the Pacific from a Bacterial Perspective

Yoshan Moodley et al.

Abstract
Two prehistoric migrations peopled the Pacific. One reached New Guinea and Australia, and a
second, more recent, migration extended through Melanesia and from there to the Polynesian
islands. These migrations were accompanied by two distinct populations of the specific human
pathogen Helicobacter pylori, called hpSahul and hspMaori, respectively. hpSahul split from
Asian populations of H. pylori 31,000 to 37,000 years ago, in concordance with archaeological
history. The hpSahul populations in New Guinea and Australia have diverged sufficiently to
indicate that they have remained isolated for the past 23,000 to 32,000 years. The second human
expansion from Taiwan 5000 years ago dispersed one of several subgroups of the Austronesian
language family along with one of several hspMaori clades into Melanesia and Polynesia, where
both language and parasite have continued to diverge.
apbp1.JPG
apbp2.JPG
2

评分次数

Y染色體:O3 M134+ M117-
mtDNA:D5a2

Y染色體:O3 M134+ M117-
mtDNA:D5a2
这是一个很有说服力的方法,也是很有发展前景的方向。如果能多测一些点,结论就会更多。
13,14,15,16,17的差别让我感觉这种方法可能很准确。
基本上區分出了幾個類型,包括Sahul類型(澳洲+新幾內亞)、中亞類型、美洲原住民類型、東亞-中南半島類型、南島語族類型,大體上吻合我們對亞太地區人群的概略分型。
Y染色體:O3 M134+ M117-
mtDNA:D5a2
这个论文的思路是不错的。但是结论我不敢恭维。一个最大的缺陷就是他认为毛利单倍群在5000年前开始在南岛扩张,一直到波利尼西亚的远海地区。而我们已经知道波利尼西亚占优势的Y是O3,而不是台湾最高发的O1。
此外对台湾的采样很彻底,对东南亚各岛屿的采样缺失,显示总体思路可能是先预设结果再求证。
NRY: O2a1c1a1a1a1a1a1-002611,F11,F17,F856,F1495(源自粤西云浮)
mtDNA:B4d1(源自浙北慈溪)
百越人的人类学文集 http://blog.sina.com.cn/baiyueren
没把西方的列上是一大憾事。途中的中亚是不是相当于西方的呢?
O3a3c* (M134+, M117-)
本帖最后由 polyhedron 于 2011-4-27 20:05 编辑

幽門螺桿菌應該早在2006年左右就已經有人研究過了,當時就是說最遠的是科伊桑語系的和其它都很遠。這回就是亞太的細化。中國大陸皃似還沒有人做過這個。

細菌的好處是和Y染色體和線粒體一樣,不發生重組,可以做譜系樹,而不像常染色體總體只能分析結構。壞處是,不是每個人都有,尤其現代使用抗生素導致很多人內幽門螺杆菌缺失。而且也不是嚴格從父母傳下來,可能有水平傳播。
目前在復旦已經停止對外的收費服務,只做科硏項目。測試可以找源基因 www.yoogene.com 。
新浪微博@polyhedron
微信公衆号fenzirenleixue
幽門螺杆菌缺失倒不是个大问题,但是如果不是严格按照从父母传下来,可能有水平传播就是个大问题了。
幽门螺杆菌在中国传统宴请方式中很容易水平传播,也许某些固有肠道菌效果更好,那类菌是新生儿吃第一口奶就能感染到的,水平传播可能很小.
物变天汰,余者生存
以前我得胃病的时候看到的,说中国人幽门螺旋杆菌感染的复发率是60%-100%
O3a3c* (M134+, M117-)
本帖最后由 wolfgang 于 2011-7-15 00:54 编辑

这篇文章重新看了一遍,又有点收获,就是幽门螺杆菌虽然有水平传播的可能,但是它的谱系树可以做的很精确,这对勾勒出古代人群的分化大致方向是很有用的。
返回列表
baidu
互联网 www.ranhaer.org