返回列表 回复 发帖

少陵原西周墓遗址mtDNA

Hereditary constitution analysis of Shaolingyuan ancient human in Xi’an, northwestern China

Lin Li, Peihuan Wang, Daiyun Liu, Jinling Shao, Xiaohong Duan

ABSTRACT
In order to identify the kinship of Shaolingyuan ancient human excavated from Shaolingyuan archaeological site with high level of certainty, and infer racial origins more clearly and reliably, this paper analyzed the hereditary constitution of this population. We used the “Reverse root canal technique” to extract ancient DNA from 28 teeth in 28 skeletal remains (3057-2784 BP) of Shaolingyuan archaeological site, obtained the sequences of mtDNA Hypervariable region I (HVR-I) by PCR amplifications; then used MEGA 5.5 software to construct phylogenetic trees and compared the sequences among the sequences of interraces, intraraces. The phylogenetic tree showed that there were two major clusters, Cluster 1 with 16 individuals, and Cluster 2 with 5 individuals. Either the genetic gap or the geographic position of the individuals was small. The frequency of SNP site 16223 T > C was 71.4%, significantly higher than other sites. The comparisons of different population demonstrated that there is no significant difference among them. All of them shared the same haplogroup L1’2’3’4’5’6, close to African. Finally, we confirm that there is a very close genetic relationship between some individuals in this cemetery. We regarded Shao-lingyuan Western Zhou cemetery as a family cemetery, and these people belong to East Asia lineage.

发表:
http://www.scirp.org/journal/PaperInformation.aspx?PaperID=35653

全文:
http://www.scirp.org/journal/PaperDownload.aspx?paperID=35653
3

评分次数

M28西周少陵原F(少304)F1a1a108 129 162 172 291 298
M31西周少陵原? 209 260 298
M64西周少陵原FF2a'b108 162 291 298 304
M79西周少陵原Z 185 209 223 260 298
M84西周少陵原? 185 260 298
M102西周少陵原FF1a1a108 129 162 172 291 304
M148西周少陵原Z 185 209 223 260 298
M151西周少陵原B rCRS
M207西周少陵原Z 108 185 209 223 260  298
M208西周少陵原Z(少298) 108 129 162 172 185  209 223 260 291 304
M222西周少陵原M7M7a1a7108 162 185 209 223 291 304
M258西周少陵原M* 108 162 185 223
M263西周少陵原F(少304)F1a108 129 172
M272西周少陵原Z 108 162 172 185 209  223 260 298 304
M293西周少陵原FF1a1a108 129 162 172 291 304
M297西周少陵原Z 185 209 223 260 298
M298西周少陵原Z 129 162 185 209 223  260 298 304
M306西周少陵原M* 185 223
M307西周少陵原M* 162 223 304
M310西周少陵原M7a/M8 209  223 260 298
M328西周少陵原Z(少298) 162 185 223 260
M335西周少陵原M* 223 291
M340西周少陵原Z 185 223 260 298
M354西周少陵原Z 185 209 223 260 298
M355西周少陵原Z(少185) 108 129 162 172 223 260 291 298 304
M378西周少陵原Z
185 223 260 291 298
M382西周少陵原B rCRS
M387西周少陵原B rCRS
M451西周少陵原Z 185 209 223 260 298
M464西周少陵原FF1a1a108 129 162 172 291 304
M467西周少陵原M7a/M8 209  223 260 298
新技术方案尝试:低覆盖全基因组,最低成本深度解析父系源流,略有成效,大家一起摸索。微博@基因人王冰 QQ群:387100816。
本帖最后由 Yungsiyebu 于 2013-8-13 11:09 编辑

B、F比例较高,B是CRS,出现在山东临淄组,但也不能绝对排除是H。F基本都是F1a*/F1a1a,很华南的特征。一个D没有。
Z高达46.7%,但其内部差异也不低,不似同一家族。
因Z高频样本较少,直接做出的mtdna聚类分析结果,非常接近仫佬族、拉祜族等南方少民。人骨报告刚刚找到,陈靓老师将其归入古中原类型,颅骨聚类分析接近瓦窑沟等组,接近华南组,但略偏西北一点。具体数据我还没录入具体分析。
新技术方案尝试:低覆盖全基因组,最低成本深度解析父系源流,略有成效,大家一起摸索。微博@基因人王冰 QQ群:387100816。
小永又错了,古DNA数据一般都有大量的错误!依我看,其中只有F1a1a和Z两种。

M28108 129 162 172 291 298F1a1a
M31209 260 298Z
M64108 162 291 298 304F1a1a
M79185 209 223 260 298Z
M84185 260 298Z
M102108 129 162 172 291 304F1a1a
M148185 209 223 260 298Z
M151?
M207108 185 209 223 260 298Z
M208108 162 172 185 209 223 260 291 298 304错误F1a1a or Z
M222108 162 185 209 223 260 291 304错误F1a1a or Z
M258108 162 185 223错误F1a1a or Z
M263108 129 172F1a1a
M272108 162 172 185 209 223 260 298 304错误F1a1a or Z
M293108 129 162 172 291 304F1a1a
M297185 209 223 260 298Z
M298129 162 185 209 223 260 298 304错误F1a1a or Z
M306185 223Z?
M307162 223 304F1a1?
M310209 223 260 298Z
M328162 185 223 260Z?
M335223 291?
M340185 223 260 298Z
M354185 209 223 260 298Z
M355108 129 162 172 223 260 291 298 304错误F1a1a or Z
M378185 223 260 291 298Z
M382?
M387?
M451185 209 223 260 298Z
M464108 129 162 172 291 304F1a1a
M467209 223 260 298Z
NRY: O2a1c1a1a1a1a1a1-002611,F11,F17,F856,F1495(源自粤西云浮)
mtDNA:B4d1(源自浙北慈溪)
百越人的人类学文集 http://blog.sina.com.cn/baiyueren
小永又错了,古DNA数据一般都有大量的错误!依我看,其中只有F1a1a和Z两种。

M28108 129 162 172 291 298F1a1aM31209 260 298ZM64108 162 291 298 304F1a1aM79185 209 223 260 298ZM84185 260 298ZM102108 129 16 ...
baiyueren 发表于 2013-8-13 11:08
rCRS参比临淄组,判断为B是合理的,当然不排除H。

三例疑似M8*,M7a被你判断为Z,基本的突变确实,尽管不排除回复突变的可能,但几率不高。
M208等几例不可能判断为F1a1a。
新技术方案尝试:低覆盖全基因组,最低成本深度解析父系源流,略有成效,大家一起摸索。微博@基因人王冰 QQ群:387100816。
我见过的rCRS一般都是错误,尽管从理论上来说有可能是HVI突变位点很少的M7或B。
NRY: O2a1c1a1a1a1a1a1-002611,F11,F17,F856,F1495(源自粤西云浮)
mtDNA:B4d1(源自浙北慈溪)
百越人的人类学文集 http://blog.sina.com.cn/baiyueren
少陵原.png
2013-8-13 11:44
少陵原2.png
2013-8-13 11:44
NRY: O2a1c1a1a1a1a1a1-002611,F11,F17,F856,F1495(源自粤西云浮)
mtDNA:B4d1(源自浙北慈溪)
百越人的人类学文集 http://blog.sina.com.cn/baiyueren
《少陵原西周墓地》发掘报告说,少陵原西周墓属于周人平民墓,很多墓葬都随葬有兵器,比例较高,显示出崇尚武勇的风气,还有不少女子墓葬也随葬有兵器,可能属于女战士。
本帖最后由 baiyueren 于 2013-8-13 12:47 编辑

我刚查了一下复旦和昆明所的汉族人群的mtDNA数据,F1a1a和Z在中原地区(河南安阳、陕西西安)已有数据中没有发现。

F1a1a在汉族中零星低频分部,包括上海、江西、福建、四川、山东、云南、广西、广东、辽宁、内蒙东、甘肃。

Z(16185不回复):上海(最多)、浙江(较多)、福建及潮汕(较多)、江苏、湖北、四川、山东、辽宁、内蒙东、甘肃

结合墓葬主人爱用贝类饰品,葬俗是头东枕、脚西蹬,常有武器陪葬,人类学类型更接近南亚类型而不是东亚类型来看,不排除是从东南地区迁来的非土著家族。
NRY: O2a1c1a1a1a1a1a1-002611,F11,F17,F856,F1495(源自粤西云浮)
mtDNA:B4d1(源自浙北慈溪)
百越人的人类学文集 http://blog.sina.com.cn/baiyueren
200座西周墓葬现世 长安少陵原上发现大型墓群  

www.xawb.com 2005-03-03 11:05:16 西安日报   

  本报讯(记者原建军实习生陈慧杨猛)短短200米长的范围内,发现西周墓葬达200座;大量的陶鬲、陶罐、铜戈、陶簋、贯耳壶、贝壳、蚌壳、骨簪3000年后重见天日;一座墓中出土了叠压在一起的卜骨8片。日前,长安少陵原上一处大型西周墓群和一处大型西周遗址被偶然发现。

  著名考古学家刘呆运告诉记者,他们在西安-柞水高速公路建设工地发现了这一处西周遗存,墓地具体位置在杜曲镇东杨万村村北的少陵原上。仅在少陵原长200米的范围内,就发现了200座西周墓葬,座座墓葬几乎紧挨,密度之大令专家称奇。考古人员目前已发掘了墓葬100余座,出土珍贵文物200余件。

  发掘现场记者目睹,这些墓葬除少数几座是中型墓外,大多墓为小型竖穴墓,墓主人葬式几乎全为仰身直肢单棺葬,他们多数是“头东枕、脚西蹬”,个别墓主是反向下葬躯体,不知如此葬式是否有什么深意。众多墓葬里曾建有“熟土二层台”,少部分墓葬里挖有“腰坑”,有的墓葬里有“头龛”,几个墓葬的墓室两壁开有小龛,小龛随葬有粮食。

  西周墓葬陪葬品多被排列成组件而置内。奴隶社会渔猎情形在部落里随处可见,多数墓内出土有贝壳和蚌壳。征伐不绝昂扬奋发的周人武器常伴己身,这在墓群中就能得到证明,铜戈屡屡出土,少者一墓一件,多者一墓达四件。周人生产水平的提高和文化创造能力无可置疑,一些西周墓中出土了玛瑙、绿松石串饰、蚌饰、骨器等。值得格外重视的是,在编号为M96的竖穴土坑墓中发现有8片“卜骨”,它们位于墓室的北壁距墓底1.6米的熟土二层台上,8片卜骨叠压在一起,每片上面都分布有数量不等的钻、凿及灼的痕迹。

  在墓群的西侧还发现有一处周人大型遗址,遗址面积较大堆积丰富,时代特征明显,至少为一处聚落。刘呆运说,从种种迹象来判断,这里的墓主人身份一定十分特殊,“平民或者奴隶怎么会有奇珍异宝或者能时时占卜呢?”这处墓葬时代从西周早期到晚期均有,其中以早中期居多,晚期较少。专家们说,这些罕有的文化和历史信息对寻找西周时期的“杜”国以及西周王陵提供了又一丝曙光。
NRY: O2a1c1a1a1a1a1a1-002611,F11,F17,F856,F1495(源自粤西云浮)
mtDNA:B4d1(源自浙北慈溪)
百越人的人类学文集 http://blog.sina.com.cn/baiyueren
本帖最后由 baiyueren 于 2013-8-13 13:52 编辑

重大发现!在昆明所的山东泰安的数据中发现了带有16291突变的F1a1a样本SD10371,高变1区特征108 129 162 172 291 304,与少陵原的同类型完全匹配了。
看来此家族是来自山东类波利尼西亚人种的可能性很大。
NRY: O2a1c1a1a1a1a1a1-002611,F11,F17,F856,F1495(源自粤西云浮)
mtDNA:B4d1(源自浙北慈溪)
百越人的人类学文集 http://blog.sina.com.cn/baiyueren
墓葬是东西向的?那他们不属于华夏族的可能性很大。
O3a3c* (M134+, M117-)
历史上被周人安置到杜的最著名的是陶唐氏之后,范氏之先。
O3a3c* (M134+, M117-)
我刚查了一下复旦和昆明所的汉族人群的mtDNA数据,F1a1a和Z在中原地区(河南安阳、陕西西安)已有数据中没有发现。

F1a1a在汉族中零星低频分部,包括上海、江西、福建、四川、山东、云南、广西、广东、辽宁、内蒙 ...
baiyueren 发表于 2013-8-13 12:35
要是典型东亚类型才不正常,这就是关中土著的人类学特征,接近华南汉族和华南少民,典型的古中原类型,但与瓦窑沟一样,略偏北方。
新技术方案尝试:低覆盖全基因组,最低成本深度解析父系源流,略有成效,大家一起摸索。微博@基因人王冰 QQ群:387100816。
[quote]我见过的rCRS一般都是错误,尽管从理论上来说有可能是HVI突变位点很少的M7或B。
baiyueren 发表于 2013-8-13 11:16 [/quote

]


2013再出错的可能性不高,而且rCRS在古中原组出现的几率很高,比如临淄2500组。Vietnam Man Bac有一例B5样本多一步突变,这个应当是古中原的常见类型,但不论如何,这个常见于中原古代组的类型如今已经极为稀有。

新技术方案尝试:低覆盖全基因组,最低成本深度解析父系源流,略有成效,大家一起摸索。微博@基因人王冰 QQ群:387100816。
本帖最后由 Yungsiyebu 于 2013-8-13 15:50 编辑

mtdna主成分聚类分析还是与华南少民聚类特征更为明显,体现出古中原土著的种系特征。当然,非常特殊的Z类型有可能代表北方种系的血统渗入。
西周少陵原.jpg
新技术方案尝试:低覆盖全基因组,最低成本深度解析父系源流,略有成效,大家一起摸索。微博@基因人王冰 QQ群:387100816。
刚才查了一下考古发掘报告。其中提到男女比例为0.83:1,未成年人数量少(5%),而且青壮年男性比女性数量少很多,但中老年反而是男性比女性略多。这应该是说明这个家族有相当一部分青壮年男性是在对外征战时非正常死亡的。很可能是类似军屯户的那种情况。
NRY: O2a1c1a1a1a1a1a1-002611,F11,F17,F856,F1495(源自粤西云浮)
mtDNA:B4d1(源自浙北慈溪)
百越人的人类学文集 http://blog.sina.com.cn/baiyueren
16# Yungsiyebu
少陵原的古DNA测序位点出错太多,而且类型太单一,聚类分析根本不可能是准确的。
NRY: O2a1c1a1a1a1a1a1-002611,F11,F17,F856,F1495(源自粤西云浮)
mtDNA:B4d1(源自浙北慈溪)
百越人的人类学文集 http://blog.sina.com.cn/baiyueren
16# Yungsiyebu
少陵原的古DNA测序位点出错太多,而且类型太单一,聚类分析根本不可能是准确的。
baiyueren 发表于 2013-8-13 16:00
第一,我不认为有错误。第二,单一也仅仅体现在Z的比例较高,但在极少对比组样本有较高的Z情况下,主成分聚类分析主要还是体现在其他成分上,第三,mtdna主成分聚类分析与人骨人类学特征主成分聚类分析吻合度很高,大体体现此组标本具有很典型的古中原种系的人类学特征,即接近现代华南人群,与华北组人群存在明显差异。
新技术方案尝试:低覆盖全基因组,最低成本深度解析父系源流,略有成效,大家一起摸索。微博@基因人王冰 QQ群:387100816。
这个组的人骨特征是较为典型的古中原,因为男性颅骨有些残破,数据不是很全,cluster略有偏差,但整体情况无太大影响。
西周少陵原 人骨分析.jpg
新技术方案尝试:低覆盖全基因组,最低成本深度解析父系源流,略有成效,大家一起摸索。微博@基因人王冰 QQ群:387100816。
返回列表
baidu
互联网 www.ranhaer.org