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The origins of Chinese domestic cattle as revealed by Ancient DNA analysis

本帖最后由 198401 于 2013-10-1 19:22 编辑

The origins of Chinese domestic cattle as revealed by Ancient DNA analysis

Dawei Cai etc.

Highlights

•    Ancient DNA reveals that Chinese domestic cattle originated from the Near East.
•    In the early Bronze Age, cattle found in Northern China belong to taurine cattle.
•    Zebu cattle did not spread into the Central Plains until at least 1500 BC.
•    Ancient cattle made an important contribution to modern East Asian taurine cattle.
•    Haplogroup distribution has genetic continuity from the Bonze Age to present day.


Abstract

Recent ancient DNA analyses have revealed the origins of European and Near Eastern domestic cattle. In East Asia, however, only a few ancient cattle remains from Korea have been studied. The origins of East Asian domestic cattle and the genetic contribution by ancient cattle to modern cattle are still unclear. To provide new insight into the early history of East Asian domestic cattle, we analyzed mitochondrial DNA (mtDNA) from 53 cattle remains, aged between 4500 and 2300 years, excavated from five archaeological sites in Northern China. All ancient Chinese cattle were identified as belonging to taurine cattle. On the one hand, the results support the previous hypothesis that taurine cattle spread into Northern China between 3000 and 2000 BC; on the other hand, the results suggest that zebu cattle did not spread into the Central Plains until at least 1500 BC. Three haplogroups T2, T3, and T4 were present in the ancient Chinese cattle, of which T3 was predominant (79.3%), while T2 and T4 were less common (9.4% and 11.3% respectively). Considering the geographic origin and estimated age of mtDNA haplogroups and the archaeological record of cattle remains in China, our results suggest that Chinese domestic cattle originated from the Near East and were already introduced into the Central Plains around 2500-1900 BC. Furthermore, phylogenetic network analysis indicates that the haplogroup distribution pattern of ancient Chinese cattle is similar to that of modern East Asian taurine cattle, suggesting a genetic continuity from the Bronze Age to present day. Lastly, population pairwise FST distance analysis and multidimensional scaling analysis also support close genetic relationship between ancient Chinese cattle and modern East Asian taurine cattle. All these results suggest that ancient Chinese cattle made an important contribution to the gene pool of modern East Asian taurine cattle.
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http://www.sciencedirect.com/sci ... i/S0305440313003166
本帖最后由 roxsan 于 2015-2-28 23:57 编辑

这篇其实挺有用。简译如下:
我们取了距今2300-4500年华北5个遗址的53个家牛个体的mtDNA,全部属于家牛(注:即黄牛)系列。
本研究支持以前的假设,黄牛从公元前2000-3000年间传入华北。另一方面,瘤牛(注:与黄牛不同种类,背部有瘤峰,一般认为起源于印度)直到公元前1500年左右才进入中原地区。中国古代黄牛中,发现了T2,T3,T4三个谱系,其中T3是主要谱系占比79.3%,T2为9.4%,T3为11.3%。
我们认为中国家养黄牛起源于近东,在公元前2500-1900年间引入中国。此外,中国古代黄牛也与现代远东黄牛相似,显示了从青铜时代至今的连续性,基因 上显示二者也聚在一起。中国古代黄牛对现代远东黄牛有很重要的基因贡献。
傻逼太多,懒得理会。
本帖最后由 roxsan 于 2015-3-1 00:03 编辑

说明:上面占比79.3%的T3谱系,一般认为起源于近东新月地带。

另外,吉林大学2013年硕士学位论文:《陶寺和二里头遗址古代黄牛分子考古学研究》,作者孙洋,概述如下:
1 主要家养动物驯化和起源

狗:起源地地依据发现的狗古化石最早时间顺序是欧洲、近东、东亚。狗很有可能也是中东或欧洲驯化起源。最早德国狗化石14000年。
家猪:起源地根据发现的家猪古化石最早时间顺序是近东安那托利亚、东南欧、东亚。猪很有可能也是中东驯化起源,最早驯化时间10000-9000年。
家绵羊:被认为是在中东新月沃地驯化,驯化时间10000-9000年。
家山羊:家山羊起源于中亚一带的角羊,驯化时间约9000年。
家马:被认为约6500年驯化于欧亚大陆腹部某处。中国家马是在商代晚期突然大量出现。
家鸡:最早发现家鸡遗址在古印度河谷,驯化时间可能在6000年前。
普通黄牛:被认为是在中东新月沃地或非洲驯化,时间大约10000年前。
瘤牛:被认为是印度河谷驯化。
水牛:印度北部,约6000年驯化。

2 黄牛世系

黄牛分普通牛、瘤牛两种。黄牛被认为是在11000年前在近东被驯化的,而瘤牛被认为是在印度河谷被驯化的。普通黄牛4个单倍群:T,T1,T2,T3。  T1主要分布在非洲,T、T2、T3主要分布在近东和欧洲,在东北亚地区还存在T3下的一个亚型T4。mtDNA分析表明,中国地方品种现代普通黄牛分属3个世系:T2,T3,T4,频率是(8.9%,81.2%,9.9%)。


3 实验结论

陶寺:得到13个样本,均为普通黄牛,12个为T3世系,1个为T4世系。
二里头:得到9个样本,均为普通黄牛,7个为T3世系,1个T2世系,1个T4世系。

4 分析观点

原作者结合新疆小河、青海长宁、内蒙古大山前遗址的古代黄牛mtDNA实验数据,得出分析观点:
5个遗址均没有发现瘤牛,普通黄牛在中国古代黄牛占据主要地位。
现代瘤牛在中国分布频率自南向北降低,推测印度起源的瘤牛由南面传入中国,进入中原和北方地区至少是在3500年之后(殷墟遗址大约在3300年以后),晚于普通牛传入中国的时间。
二里头遗址同时拥有T2、T3、T4世系,比例为11%、78%、11%,与中国地方品种现代普通牛单倍型分布组成和频率接近。
小河墓地古代黄牛具有丰富遗传多样性,具有欧洲和西亚谱系特征,结合考古学文化现象,西亚起源的黄牛走北线应最早到达中国西北地区,然后向东扩散。
大山前遗址有T4世系,而小河、长宁都没有T4世系,北亚雅库特黄牛T4世系超过50%。(注:说明T4世系黄牛应为T3黄牛传播到东北地区后突变产生的新世系。)
傻逼太多,懒得理会。

标题

说明:上面占比79.3%的T3谱系,一般认为起源于近东新月地带。
另外,吉林大学2013年硕士学位论文:《陶寺和二里头遗址古代黄牛分子考古学研究》,作者孙洋,概述如下:
1 主要家养动物驯化和起源
狗:起源地地 ...
roxsan 发表于 2015-3-1 00:02
有两个错了,中国家猪与中东不同,最大可能来自湄公河流域。最早家鸡最近已有分子生物学证据,是河北南庄头,但在遗传上家鸡接近湄公河流域原鸡,显然,它们都是中国新石器初从东南亚带来的。
O3a3c* (M134+, M117-)
普通小麦的起源地也是那一带(具体在高加索山西南的阿塞拜疆、伊朗西北和土耳其东部边缘),传到中国的时间在4000-5000年之间(更具体似乎更靠近4500)。

家马、小麦、黄牛、黄牛、家鸡、家猪如果集中在一个时间段出现在中国,那么是什么人带进来的呢?

4000-5000年这个时间段很敏感啊。
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