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1万年前河北南庄头遗址家鸡与东南亚原鸡无关

利用古代DNA信息研究家鸡起源驯化模式

【作者】 向海;

【导师】 赵兴波;

【作者基本信息】 中国农业大学, 动物遗传育种与繁殖, 2015, 博士

【摘要】 现代家鸡起源于原鸡,但其驯化地、驯化时间及扩散路线等驯化模式问题已经争论了一个多世纪,其争论的主要焦点是做为现代家鸡祖先的红原鸡的野生种目前的栖息地主要集中在亚洲南部地区,而世界上最早的家鸡遗骸却出土于黄河中游地区。要解析家鸡起源驯化模式,必须澄清黄河中游地区的古代遗骸的物种属性及与现代家鸡的遗传关系。通过环介导引物介导的PCR方法,我们对39个鸡骨残骸进行了DNA分析。样本分别来自黄河流域中下游距今约10000年的南庄头遗址、距今约7500年的磁山遗址和距今约4500年的王因遗址,以及长江中游距今约3000年的九连墩战国楚墓遗址。我们还对南庄头遗址、磁山遗址的骨骼样品进行了碳14年代测定。研究结果表明:(1)南庄头遗址的古代样本来自新石器时代早期文化堆积层距今约10500年;磁山遗址的古代样本来自典型的新石器时代磁山文化堆积层距今约7900年;(2)获得了来自以上4个遗址的13个样品的线粒体COI基因159bp序列。通过与鸡形目6个属的196条COI基因同源序列的遗传分析发现古代样本均源于原鸡属群体;(3)获得了来自以上4个遗址的8个样品的线粒体DNA控制区326bp序列,通过与10条发表的古DNA序列和1001条来自4个原鸡种的同源序列的聚类分析,发现现代家鸡的祖先单倍型群类型在距今约一万年的新石器时代黄河流域中游地区的古代群体中就已经存在,揭示出黄河流域的原始种群是现代家鸡的祖先之一,并证明了中国北方地区曾经存在早期家鸡驯化事件;(4)全新世早期以来华北平原地区气候和环境变化巨大,南庄头遗址和磁山遗址出土的大量热带动植物证明全新世早期中国北方的环境适合原鸡生存。最早的粟类栽种及猪、狗驯化说明当时的生产力发展水平足以进行家鸡驯化。新石器时代早期家鸡遗传多样性丰富反映其驯化的早期阶段,揭示出华北地区从南庄头遗址转型农业到磁山遗址成熟农业的逐渐发展过程;(5)亚洲南部地区的原鸡和现代家鸡群体拥有独特的单倍型,综合农业起源证据,认为家鸡是多地区多物种起源,但亚洲南部的家鸡驯化开始时间还有待进一步探寻。本研究建立了适用于古代家鸡考古样本DNA研究的技术平台,首次报道了距今超过4500年的古代家鸡样本DNA序列,并获得了世界上最古老的家鸡样本DNA序列,发现中国北方地区是除南亚东南亚地区之外另一个重要的家鸡起源地,其驯化时间从距今大约10000年的新石器时代早期就已经开始。
新技术方案尝试:低覆盖全基因组,最低成本深度解析父系源流,略有成效,大家一起摸索。微博@好奇云怪 QQ群:387100816。
这个研究,吉大早有报道,最终是农业大学抢鲜发了,越来越多的研究机构在古dna提取方面获得突破,是好事。
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中原远古有大象、犀牛、猕猴、鳄鱼,为啥就没有原鸡,某些人刻舟求剑的研究方法是不对路的。
磁山文化距离冰期不远,它的原鸡不是南方来的难道是从地里冒出来的?
O3a3c* (M134+, M117-)

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中原远古有大象、犀牛、猕猴、鳄鱼,为啥就没有原鸡,某些人刻舟求剑的研究方法是不对路的。
癯鹤 发表于 2015-7-31 20:20
中原有大象,难道是由冰期的猛犸进化来的吗?
O3a3c* (M134+, M117-)
没有人类的生产生活影响,大陆的多数物种的迁移扩散能力是很强的(尤其是考虑动物繁殖遇到适宜期后的几何级数增长的可能性)。可能几百年几十代就足够跨越几千里了(尤其对于原鸡这样能飞行和大象这样能游泳的动物,大江大河不是障碍)。 5# hercules
鸡这种家禽,特别是如果原鸡会飞的话,我觉得其训化的条件应该有人类定居
怎样确定当时其不是猎物?
两个很简单的问题,就能解答。第一个问题,在新仙女木冰期,远东只有哪块地方有可能生活有原鸡?
第二个问题,原鸡飞不高也飞不远,不会游水(野猪)也不会泅渡(大象犀牛),它们如何跨越长江天堑?
O3a3c* (M134+, M117-)
查了一下,原鸡确实是留鸟而非候鸟。。。。。。
傻逼太多,懒得理会。

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9# roxsan
原鸡是留鸟的话那训化地应该在南方

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8# hercules
我知道家猪游泳很牛叉的,不知道大象怎样
可以看相关文献。如果在北方原鸡作为狩猎鸟类,更说明有驯养的条件了,而不是从南方传来的驯化品种。另外古人不会千里迢迢从南方热带地区引进原鸡作为狩猎鸟吧! 7# zh0000
比猪牛,跟水牛河马有得比! 11# zh0000
本帖最后由 癯鹤 于 2015-8-10 14:35 编辑

原鸡最远能飞百十来米,长江三峡最窄处不足百米,长江上游的峡谷还有更窄的,西南地区在远古湿热的时候就是热带气候,原鸡飞过去很容易的(尤其从峡谷悬崖或高树上居高临下飞越江面应该不成问题,有猛兽猛禽或南人追猎更容易远弋)。然后迁徙扩散,到达黄河中下游也很容易。 8# hercules
原鸡是热带亚热带丛林鸟类,爬那么高干什么?何况在峡谷飞会被风切变带到沟里。
O3a3c* (M134+, M117-)
种群扩散很容易。尤其是如果不喜欢高原,更容易沿河谷扩殖。西南干热河谷在远古湿热时代应该就是南亚热带与热带气候。至于峡谷的风,也不是无时无刻都刮的。对于一般的鸟类,飞行中抗个一般的风力还是可以的,原鸡的飞行能力比家鸡好。 15# hercules
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