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替网友问一下MT-D5b1b的分布范围

本帖最后由 Ryan 于 2016-3-28 16:22 编辑

一位网友测出MT-D5b1b, 请问高手这个MT-D5b1b在各民族的分布,
D -在欧亚大陆东部发现在印第安人中、中亚也有;偶尔也在亚洲西部和欧洲北部
根据这个分部范围,可以推测:她的来源与数万年前日本周围父系D\C系原配向大陆扩张有关,后与向东扩展的父系Q结合,向美洲扩散;并随着D、C、Q等父系在北亚、中国西部、中亚、欧洲扩散。
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1# greatio
目前还没有D5这么下游分支的完整全序列检测数据能说明分布情况的。
另外,你没发现上面的新会员是是在扯淡吗?
NRY: O2a1c1a1a1a1a1a1-002611,F11,F17,F856,F1495(源自粤西云浮)
mtDNA:B4d1(源自浙北慈溪)
百越人的人类学文集 http://blog.sina.com.cn/baiyueren
谁规定,新会员回答问题就是扯淡?没有D5这么下游分支的完整全序列检测数据?难道"D -在欧亚大陆东部发现在印第安人中、中亚也有;偶尔也在亚洲西部和欧洲北部"有错吗?
"根据这个分部范围,可以推测:她的来源与数万年前日本周围父系D\C系原配向大陆扩张有关,后与向东扩展的父系Q结合,向美洲扩散;并随着D、C、Q等父系在北亚、中国西部、中亚、欧洲扩散。"有错吗?

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谁规定,新会员回答问题就是扯淡?没有D5这么下游分支的完整全序列检测数据?难道"D -在欧亚大陆东部发现在印第安人中、中亚也有;偶尔也在亚洲西部和欧洲北部"有错吗?
hxr7353 发表于 2016-3-28 23:20
答非所问。
O3a3c* (M134+, M117-)
"根据这个分部范围,可以推测:她的来源与数万年前日本周围父系D\C系原配向大陆扩张有关,后与向东扩展的父系Q结合,向美洲扩散;并随着D、C、Q等父系在北亚、中国西部、中亚、欧洲扩散。"有错吗?
hxr7353 发表于 2016-3-28 23:20
什么类型跟什么类型是“原配”这种说法实际上没多大意义。Y染色体跟mtDNA并没有遗传上的对应关系,在不同族群间都是流动的。而从某个单独的分支类型来说,其五千年前的“原配”,一万年前的“原配”,三万五万年前的“原配”可能是完全不同的。而从你所描述的这些共祖时间长达四五万年以上的大单倍群来说,其下游的不同支系,在不同的时间节点,所谓的“原配”类型可能也是完全不同的。
此外,最为最为重要的一点,现今所看到的这些类型都是幸存下来的极少数。这些类型的所谓“原配”类型可能早就灭绝掉了。
C-M130交流群:542136235
本帖最后由 william0509 于 2016-3-30 03:22 编辑
什么类型跟什么类型是“原配”这种说法实际上没多大意义。Y染色体跟mtDNA并没有遗传上的对应关系,在不同族群间都是流动的。而从某个单独的分支类型来说,其五千年前的“原配”,一万年前的“原配”,三万五万年前 ...
豢龙氏 发表于 2016-3-29 13:05
豢龙兄说的没错。线粒体和父系基本上是无法对应的。只不过人们认为有父必有母,理应是成对成双的。其实这一点不是绝对性的。中石器时代的欧洲人口格局就反映了这个变化。
中石器时代7000-9000年前欧洲人群地理分布格局.JPG
闽民系基因交流群 209955432
M117交流群 O2a2b1a1-M117 7425996
M8母系群 585843910
R父系基因研究交流群 543365293
Y-高通量发布 271838550
郑氏基因交流群 574991236

对后世来说,由于随着人群混合增多,谈论一般母系类型跟什么父系类型是“原配”这种说法实际上没多大意义;但对于个别时间上对应,人群上对应的确定例子例外.例如,90000年前的在阿拉伯半岛的母系L3对应父系CT、B。这就是相对明确的。
本帖最后由 Yungsiyebu 于 2016-3-30 21:45 编辑

全序组数据来看,主要见于日本和中国。楼主数据根据最新的树,其实,还能在细分一步,即为D5b1b2,携带三个marker,G5147A  A7403G  T16357C,目前只能确定一例日本样本属于这个家族,是一位百岁老人。

因为线粒体dna的拷贝数非常多,~1.3x全基因组的覆盖率近于100%,作为线粒体DNA全序列的分析方法,是性价比非常高的选择。

NCBIAP008260.1Japanese  centenarian from TokyoD5b1b2183C 189 223 357 362 519
NCBIAP008283.1Japanese centenarian  from TokyoD5b1b189 223 362 519
NCBIAP008375.1Japanese patient with  Parkinson disease from TokyoD5b1b183C 189 223 362 519
NCBIAP011041.1Japanese schizophrenic  patientD5b1b189 193+C 223 362 519
NCBIAP013198.1elite Japanese athletesD5b1b189 223 362 519
NCBIJF824829.2ChineseD5b1b093Y 183C 189 223 362 519
NCBIJF824922.2ChineseD5b1b093Y 183C 189 223 362 519
NCBIAP008345.1Japanese patient with  Parkinson disease from TokyoD5b1b189 216 223 252C 362 519
NCBIAP008771.1Japanese diabetic  patient from AichiD5b1b189 216 223 362 519
NCBIAP010971.1Japanese schizophrenic  patientD5b1b093 189 216 223 362 519
Mygene15R2838Han ShanxiD5b1b2182 183 189 223 343 357 362 519

仅根据高变I区数据,不太把握的疑似D5b1b2样本还包括,古代组的内蒙古赤峰的夏家店下层文化和新疆的天山北麓样本,现代人包括哈萨克、青岛广东等地汉族、东北的赫哲族等。

BackgroudHalpogroupsubgroupHVR1
Dadianzi,Lower xiajiadianDD5b1b2182 183 189 223 357 362
GallardoDD5b1b2142 184 189 195 223 325 357 362 448
Altain KazakhDD5b1b2126 183 189 193.1 223 357 362
HanDD5b1b2183 189 223 249 357 362 519
Chaoshan,GuangdongDD5b1b2183 189 193+ 223 357 362
Chaoshan,GuangdongDD5b1b2183 189 223 357 362
Chaoshan,GuangdongDD5b1b2093 183 189 193+ 223 357 362
TianshanbeiluDD5b1b2129 193 223 311 357
Qingdao HanDD5b1b2183 189 223 357 362 519
Qingdao HanDD5b1b2183 189 223 357 362 519
HezheDD5b1b2183 189 223 357 362
HezheDD5b1b2183 189 223 357 362
Japanese centenarian from  TokyoDD5b1b2183 189 223 357 362 519
Han ShanxiDD5b1b2182 183 189 223 343 357 362 519
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新技术方案尝试:低覆盖全基因组,最低成本深度解析父系源流,略有成效,大家一起摸索。微博@好奇云怪 QQ群:387100816。
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