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311例四川凉山彝族23Y-STR

Genetic polymorphism investigation of the Chinese Yi minority using PowerPlex® Y23 STR amplification system
AbstractTwenty-three Y-STR loci (DYS576, DYS389I, DYS389 II, DYS448, DYS19, DYS391, DYS481, DYS549, DYS533, DYS438, DYS437, DYS570, DYS635, DYS390, DYS439, DYS392, DYS393, DYS458 DYS456, DYS643, Y-GATA-H4, and DYS385a/b) included in the next-generation PowerPlex® Y23 System were first investigated in 311 unrelated, healthy male individuals from the Yi minority population residing in the Liangshan Yi Autonomous Prefecture, Sichuan, China. A total of 179 alleles and 297 haplotypes were discovered in the Yi group. In total, 285 haplotypes among them were unique, and the remaining 12 haplotypes were observed in two or three individuals. Haplotype discrimination capacity and haplotype diversity were 0.9550 and 0.9989, respectively. Genetic diversity ranged from 0.4550 (DYS437) to 0.9556 (DYS385a/b). Population comparisons between the Yi minority group and 10 Asian meta-populations comprising 58 individual populations were performed. Both multidimensional scaling plots and phylogenetic analyses demonstrated that the genetic structure of the Chinese Yi ethnicity was extremely different compared to Taiwan indigenous inhabitants among 10 Asian meta-populations. Additionally, the genetic structure resemblance of the Yi group was obtained from a geographically close population (Xuanwei Han) or similar language family groups (Thai populations). Besides, our study has demonstrated that the PowerPlex® Y23 System has high polymorphism in a Chinese Yi ethnic population and high discriminatory power for forensic purposes. Population data of the 23 Y-STR obtained from a Yi ethnic population has enriched the Chinese ethnic genetic information.
KeywordsPhylogenetic analysisForensic geneticsYi ethnicityY-STRPowerPlex® Y23 system



http://link.springer.com/article/10.1007/s00414-017-1537-2
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一直缺彝族的大样本量数据。这份数据值得仔细分析一下。相对与其他人群,彝语支人群似乎有比例较高的 O3*-M122(xM134)。彝语支人群本身也是一个庞大的族群,对研究整个汉藏语人群的起源而言是很重要的。
人类之子全都是为死而生。
              --------《阙特勤碑》
彝族应该是在夏朝以后就远离华夏人群了
这篇文章的附件是 word形式,ht031之后的每两个数值单独作为一个对象排列,整个数据转换成 excel几乎是不可能完成的任务。放弃了。

推测了前三十个Y-STR单倍型的可能Y-SNP单倍群归宿:


H001    D1a1a2-F1635
H005    D1a1a1-F738
H009    D1a1a2-F1635
H011    D1a1a1-F738
H025    D1a1a2-F1635
H022    C2a1-F2613/Z1338
H013    F2-M427
H024    N1d2-M1800
H006    O1a1a1-F446
H015    O1b1a1-M95
H021    O1b1a1-M95
H028    O1b1a1a2a-F5506
H016    O1b1a1a1a-M88
H003    O1b1a1b1*-M1368
H026    O1b1a1b1*-M1368
H010    O2a-M324
H002    Oα-F5
H012    Oα-F5
H023    Oα-F5/M1514
H007    Oα1-F5970
H008    Oα1-F5970
H027    Oα1-F5970
H030    Oα1b-F6800
H019    Oα1d1a-CTS1154
H017    Oβ(O2a2b1a2a1)-F46
H004    Oβ1a-F14214
H014    Oβ1a-F14214
H029    Oβ1a-F14214
H020    Oβ1a1a1-F152
H018    Oβ1b1a2-KM3031
1

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人类之子全都是为死而生。
              --------《阙特勤碑》
前30个样本,结果和彝族的数据还是很吻合的。就是N少了点,但目测后面的单倍型中N的个数应该挺多。
人类之子全都是为死而生。
              --------《阙特勤碑》
本帖最后由 baiyueren 于 2017-1-17 23:59 编辑

彝族从Y和mt看,应该也是混出来的。比如高发mt-A来自华中地区,似乎其祖先历史上还给更西部的藏缅族群输送过A。而M系成分和其它藏缅族群相差无几。
NRY: O2a1c1a1a1a1a1a1a1a1(源自粤西云浮)
mtDNA:B4d1(源自浙北慈溪)
百越人的人类学文集 http://blog.sina.com.cn/baiyueren
y-F2比想象中的少很多,不知道有没有区分黑彝还是白彝?
物格而后知至,知至而后意诚,意诚而后心正,心正而后身修,身修而后家齐,家齐而后国治,国治而后天下平...
已转成excel
311_Chinese Yi_23Y-STR.xlsx (42.26 KB)
6

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本帖最后由 Hanhe 于 2017-1-18 18:21 编辑

彝族绝对值得研究,根据他们的天文与历法传说,可能是接触过五千年前先进古人的少数人群之一。对彝族,要去掉晚期西南人群常见类型再分析。要研究其它少数民族也应如此,比如广西壮族、两湖土家族,估计有一半是唐朝以后混入的中南汉人类型。
本帖最后由 Ryan 于 2017-1-18 16:59 编辑

每一个单倍型的推测见附件。总的Y-SNP的比例是这样:

HGN%
C*30.96%
C3-M217113.54%
D1-M156119.61%
F2-M427144.50%
N1c-F120620.64%
N2-F2930319.97%
O1-M119206.43%
O2*-M268
(xM95,M176)
41.29%
O2a-M953611.58%
O2a1-M8830.96%
O3-M122206.43%
O3-M1177323.47%
O3-F444268.36%
O3-00261161.93%
R1a1a-M1710.32%
Sum311

GuangLin He2017, Yi, 23Y-STR, 单倍群推测.rar (83.85 KB)

1

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人类之子全都是为死而生。
              --------《阙特勤碑》
本帖最后由 Ryan 于 2017-1-18 15:46 编辑

D1的比例比以往的彝族数据高了不少。N2的比例很适中。002611的比例低于预期。没有看到Q。文章本身也说了,样本中有一些亲缘个体。不过彝族本身也也就是这样,各地的小支系内部都有一些晚近扩张的父系类型,也属正常。
人类之子全都是为死而生。
              --------《阙特勤碑》
比例有误,是311例,不是297例,有的样本的N并不是1,而是2或3
三界无安,犹如火宅。众苦充满,甚可怖畏
                            --------《法华经》
是以法从心生。名因法立
                      ------------《宗镜录》
04,14,29,37,48,77,90,166,233是一个家族簇
三界无安,犹如火宅。众苦充满,甚可怖畏
                            --------《法华经》
是以法从心生。名因法立
                      ------------《宗镜录》
12# sahaliyan

10#已更新。
人类之子全都是为死而生。
              --------《阙特勤碑》
本帖最后由 Hanhe 于 2017-1-18 18:19 编辑

N比Q还神秘,彝族的N是否就是某支先夏人群?有没有可能北极人群的Q在末次冰期向中纬度迁徙?(与现在的说法刚好相反)

参考年代:
末次冰期是于第四纪更新世内发生的最近一次冰河时期。末次冰期约于11万年前开始,于前9600-9700年完结。于这段期间,曾出现几次冰川的前进及消退,最盛期发生于约1.8万年前。
盛冰期(pleniglacial)是指晚更新世晚期的末次冰期的最寒冷时期,即在距今2.5-1.5万年前冰川发展最盛的时期,海平面最低比现在低155米。
每一个单倍型的推测见附件。总的Y-SNP的比例是这样:

HGN% C*30.96% C3-M217113.54% D1-M156119.61% F2-M427144.50% N1c-F120620.64% N2-F2930319.97% O1-M119206.43% O2*-M268
(xM95,M176)41.29% O2a-M953611. ...
Ryan 发表于 2017-1-18 15:36
我个人看法其中的O1a中有个簇是西南少数民族中常见的KM203支系有3.53%的比例,而不是F140,我对比过有23-STR和傣族KM203是差一步的。有23-STR可以对比的。
彝族KM203.png
1K-GENOME-M119-YSTR.JPG
2

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姓氏Y染色体样本快递团购群,群号码:218755506
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没测SNP的勿进
每一个单倍型的推测见附件。总的Y-SNP的比例是这样:

HGN% C*30.96% C3-M217113.54% D1-M156119.61% F2-M427144.50% N1c-F120620.64% N2-F2930319.97% O1-M119206.43% O2*-M268
(xM95,M176)41.29% O2a-M953611. ...
Ryan 发表于 2017-1-18 15:36
H018应该是F444,你后面的表算到F5里了。
F444交流群:293164533
Y高通测试报名QQ群:602612059
我的划分都比较粗,主要是为了弄清大单倍群的比例。每一个样本的更准确的上下游结果,大家可以进一步细化。
人类之子全都是为死而生。
              --------《阙特勤碑》
每一个单倍型的推测见附件。总的Y-SNP的比例是这样:

HGN% C*30.96% C3-M217113.54% D1-M156119.61% F2-M427144.50% N1c-F120620.64% N2-F2930319.97% O1-M119206.43% O2*-M268
(xM95,M176)41.29% O2a-M953611. ...
Ryan 发表于 2017-1-18 15:36
请问能否找到参与测试的人的姓?在凉山各大家族的源流是比较清楚的,这样两相对比,可以得出更多的信息。
18# Ryan
能否得到这些样本背后的姓氏呢?
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