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会议报告称贝加尔湖新石器时代早期的常染DNA属于东亚狩猎采集者

本帖最后由 cpan0256 于 2017-4-23 18:11 编辑

关于新石器时代和青铜器时代贝加尔湖狩猎采集者的mtDNA和Y-DNA,近一些年出过研究文章【1-6】,本坛也有过讨论【7-11】。有关的常染色体DNA,刚刚由哥本哈根大学Eske Willerslev的小组做了一些研究,目前在网上可见一个会议报告的摘要和幻灯片推特图。

提交的报告题目是:Ancient Genomics of Neolithic to Bronze Age Baikal Hunter-Gatherers (粗略翻译:新石器时代和青铜器时代的贝加尔湖狩猎采集者的古基因数据)。报告时幻灯片上的题目可见进一步的修改:Tracking ancient admixture between a 'Paleosiberian' ghost and East Asian hunter-gatherer populations (粗略翻译:跟踪远古发生在东亚狩猎采集人群和一个古西伯利亚鬼影人群之间的混合)。

2楼是记者访问俄国人类学家时见到的用法医学雕塑技术复原的一个贝加尔湖古人的头像【12】。

3楼是会议报告的摘要。

4-8楼是会议报告的一些幻灯片推特图。


【1】 Matrilineal affinities and prehistoric Siberian mortuary practices: a case study from Neolithic Lake Baikal
http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0305440304001852
【2】 Population affinities of Neolithic Siberians: A snapshot from prehistoric Lake Baikal
http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/ajpa.20247/abstract
【3】 Biological diversity and population history of Middle Holocene hunter-gatherers from the Cis-Baikal region of Siberia
http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/ajpa.22608/abstract
【4】 Mitochondrial DNA diversity in the gene pool of the Neolithic and Early Bronze Age Cisbaikalian human population
https://link.springer.com/article/10.1134/S2079059715010104
【5】 Y-chromosomal DNA analyzed for four prehistoric cemeteries from Cis-Baikal, Siberia
http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2352409X16306927
【6】 Maternal and Paternal Polymorphisms in Prehistoric Siberian Populations of Lake Baikal (博士论文)
https://doi.org/10.7939/R3VM43557
https://era.library.ualberta.ca/files/wm117r51m/Moussa_Nour_M_201509_PhD.pdf
【7】 [极其重要]贝加尔湖7000年前新石器时代采集-狩猎人群的mtDNA
http://www.ranhaer.org/thread-4474-1-1.html
【8】 母系的密切联系与史前西伯利亚葬俗:对新石器时代贝加尔湖的个案研究
http://www.ranhaer.org/thread-13513-1-1.html
【9】 西伯利亚土著的遗传多样性:外贝加尔湖地区考古的aDNA研究
http://www.ranhaer.org/thread-13644-1-1.html
【10】 贝加尔湖7000年前新石器时代采集-狩猎人群的相似性
http://www.ranhaer.org/thread-14400-1-1.html
【11】 Nour Moussa: 贝加尔古人父系和母系
http://www.ranhaer.org/thread-34191-1-1.html
【12】 记者采访有关的贝加尔湖考古研究人员的俄文报告。(我本人不懂俄文。)
http://kommersant.ru/doc/2682568
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一个贝加尔湖古人复原像
east-asian-hg-0.jpg
2017-4-23 17:31
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本帖最后由 cpan0256 于 2017-4-23 18:24 编辑

[330] Ancient Genomics of Neolithic to Bronze Age Baikal Hunter-Gatherers

82nd annual meeting of the Society for American Archaeology (Vancouver, BC, Canada: March 29–April 2, 2017)
Damgaard, Peter de Barros, Jeremy Choin, Andrzej Weber, Martin Sikora and Eske Willerslev

Genome-wide data from hunter-gatherer populations of the Upper Paleolithic to Neolithic has provided unprecedented insight into the human evolutionary and demographic trajectory. However such datasets have hitherto been largely confined to Western Eurasia. The sole representative of Inner Asian past populations post-dating the split between paleolithic Europeans and Asians, as well as paleolithic Siberians and East Asians, are the Mal’ta and Afontova Gora individuals, the Ancient North East Asian (ANE) branch, clouding the dating of the population split, and subsequent admixture events, between ANE and East Asian hunter-gatherers. Our genome data (~1X) reveal that Baikal Hunter-Gatherers (BHG) are an uncharacterized genetically homogeneous branch of Inner Asian hunter-gatherers, displaying highest shared genetic drift with present-day East Asians. Targeted sampling strategies coupled to excellent biomolecule preservation has permitted the generation of an advantageous sample size dataset (n = 31), rendering possible to estimate allele frequencies within these groups, thereby optimizing population tests. BHG model as an excellent proxy for an Inner Asian source population admixing into the late Bronze Age Andronovo groups, becoming Iron Age steppe nomads. With genomes allowing for kinship analyses, pathogen detection and strontium ratios, coupled to archaeological interpretative approaches we extend possible means to elucidate behavioral processes and cultural transformation.

http://www.saa.org/AbouttheSocie ... d/1554/Default.aspx
east-asian-hg-1.jpg
2017-4-23 17:36

east-asian-hg-2.jpg
2017-4-23 17:36
本帖最后由 cpan0256 于 2017-4-23 17:52 编辑

PCA (各大洲主要人群只是有选择地包括,不包括贝加尔湖古人数据)
east-asian-hg-3.jpg
2017-4-23 17:49

PCA (同上,增加新石器时代早期贝加尔湖数据,出现在图的最右边)
east-asian-hg-4.jpg
2017-4-23 17:49

PCA (同上,再增加新石器时代晚期至青铜器时代贝加尔湖数据,出现在右边偏上)
east-asian-hg-5.jpg
2017-4-23 17:49
east-asian-hg-6.jpg
2017-4-23 17:54

east-asian-hg-7.jpg
2017-4-23 17:54
本帖最后由 cpan0256 于 2017-4-23 18:14 编辑

east-asian-hg-8.jpg
2017-4-23 17:55

左图:蓝色占绝大部分时的横轴坐标是Even, Evenk, Buryats; 绿色占绝大部分时是Shores (?),  Tubalars
右图:蓝色占绝大部分时的横轴坐标是Neolithic BHG; 多了一些绿色部分时是Late Neolithic --> Bronze Age
east-asian-hg-9.jpg
2017-4-23 18:09
[330] Ancient Genomics of Neolithic to Bronze Age Baikal Hunter-Gatherers

82nd annual meeting of the Society for American Archaeology (Vancouver, BC, Canada: March 29–April 2, 2017)
Damgaard, Peter de Barros, Jeremy Choin, Andrzej Weber, Martin Sikora and Eske Willerslev ...
cpan0256 发表于 2017-4-23 17:34
请问可以提供这篇文章的链接吗?
物格而后知至,知至而后意诚,意诚而后心正,心正而后身修,身修而后家齐,家齐而后国治,国治而后天下平...
请问可以提供这篇文章的链接吗?
imvivi001 发表于 2017-4-23 20:33
我在顶楼提到只见了报告摘要和幻灯片。很多人做报告前只准备幻灯片。不知送发表的文章是否写完了。

在2楼最后一行链接的网页上,今年会议的所有摘要按字母排列,收在几个PDF文件里。根据第一作者的姓去查就好了。
一个贝加尔湖古人复原像
51023
cpan0256 发表于 2017-4-23 17:31
比较像东亚,不像北亚,北方汉族有不少这样的,也比较像秦俑
1楼参考【6】的链接可以下载全文,其中总结了过去的和论文本身的关于mtDNA和Y-DNA的工作。

从Y-单倍群数据来看,在间断了大约一千年后,这一局部地区的人群变得不同了。

新石器时代早期 Y-DNA:  16  (来自Lokomotiv和Shamanka II墓地)
K-M9:  13  (K-M9的下游分支L,M,N,O,P,S,T未测)
R1a1a-M17:  2
C2-M217:  1

新石器时代晚期-青铜器时代 Y-DNA:  20  (来自Ust’-Ida和Kurma XI墓地)
Q1a2-M346:  13
Q-M242(xM346, M25):  3
K-M9:  1  (K-M9的下游分支L,M,N,O,P,S,T未测)
未命名-L914:  3
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12# cpan0256 看了下,新石器早期时间段是8000--6800年前,新石器晚期--青铜时代是5800--4000年前。这里的k不出意料应该是 N。新石器早期就有R1a1a-M17在贝加尔湖畔比较出人意料,因为这时印欧人还没有扩张,估计这种M17也不是现在的主流。新石器晚期--青铜时代Q的扩张应该是新来的印欧人带来了马和青铜器,文化交流给了阿尔泰山一带的Q,然后阿尔泰山一带的Q进行了一轮扩张,这和三道海子文化的扩张类似。
7# cpan0256

Shores 和Tubalars貌似R1a占明显优势的族群,是西徐亚人的后裔。

本帖最后由 lindberg 于 2017-4-24 12:18 编辑

这位老人家眉清目秀的,眼眶不小,说不定就是N一开始的模样,现在北亚人群中,雅库特人也看着相对顺眼点
1# cpan0256

这是一系列很重要的工作。这些工作已经开始触及了现代阿尔泰语人群的直接起源的早期过程。这些工作将形成重要的研究成果。与我现在做的阿尔泰语人群的父系起源的工作直接相关。
人类之子全都是为死而生。
              --------《阙特勤碑》
本帖最后由 Ryan 于 2017-4-24 13:57 编辑

12# cpan0256

新石器时代早期的 K*, 我猜测应该是 N1b-P43。 6.8千年前从贝加尔湖西部向更西部迁徙的人群,很有可能就是现代的乌拉尔语人群中的 Khanty,Mansi,Nganasan等人群的直接祖先。事实上,K*-M9+, M45-, M175-, Tat-的样本的真正归属,几乎也已经不存在其他选项了。

值得注意的是,文中的K*-M9+, M45-, M175-, Tat-,并不是排除了所有已知下游的真正的 K*。
人类之子全都是为死而生。
              --------《阙特勤碑》
本帖最后由 baiyueren 于 2017-4-24 14:02 编辑
12# cpan0256
新石器时代早期的 K*, 我猜测应该是 N1b-P43. 7千年前从贝加尔湖西部
Ryan 发表于 2017-4-24 13:51
还有两点值得注意:
mt-A的比重从古至今是显著下降的,现代A比例最高的刻特人也不过7.8%;
F(多半就是F1b)在古DNA中以新石器早期的Lokomotiv人群显著高发;
C和D似乎是西伯利亚地区早就存在的古亚洲底层,无论在古今人群中比例都不低。

那么我在想:mt-A和F1b是否是新石器早期北上的Y-N人群(乌拉尔始祖)的母系主体?
NRY: O2a1c1a1a1a1a1a1-002611,F11,F17,F856,F1495(源自粤西云浮)
mtDNA:B4d1(源自浙北慈溪)
百越人的人类学文集 http://blog.sina.com.cn/baiyueren
19# baiyueren
那么我在想:mt-A和F1b是否是新石器早期北上的Y-N人群(乌拉尔始祖)的母系主体?
----我在《分子人类学与北亚人群的起源》一文中,对F1b'd'e就是这么推测的。A当时没有分析。
人类之子全都是为死而生。
              --------《阙特勤碑》
19# baiyueren
那么我在想:mt-A和F1b是否是新石器早期北上的Y-N人群(乌拉尔始祖)的母系主体?
----我在《分子人类学与北亚人群的起源》一文中,对F1b'd'e就是这么推测的。A当时没有分析。
Ryan 发表于 2017-4-24 14:00
西伯利亚和乌拉尔的A分支类型很单纯的,可以参见我的《N系单倍群》一文。
NRY: O2a1c1a1a1a1a1a1-002611,F11,F17,F856,F1495(源自粤西云浮)
mtDNA:B4d1(源自浙北慈溪)
百越人的人类学文集 http://blog.sina.com.cn/baiyueren
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