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原始印欧人颜那亚古DNA血统分析计算器(微基因平台上线)

本帖最后由 Yungsiyebu 于 2017-5-18 17:11 编辑

原始印欧人颜那亚古DNA血统分析计算器

根据Haak 2015文献报道的古代原始印欧人颜那亚人的基因组数据,我们邀请遗传学领域的小伙伴开发了一个小计算器,用来评估颜那亚人相关的血统成分。

目前,从汇总的有限汉族样本数据来看,南方汉族很少有信号,北方汉族约20-30%样本有相对明显的信号,但通常1%以内。北方少数民族和西北少数民族,则通常多数携带颜那亚人或者颜那亚人相关的血统信号。

数据类型:23andme, ancestryDNA, familytreeDNA等的通用半定制illumina芯片,wegene和23魔方等的通用半定制affy芯片,科研常用的illumina中华8,或者我们正在众筹的illumina GSA芯片均可接受。

参与方式:

微信群由小编微信引领:EQingcha ;口令:颜那亚。

特别说明:

为吸引更多遗传学、生信等领域的朋友参与各种小应用的开发,让大家的499测试数据有个玩,欢迎打赏¥9.9,让活动进入良性循环。

二楼以后,我们陆续更新匿名的分析结果,以便深入探讨类颜那亚血统在东方人群中的流向问题。
感谢钢总支持,计算器已经在一脉平台上线了。

https://www.wegene.com/crowdsourcing/details/164

我的计算结果:您携带古雅利安牧民颜那亚人或类颜那亚人血统比例为: 0.789% 。
新技术方案尝试:低覆盖全基因组,最低成本深度解析父系源流,略有成效,大家一起摸索。微博@好奇云怪 QQ群:387100816。
本帖最后由 Yungsiyebu 于 2017-5-14 18:04 编辑

首先看一下汉族的情况:

从HGDP数据库的样本来看,10个样本中有两个样本有较为明显的颜那亚或者类颜那亚信号,其中2位还不低,1.2645%和1.477%,其他非北方汉族样本,结果几乎都没有明显的信号。

Pop3
HGDP01287Han_NChina0.00001
HGDP01288Han_NChina0.00001
HGDP01289Han_NChina0.01477
HGDP01290Han_NChina0.012645
HGDP01291Han_NChina0.00001
HGDP01292Han_NChina0.00001
HGDP01293Han_NChina0.00001
HGDP01294Han_NChina0.00001
HGDP01295Han_NChina0.000012
HGDP01296Han_NChina0.00001


Pop3
HGDP00774Han0.00001
HGDP00775Han0.00001
HGDP00776Han0.00001
HGDP00777Han0.000011
HGDP00779Han0.00001
HGDP00780Han0.00001
HGDP00781Han0.00001
HGDP00782Han0.00001
HGDP00783Han0.00001
HGDP00784Han0.00001
HGDP00785Han0.00001
HGDP00786Han0.00001
HGDP00811Han0.00001
HGDP00812Han0.00001
HGDP00813Han0.00001
HGDP00814Han0.00001
HGDP00815Han0.00001
HGDP00817Han0.00001
HGDP00818Han0.00001
HGDP00819Han0.00001
HGDP00820Han0.00001
HGDP00821Han0.00001
HGDP00822Han0.00001
HGDP00971Han0.00001
HGDP00972Han0.00001
HGDP00973Han0.00001
HGDP00974Han0.00001
HGDP00975Han0.00001
HGDP00976Han0.00001
HGDP00977Han0.00001
HGDP01021Han0.00001
HGDP01023Han0.00001
HGDP01024Han0.00001
新技术方案尝试:低覆盖全基因组,最低成本深度解析父系源流,略有成效,大家一起摸索。微博@好奇云怪 QQ群:387100816。
呼伦贝尔蒙古组,内测的几个样本均有信号,平均1.53%,最高的达3.37%。
Pop3
HGDP01223Mongola0.007402
HGDP01225Mongola0.012989
HGDP01227Mongola0.014261
HGDP01228Mongola0.033714
HGDP01231Mongola0.013067
HGDP01232Mongola0.010369
新技术方案尝试:低覆盖全基因组,最低成本深度解析父系源流,略有成效,大家一起摸索。微博@好奇云怪 QQ群:387100816。
不妨测一下贝加尔湖新石器时代早期人群或陶寺人群对现代东亚人群的影响~
物格而后知至,知至而后意诚,意诚而后心正,心正而后身修,身修而后家齐,家齐而后国治,国治而后天下平...
不妨测一下贝加尔湖新石器时代早期人群或陶寺人群对现代东亚人群的影响~
imvivi001 发表于 2017-5-16 19:48
中国境内尚未公布任何古人的全基因组数据。
新技术方案尝试:低覆盖全基因组,最低成本深度解析父系源流,略有成效,大家一起摸索。微博@好奇云怪 QQ群:387100816。
计算器微基因平台上线了,感谢陈钢总的支持。

微基因或者23andme数据,可以抢鲜体验。

我的计算结果:您携带古雅利安牧民颜那亚人或类颜那亚人血统比例为: 0.789% 。因为参照人群规模不同,芯片类型不同等原因,会造成结果会经常有些小浮动。
颜那亚.png
新技术方案尝试:低覆盖全基因组,最低成本深度解析父系源流,略有成效,大家一起摸索。微博@好奇云怪 QQ群:387100816。
我的是

您携带古雅利安牧民颜那亚人或类颜那亚人血统比例为: 0.001%
微基因计算器被计算为99%北方汉族的,好多都有很强的颜那亚血统信号。
新技术方案尝试:低覆盖全基因组,最低成本深度解析父系源流,略有成效,大家一起摸索。微博@好奇云怪 QQ群:387100816。
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