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【PRJEB9041】Sanger Institute尼泊尔藏缅人群WGS样本的y和mt分析

本帖最后由 wmch_928 于 2018-2-1 00:52 编辑

NCBI项目编号:PRJEB9041
T19_Tibet;
The Wellcome Trust Sanger Institute

We propose to sequence 35 Tibetan samples to provide a comparative dataset for a project examining Himalayan samples (I1911). Tibetans have been studied in several ways such as their adaptations to high altitude life, although not, thus far, at the genome sequence level. We chose this number of individuals because similar numbers will be sequenced from many African, European and HGDP populations, and thus the Tibetan data can also be included in many other analyses.
绿色是40x的
QQ图片20170929101305.png
2017-9-29 10:22


把树形理了一下,在楼下;正好昨天也出了篇印度东北的文章,可惜不是WGS的数据。
看来有一部分贝塔融入了他们,而最有可能的时间就是随着M120一起融入,因为他们也有M120
N南支,CTS1642这些则是另外一回事了
三界无安,犹如火宅。众苦充满,甚可怖畏
                            --------《法华经》
是以法从心生。名因法立
                      ------------《宗镜录》
和汉族共享的成分主要是CTS1642,贝塔2和N-M1819,非常有价值的资料,马兄辛苦!
古 藏缅人群 无 C
古 藏缅人群 无 C
大凌河 发表于 2017-9-29 10:51
说明M217前往西部的时间很晚,但也不是全部,不丹人和BURUSHO人还是有M217下游分支的,BURUSHO人也有贝塔2,不过BURUSHO人没有藏缅类型
三界无安,犹如火宅。众苦充满,甚可怖畏
                            --------《法华经》
是以法从心生。名因法立
                      ------------《宗镜录》
本帖最后由 双头鹰 于 2017-9-29 11:11 编辑
说明M217前往西部的时间很晚,但也不是全部,不丹人和BURUSHO人还是有M217下游分支的,BURUSHO人也有贝塔2,不过BURUSHO人没有藏缅类型
sahaliyan 发表于 2017-9-29 10:55
BURUSHO人里那个C2还是南支,不过他们是巴基斯坦北部族群,这个C2的来源可能和藏缅族群关系不大,不丹那个M48确实蛮奇怪的,藏族样本里好像比较常见的是448del
BURUSHO人是巴基斯坦北部族群,这个C2的来源应该和藏缅族群关系不大,不丹那个M48确实蛮奇怪的,藏族样本里好像比较常见的是448del
双头鹰 发表于 2017-9-29 11:07
我说的是不丹的C2南支
孟加拉人也有
三界无安,犹如火宅。众苦充满,甚可怖畏
                            --------《法华经》
是以法从心生。名因法立
                      ------------《宗镜录》
本帖最后由 双头鹰 于 2017-9-29 11:31 编辑
我说的是不丹的C2南支
孟加拉人也有
sahaliyan 发表于 2017-9-29 11:12
嗯,孟加拉有F3777,不丹的南支数据出自哪里?能给一下么?
嗯,孟加拉有F3777,不丹的南支数据出自哪里?能给一下么?
双头鹰 发表于 2017-9-29 11:15
http://www.ranhaer.com/thread-33354-1-2.html
https://www.23mofang.com/communi ... 09c2b9b462ad807f37b
Sanger Institute尼泊尔藏缅人群WGS样本
出现了N-M1819
而我们的芯片数据  四川也是M1819的相对高频区 预计可达5%上下
此前 凉山彝族STR样本 看起来也有不少属于该支
推测N1b2-M1819也是藏缅人群主要组分之一
同时 M1819 仅根据芯片数据 就已经可以分成六个层次
其下游有一支3000多年的支系 在华南相对集中  这与O-CTS1642-SK1730的分布有一定相似性
不过藏族、云南一些民族也有N1b1的某些支系
未知这些支系与O-CTS1642、N-M1819、D-N1、D-M533等有何关系

尼泊尔藏缅样本的D也都是D-PH4979和D-Z31591、D-M533这三支
这也是北方汉族中的D的主要类型
推测卫藏藏族中的D-N1可能也是以D-PH4979和D-Z31591为主体
三界无安,犹如火宅。众苦充满,甚可怖畏
                            --------《法华经》
是以法从心生。名因法立
                      ------------《宗镜录》
9# Lep1dus
多谢了,原来是复旦的数据呀
https://www.23mofang.com/communi ... 3692b9b4672d69b0b50
藏缅可分为北部藏缅和南部藏缅
北部藏缅以D-N1、D-M533、M117(以CTS1642为主)等支系为主
南部藏缅以M117(CTS1642)、N1b、O-M95等支系为主
根据10楼引用的文字,SK1730/Y7080还是有比较大的可能和这支3000多年的N1b2支系结伴迁徙的,这样,他们还是从马家窑-营盘山迁徙而来的可能性大些,不知道SK1730/Y7080的年龄是不是也在这个区间范围内

N1b1和N1b2按以往经验也是不容易分开的,无论N1b2(6600ybp)还是F5(7300ybp)年龄都够不上仰韶以前的大地湾-老官台文化,所以它们可能应该与这些N1b1有关,仰韶以及马家窑兴起后,N1b2超过N1b1成为汉藏中N南支的主流

这里的贝塔2都标明是CTS7377-,不知是否意味着是4700ypb扩张的汉族常见支系以外的早期支系,不知道有多早,如较早,则也许还有其他可能

再一次说明藏缅中的F5以CTS1642为绝对多数
本帖最后由 wmch_928 于 2018-2-1 01:08 编辑

补充下用这些新的WGS数据得出的树形:
Oα6的,
QQ图片20180201003328.png
2018-2-1 00:50


Oβ2*的,
QQ图片20180201004756.png
2018-2-1 00:50


Q-M120的,
QQ图片20180201010736.png
2018-2-1 01:08
1

评分次数

4# 大凌河
别把话说这么满,汉藏语系的汉族,藏缅语系的土家族和哈尼族以及印度东北的Garo人都有比例不低的C2南支
南方民族就是南方民族,不需要有些别有用心的蝗汗给我们满世界找祖宗,一会儿说通古斯是南方人一会儿又说日韩是南方人,你们编故事编得累不累
12# guwei0001
南部一些藏缅族群的O-M95和F2更有可能是融合进藏缅的南亚或百濮,并非藏缅最初的成分
南方民族就是南方民族,不需要有些别有用心的蝗汗给我们满世界找祖宗,一会儿说通古斯是南方人一会儿又说日韩是南方人,你们编故事编得累不累
从母系来看藏缅人群的RBF很少,基本都是A,C,D4,G,M9之类的,显示他们跟亚洲北部族群的关系更近
南方民族就是南方民族,不需要有些别有用心的蝗汗给我们满世界找祖宗,一会儿说通古斯是南方人一会儿又说日韩是南方人,你们编故事编得累不累
本帖最后由 Peruvian 于 2018-2-1 10:56 编辑
补充下用这些新的WGS数据得出的树形:
Oα6的,
55825

Oβ2*的,
55826

Q-M120的,
55827
wmch_928 发表于 2018-2-1 00:51
你好,F242此处样本算得TMRCA是4800?具体是哪一级呢?
CTS7377-只有4800,和23魔方时间差异很大
梳理了下藏缅的CTS1642,总体感觉下面的两支分布还是有些偏向性,CTS5308支系总体偏西偏北,藏族(藏族的F5主要是CTS5308),尼泊尔、不丹、夏尔巴人,西北汉人、华北汉人、日本人。F14408支系则偏东偏南,印东北的藏缅(Riang)、孟加拉、缅甸、纳西族、彝族、景颇族、土家族、两广汉族等。当然这个说的是大体情况,相互交融的局面也是存在的。另外偏东的多数缺D父系,或者伴随的D系明显比偏西的低。
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