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40# lll
如果单单看频度正相关分析数据,370A与铲形门齿之间似乎存在明显的正相关联系,不过也不尽然,比如越南京族与日本和族的370A变异频度差不多(可能越南略高1%,视乎各组数据),但是日本人的铲型门齿频度要高一些。另外,铲型门齿在中国的直立人中就已经出现,彼时有370A变异吗? 我看难说。 最主要的是,目前还缺乏直接的实验数据证明370A与铲形门齿之间存在直接关系,所以现在我看下结论还为时过早。


田园洞人有没有铲形门齿? 反正本次论文没有提及,考虑到付团队这次“全序”是拼凑式全序数据,可能2号染色体上的基因提取有困难(其实他们也是很不容易了,已经算是很大的突破了),因此没有提取到有效的基因片段。

总之,看铲型门齿判断EE人群内部分化并不是一个很好的指标~
物格而后知至,知至而后意诚,意诚而后心正,心正而后身修,身修而后家齐,家齐而后国治,国治而后天下平...
日本人的370A变异频度内部差异颇大,如下:
Japanese580.741
(SA002260K) (11/18/2009)
Japanese1700.800
(SA002088S) (1/5/2011)
Japanese3780.786
(SA003508Q) (1/5/2011)
Japanese2040.755
(SA003509R) (1/5/2011)
Japanese2000.715
(SA003510J) (1/5/2011)
Japanese134640.778
(SA003513M) (1/5/2011)
Japanese5300.602
(SA003514N) (1/5/2011)
Japanese940.809
(SA000010B) (8/6/2012)
Japanese1780.809
(SA004060K) (8/7/2012)
Japanese2080.803
(SA004060K) (2/16/2015)
越南京族1980.823
(SA004249T) (2/16/2015)
Vietnamese640.781
(SA004420K) (3/28/2017)
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41# imvivi001 不知道安达曼人和巴布亚人有没有铲形门齿?
43# lll
没有具体数据,看wiki介绍好像东南亚人群的铲型门齿频度也不低(可能是巽它类型),找到一篇文章,里面应该有,收费的,你看是否有办法down一下,如有,可私信告知我

SHAPED INCISORS IN DIFFERENT POPULATIONS - Dental Anthropology - VARIATIONS IN THE FREQUENCY OF SHOVEL  http://www.sciencedirect.com/sci ... 9780080098234500161
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本帖最后由 lll 于 2017-12-6 03:32 编辑

44# imvivi001 虽然没有找到下载这篇文章的办法,但找到了另一篇文章,安达曼人巽他型牙齿呈现铲形的的比例有20%。 http://www.ivpp.cas.cn/cbw/rlxxb/xbwzxz/201205/P020120518351001693635.pdf
ABB533FE-150B-482B-A3FE-EB9982DB4873.jpeg
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44# imvivi001 日本阿伊努人是属于EE?还是澳美人种?他们的丹尼索瓦人基因比例是多高?
46# lll
尽管没有看到阿伊努人的ADMIXTURE分析结果,不过从日本方面之前的一些地域性的常染成分报告来看,阿依努人与日本人的差别不大,可能略为偏向科里亚克-楚科奇(回头再核对一下),总之是以EE为绝对主成分的族系。
至于他们的丹人成分,不好说,需要专门分析才知道。
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46# lll
尽管没有看到阿伊努人的ADMIXTURE分析结果,不过从日本方面之前的一些地域性的常染成分报告来看,阿依努人与日本人的差别不大,可能略为偏向科里亚克-楚科奇(回头再核对一下),总之是以EE为绝对主成分的 ...
imvivi001 发表于 2017-12-17 17:15
恐怕要先收回“常染成分报告来看,阿依努人与日本人的差别不大”这句话

阿伊努-日本-琉球-汉-K3-4-5-2012.jpg
2017-12-17 22:13


The history of human populations in the Japanese Archipelago inferred from genome-wide SNP data with a special reference to the Ainu and the Ryukyuan populations | Journal of Human Genetics  https://www.nature.com/articles/jhg2012114
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同文中更加详细的K值图(K=2~6,采用美女唐华博士的frappe算法,可能精细度不够,另外缺少更多的族群比对数据,不容易看清全局情况)
K2-6-阿伊努-倭-琉球-亚洲-mishima2012.png
2017-12-17 22:46
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初步可以得出如下推论:1、琉球人与日本和族的差别不是很大,倭人似乎略多一些‘华南SEA成分’(应该与弥生人群有关,或者也与其‘神农氏AIM携带人群有关);
2、阿伊努人与日本人以及琉球人的差别都很大,不过后二者均携带高比例的蓝色,估计就是绳纹文化人群的主频成分(不妨称之为’绳纹成分”);

   不过因为缺少西伯利亚东部人群如楚克奇或爱斯基摩人的比对,不好判断这种’绳纹蓝色’到底是不是一种EE成分(估计是的)。
   还有,可能是早期算法局限性,图中雅库特人与维吾尔族的成分的分析存在较明显的偏差。所以,这个图只能参考,还需要最新的算法予以纠偏。
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The history of human populations in the Japanese Archipelago inferred from genome-wide SNP data with a special reference to the Ainu and the Ryukyuan populations | Journal of Human Genetics  https:// ...
imvivi001 发表于 2017-12-17 22:13
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