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1.15万年前古婴遗骸再次改写美洲历史


https://www.nature.com/articles/nature25173

Terminal Pleistocene Alaskan genome reveals first founding population of Native Americans,Jan3 2018

http://www.dailymail.co.uk/sciencetech/article-5229261/Ancient-DNA-rewrites-American-history.html

Nature:Terminal Pleistocene Alaskan genome reveals ... of Native Americans

Terminal Pleistocene Alaskan genome reveals first founding population of Native Americans

J. Víctor Moreno-Mayar, Ben A. Potter, Lasse Vinner, Matthias Steinrücken, Simon Rasmussen, Jonathan Terhorst, John A. Kamm, Anders Albrechtsen, Anna-Sapfo alaspinas, Martin Sikora, Joshua D. Reuther, Joel D. Irish, Ripan S. Malhi, Ludovic Orlando, Yun S. Song, Rasmus Nielsen, David J. Meltzer & Eske Willerslev

doi:10.1038/nature25173

摘要:
Despite broad agreement that the Americas were initially populated via Beringia, the land bridge that connected far northeast Asia with northwestern North America during the Pleistocene epoch, when and how the peopling of the Americas occurred remains unresolved1,2,3,4,5. Analyses of human remains from Late Pleistocene Alaska are important to resolving the timing and dispersal of these populations. The remains of two infants were recovered at Upward Sun River (USR), and have been dated to around 11.5 thousand years ago (ka)6. Here, by sequencing the USR1 genome to an average coverage of approximately 17 times, we show that USR1 is most closely related to Native Americans, but falls basal to all previously sequenced contemporary and ancient Native Americans1,7,8. As such, USR1 represents a distinct Ancient Beringian population. Using demographic modelling, we infer that the Ancient Beringian population and ancestors of other Native Americans descended from a single founding population that initially split from East Asians around 36 ± 1.5 ka, with gene flow persisting until around 25 ± 1.1 ka. Gene flow from ancient north Eurasians into all Native Americans took place 25–20 ka, with Ancient Beringians branching off around 22–18.1 ka. Our findings support a long-term genetic structure in ancestral Native Americans, consistent with the Beringian ‘standstill model’9. We show that the basal northern and southern Native American branches, to which all other Native Americans belong, diverged around 17.5–14.6 ka, and that this probably occurred south of the North American ice sheets. We also show that after 11.5 ka, some of the northern Native American populations received gene flow from a Siberian population most closely related to Koryaks, but not Palaeo-Eskimos1, Inuits or Kets10, and that Native American gene flow into Inuits was through northern and not southern Native American groups1. Our findings further suggest that the far-northern North American presence of northern Native Americans is from a back migration that replaced or absorbed the initial founding population of Ancient Beringians.
捕获3333.JPG
2018-1-4 20:54


捕获444.JPG
2018-1-4 20:54
图54867


wmch_928 发表于 2018-1-4 20:54
这张图非常好,再次印证了我之前的论述,即美洲前殖民时期,存在与东亚人群长期持续不断的千丝万缕的基因交流(不过这次大嘴博士团队的admixture美洲古人数据太少,只是部分印证了我之前的论述)

自古以来美洲与东亚欧密切频繁以及持续的人员交流 - 分子人类学讨论区 Molecular Anthropology - 人类生物学在线 Biological Anthropology online - Powered by Discuz!  http://www.ranhaer.com/thread-37139-1-1.html
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Terminal Pleistocene Alaskan genome reveals first founding population of Native Americans
...we infer that the Ancient Beringian population and ancestors of other Native Americans descended from a single founding population that initially split from East Asians around 36 ± 1.5 ka.
wmch_928 发表于 2018-1-4 20:28
尽管没看到原文,还无法断定作者团队是如何得出这个结论,不过这个时间点非常有意思,与之前多个研究团队推断亚美大人种的最主要的AIM---370a变异marker的产生时间点是高度吻合的~
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看上取美国的印第安人西欧亚东欧亚成分四六开。但这不符合观感。
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5# 一统浆糊
我的看法,主要是早期美洲人的西亚欧成分基本上是ANE,这个与现在的WHG的区别还是蛮大的,大致接近2.4~3.5万年前的北欧亚古人,如Kostenki 14,或者更接近著名的马尔它男孩,是东西方严重混合的种系,与现代西亚欧人群还是不同的:

K9-KO14-12-Krems-ANE-smith.png
2018-1-5 00:13
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美洲土著严格意义的‘西欧亚成分’估计不到30%,我的估测,约28%~
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我的看法,主要是早期美洲人的西亚欧成分基本上是ANE,这个与现在的WHG的区别还是蛮大的,大致接近2.4~3.5万年前的北欧亚古人,如Kostenki 14,或者更接近著名的马尔它男孩,是东西方严重混合的种系 ...
imvivi001 发表于 2018-1-5 00:13
有道理。
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美洲土著严格意义的‘西欧亚成分’估计不到30%,我的估测,约28%~
imvivi001 发表于 2018-1-5 00:15
可以算以下WHG的比例。

夸大西欧亚在印第安的影响是欧美学界本能。
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10# 一统浆糊
K13-MA1-刻度smith2017.png
2018-1-5 09:12



这个是马尔它男孩的K=13成分,比较清楚。可以看出,纯粹的WHG仅有10%,CHG因为混有约50%WHG,按照刻度比例换算则为50%x50%约等于25%,其他成分亦有一些WHG成分参与,总体折算约8%,这样,马尔它的WHG约43%。
如果按照原文测算ANE以40%参与美洲人的形成,以马尔它男孩代入,则WHG=43%x40%=17.2%,比我之前的估测要低得多,某些欧洲主义者的期望这次又要落空了,呵呵
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这个是马尔它男孩的K=13成分,比较清楚。可以看出,纯粹的WHG仅有10%,CHG因为混有约50%WHG,按照刻度比例换算则为50%x50%约等于25%,其他成分亦有一些WHG成分参与,总体折算约8%,这样, ...
imvivi001 发表于 2018-1-5 09:12
说明这个ANE还是和东亚人群更接近?
本帖最后由 imvivi001 于 2018-1-5 12:22 编辑

12# wanhuatong
根据之前付的测算、laza豪华团队2016的测算、以及今年最新的ADMIXTURE运算结果来看,更准确的说,在现代人群中,除了现代美洲土著,在东亚欧人群中与西伯利亚人群最接近。与纯粹的WHG人群那就距离遥远了~
东西方-MA1-距离图-lazardis-2016-nature.png
2018-1-5 12:22
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如果按照原文测算ANE以40%参与美洲人的形成,以马尔它男孩代入,则WHG=43%x40%=17.2%,比我之前的估测要低得多,某些欧洲主义者的期望这次又要落空了,呵呵
imvivi001 发表于 2018-1-5 09:12
这个就很合理了。

就是说把ANE当成纯粹的西欧亚是某些人有意无意的误导。
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14# 一统浆糊
嗯,是的。最早是大嘴博士提出的,认为MA1男孩代表一种新成分,在美洲人与北欧人中高频,于是命名为ANE。他的北欧团队认为与东亚欧人群无关(这也是他的大嘴外号的由来),后来的研究者发现并非如此,尤其是Reich博士参与的几项研究均显示MA1与东亚欧有关,不过他们对MA1处于东西方之间的什么位置摇摆不定,于是误导了许多人~
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15# imvivi001 我本人也认为这个ANE不能完全算西欧亚,当然与今天的西伯利亚人群和东亚人群主要成分还是有点区别,按照你以前的说法,可以算作一种古西伯利亚成分,这样看来古代西伯利亚人群的变迁也是很频繁的。
http://www.stdaily.com/index/kej ... ontent_617224.shtml

“万岁婴儿”基因组数据讲述人类迁徙秘辛
2018-01-04 08:28:59 来源: 中国科技网-科技日报 作者: 张梦然

科技日报北京1月3日电 (记者张梦然)英国《自然》杂志3日报告了一项基因组学最新研究成果:一名约生活在11500年前阿拉斯加的人类婴儿基因组序列被测定。这同时也是迄今首个直接基因组证据,证明所有美洲原住民祖先都可追溯至晚更新世一次单一迁徙事件中的同一个源种群。

虽然一般认为,人类最先于更新世(地质时代第四纪的早期)通过白令大陆桥进入美洲定居,但是具体时间和方式仍是一个谜团。幸而,在2013年,科学家于阿拉斯加向阳河遗址发现两名人类婴儿的遗骸,它们可追溯至11500年前左右。

此次,美国马萨诸塞大学本·波特与丹麦哥本哈根大学研究人员艾斯科·威勒斯乐福的团队,利用基因组学技术测定了其中一名婴儿——USR1的全基因组序列。尽管另一名婴儿的DNA样本不足以进行基因组分析,但是研究显示二者是近亲。

测序后,他们对比了USR1婴儿样本和之前测定的当代、古代美洲原住民基因组,发现这名婴儿与现今的美洲原住民亲缘关系最近。他们认为,USR1婴儿样本代表了一个截然不同的种群,称之为“古白令人”,“古白令人”与其他美洲原住民的祖先起源于一个单一初始种群,该初始种群首先于36000年前左右与东亚人分离,但是其基因流一直持续到25000年前左右。

这些发现与所谓的“白令滞留模型”相符——即当人类到达白令海大陆桥上时,因别无选择只能在此“安营扎寨”,根据这一模型,有一个源种群的后代一直在东白令生活到至少11500年前。但是那时候,另一分支的美洲原住民已经在北美无冰川地区定居下来,并且分为两群,最终成为大部分美洲原住民的祖先。

总编辑圈点: 一项科学实验,不仅要有研究对象和目标,研究方法包括工具的选择,也直接影响结论权威性。考证地质年代,常用同位素质谱仪;追溯生命起源,基因测序当仁不让。当文字、传说甚至遗迹本身都无法阐明历史轨迹,先进测量方法会“开口”说话。
过桥时间要重新算了。
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Yoruba是西非的民族? 路径上标的数字代表什么?

仅仅从图上看:
1。ANE与EA是从非洲出来就分离? 这好像不太对吧。
2。Mal'ta 与EA没有交集。
3。ket, ANE成分多的西伯利亚小民族,与EA有交集,可以理解成LGM后,EA人群北上融合的结果,印象中ket的Y-DNA,几乎是Q,但mtDNA, 有一半左右是EA.
4. Koryaks, EA成分更多,也符合预期,Koryaks, 1/4是YDNA N, 这是海峡另一面没有的,可以说,N到达西伯利亚东北角以后,亚洲与美洲就没有基因交流了.
5. koryaks, 还有很多C, 不知道是不是美洲的C-P39, 估计不是,好像C-P39是美洲特有, 总的来说,海峡这个地理隔阂还是很有效的,留在亚洲的,EA贡献是越来越多。
6. 从图上看,ANE和EA混合,是在beringia或之前, native american的主体在从beringia南迁后,与EA基因基本隔离了。
7。与后来EA基因有交流的,是北极人群(Greenlander)和na-dene(athabascans), 而且后期EA的贡献不大。

3# wmch_928
不是桥,在LGM期间,Beringia的面积好像是2个德州大的一大块土地。从地理上,和整个西伯利亚是一体的。

而Beringia与美洲之间,有大块冰川覆盖,在LGM期间是不可逾越。也只有在LGM后,冰川融化,有陆地上可以通过的通道,或海边通道,才能迁移到美洲。



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