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Y染色体O1单倍群SNP位点在广西六个民族中遗传多态性

本帖最后由 Lep1dus 于 2018-5-24 20:58 编辑

摘要:[目的]Y染色体有效种群大小仅为常染色体的1/4,非重组区(non-recombining region,NRY)严格遵循父系遗传规律,对遗传漂变较敏感。Y-SNP突变率较低,可以方便进行大尺度的族源谱系判别;Y-STR突变率高,具有一定的多样性,在亲子鉴定中应用于父子、叔侄等父权鉴定;法医应用中,Y-SNP和Y-STR的有效配合,可以快速锁定家系,缩小排查范围,对混合斑样本男性成分进行辨别:群体遗传学中计算群体扩张时间,对人群来源进行推断,应用于法医学领域针对少数民族遗传成分描述及案件现场遗留的男性检材个体种族来源推断。[方法]采集广西地区六个民族(汉族、侗族、京族、苗族、瑶族、壮族)男性无关健康个体血样399份,采用QIAGEN公司MagAttract(?)DNA Mini M48 DNA Kit试剂盒提取样本DNA,-80℃保存。将广西六个民族399份无关男性样本分两个体系进行检测:核心单倍群体系(C-M130,D-M174,F-M89,G-M201,J-M304,K-M9,N-M231,O-M175,Q-M242,R-M207,O1-F265,O2-CTS10736);O1 单倍群体 系(O1a-M119,O1a1a-M307.1,O1alb-CTS5726,O1a1a1a-F140,O1a1a1b-SK1568/223420,O1a1a1a1-F78,O1a1a1b1-M101,O1a2a-F3288,O1a2a1-238606,O1b-M268,O1b1-F2320,O1b1a-M1470,O1b1a1-PK4,O1b1a1a-M95,O1b1a2-Page59,O1b1a1b-F838,O1b1a1a1-F1803/M1348,O1b1a1b1-F1199,O1b2a-F1204,O1b2a1-CTS713,O1b2a3-CTS 10687,O1b2b-CTS562,O1b1a2b-F417,O1b2a-F1942)采用Snapshot技术进行快速SNP分型,Y-STR分析应用Rv.3.2.3。XLSTAT软件、network 5.0.0.0等软件进行数据统计分析。[结果]12个Y-SNP核心体系在广西六个民族399个无关男性个体中,少量样本落在D单倍群(1.5%)中,以苗族为主的样本落在C单倍群(15.2%)中,一份京族样本拥有F-M89古老单倍群类型,一份壮族样本拥有J单倍群突变,3份样本落在N单倍群中,广西六个民族中绝大多数样本(81.9%)属于O单倍群。其中49.1%的样本落在O1单倍群中,32.8%的样本落在02单倍群中;挑选出196份拥有O1-F265突变的样本进行01体系检测,少量(14.7%)样本落在Ola单倍群中,大部分样本(85.2%)落在O1 b单倍群中。基于两个体系位点信息对广西六个民族进行主成分分析,核心体系中将广西瑶族与其他民族分开,使用O1体系中六个民族聚为两簇,广西汉族与广西侗族聚类,其他民族聚类在一起,将36个SNP位点共同进行主成分分析时,与核心分析相比,除瑶族外其他民族可以较为区分。加入邻近地区其他民族,包括汉藏语系藏缅语族、苗瑶语族、侗台语族以及南亚语系和阿尔泰语系有代表性的民族进行主成分分析发现;图中分为两个聚类簇:藏缅语族人群聚在一起,苗瑶语族与南亚语系人群聚为一簇,本研究结果与南亚语系距离较近;阿尔泰语系人群零散分布与藏缅语族人群呈现南北地域分布情况.在网络分析中C-M130分散出三个方向,种族关联性结构在图中并不明显,广西瑶族中高频存在并且与其他民族没有明显的基因交流;O1单倍群中Ola-M119中心节点由广西汉族、广西侗族以及广西京族构成,下游位点Olalala-F140的突变情况说明最近的基因交流在广西京族和广西壮族中进行,O1单倍群的另一分支人口扩张发生在Olblala-M95中,M95网络图中各个族群均有基因交流但是没有明显分层扩展结构;O2-CTS10736分支需要继续细分,遗传交流及分层结构没有O1单倍群明显。[结论]本课题基于单点扩增SNapshot技术成功构建了 Y染色体O1单倍群复合扩增体系,可在短时间内完成24重Y-SNP检测,在降低成本同时提高检测效率,该技术可推广应用于省市各级法医遗传学实验室;对于检测样本可以进行群体区分;对同一单倍群下的STR分型进行分析,进一步探讨群体间的遗传关系。C单倍群中瑶族人群占有绝大比例,广西六个民族在C单倍群的突变情况分散为三个分支并且期间较少有基因交流,古老单倍群丢失导致未构成年轮分布网络图。O1blala-M95在各个民族中尤其是广西壮族、广西苗瑶以及广西京族中有高频分布。 [url=]还原[/url]

关键词:[url=]Y-SNP;[/url][url=]Y-STR;[/url][url=]法医学;[/url][url=]遗传多态性;[/url]
导师:[url=]程宝文;[/url]

[url=]http://kns.cnki.net/KCMS/detail/detail.aspx?dbcode=CMFD&dbname=CMFDTEMP&filename=1017267329.nh&v=MTY5NzFzRkN2bldyN0pWRjI2R2JHK0dkTE9wcEViUElSOGVYMUx1eFlTN0RoMVQzcVRyV00xRnJDVVJMS2ZaZVo=[/url]
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这些说法好笼统哦,应该一一对应数据搞得详细点.
很有意思的贴子。

“M95网络图中各个族群均有基因交流但是没有明显分层扩展结构”,这是什么意思?如果一个万年土著,在没有大战乱的两广地区,数千年繁育发展应该很容易呈现星簇扩张吧?如果很散乱,就说明这些M95是来自不同地区的移民,比如来自全国各地的50万秦军移民、20万汉军移民,以及宋元之交的全国各地移民(宋末元初,广东人口增长4倍,广西至少也有2倍吧)。
3# 岭南处士
M95在东南亚很多民族中都高频分布,而在北方则极为低频,不知道你是如何得出两广的M95都是晚近时期北方南下的这样荒谬的结论。
探究人类学真相,为南方民族发声
很有价值的研究成果,居然本坛没有展开讨论,汗~
物格而后知至,知至而后意诚,意诚而后心正,心正而后身修,身修而后家齐,家齐而后国治,国治而后天下平...
发现一个小bug,作者论述越南与老挝遗传结构类聚时,把二者混同为孟高棉语族一起了
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4# MNOPS 我给你回复过理由啊。

先秦时期,M95北至山西,南到江西,东到上海马桥文化,西至重庆大溪文化,都有广泛分布。周人体质及修建秦始皇陵的秦朝劳工偏向南亚人种,mtDNA及主成份分析聚类现代广西人,也接近现代广东、福建、湖北人。种种迹象表明,南方人主体是秦汉及宋朝移民。

楼主的贴子,也证实广西M95不是本地万年土著。假说广西黄、韦二大姓是本地土著,数千上万年的繁衍,广西又没有中原的大战乱,DNA分析应会呈现星簇扩张吧?M95没有明显分层扩展结构,就说明各自源头不同。这是全国移民的特征。
M95是东南亚国内百越标志性父系,无95不东南亚不百越,南岛标志性父系是第一是O3a2b2等某些支系,第二M95,第三O1M110等,第四是C某些支系列
华夏一家
7# 岭南处士 马桥文化正是来源于3-4千年岭南文化,一万多年前先到江西,再到浙南,再到浙北马桥
华夏一家
广西京族的D-M174相比广西其他民系有点高,达到6.5%。之前karafet对越南京族的检测也发现4%的频度。京族的D不知道是不是M15的一个独立支系,会不会与京族独特的F*一起与当年安阳王人群迁入有关?
物格而后知至,知至而后意诚,意诚而后心正,心正而后身修,身修而后家齐,家齐而后国治,国治而后天下平...
7# 岭南处士
那请解释一下为什么东南亚,马来,印尼,还有印度都有M95,莫非都是伟大的黄汗国曾经征服过的地区?
探究人类学真相,为南方民族发声
m95的发展轨迹明显是二三万年前盘踞在越南北部一带,然后一部分一二万多年北上两广,一万多年前北上江西福建浙江,然后建立浙江越国,一部分北上贵州湖南四川建立楚国蜀国,浙江越国国民主体为O2A及O1M110M111
华夏一家
我都已经快要失去和某些黄汗讨论问题的耐心了,你说O1b是旧石器时期在较偏北的地区起源的这我不反对,因为反正现在证据不足旧石器时期的事情谁也说不清楚,但你说M95都是晚近时期从中原南下的这就完全是不合逻辑强词夺理了。
探究人类学真相,为南方民族发声
吾大黄汗国乃是万年北亚宇宙帝国,地球上乃至整个宇宙的一切都乃吾国起源吾国创造的,中原是吾国的制造中心,什么都是从中原造出来的
探究人类学真相,为南方民族发声
瑶族的C达到惊人的60%! 不出意外,其中至少一半是西南地区yu南亚常见的B66类型的东亚西南部下游类型,肯定也包括一定比例的C2华南支系(包括CTS4660)对于西南地区的B66,目前的研究似乎不够,不过可以肯定的是,这个支系在西南地区的历史应该非常悠久。


值得注意的是,与瑶族同属一个语系的广西苗族,本次检测没有发现其他苗族常见的F845,有一点奇怪~
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4# MNOPS 至于你所说M95在北方的分布,我是这样理解的。

印证历史,帝颛顼生于西南若水,实处穷桑(穷桑非在山东,而在河北太行山一带),也就将百濮人群带到河北一带(颛顼之母昌濮,应该就是百濮族名的来历。但昌濮在《山海经》中是颛顼祖母)。颛顼末期,共工氏作乱,辛侯帝喾平之,颛顼族就分成南北两部分。南部以后世楚国王室为标志,北部则流亡东北(详见《山海经》:东北扶余山有颛顼及九妃陵墓,河北昌黎大棘城有颛顼遗墟,后世北燕慕容氏建国于此)。董父善养龙,帝舜封董父为豢龙氏,史书记载董父就属于颛顼族。豢龙氏北迁游牧,后世就演化出蒙古室韦(《山海经》:颛顼之父韩流,猪嘴猪蹄人身,建司彘之国,豕韦氏之祖。豕韦即室韦)。

帝颛顼最初在河北鄚州建国并修筑鄚阳城,号高阳氏,族人则姓高氏、莫氏,我的祖先姬望也于西周末年在此建鄚国,秦汉时期分置高阳县、鄚县。秦灭六国,部分鄚国遗民则流亡东北,高氏演化成高句丽,莫离支则为高句丽大丞相称号,部分莫氏则由鲜卑莫护跋演化成慕容氏(慕容其实是鄚人转音),慕容氏也与姬周一样尊帝喾为祖,莫浅浑则为鲜卑宇文部国相。此外,南北朝东北地区还有莫河国,莫河即靺、勿吉。至唐代,东北渤海国内还有鄚颉府,府辖鄚州、高州,其地则为莫、高二姓所居。鄚颉之颉,就是后世吉林省的来历;而鄚,则是后世达斡尔族、赫哲族、鄂伦春族等族祖神莫日根的来历。而莫日根,又译作默尔根、蔑儿干,是蒙古室韦首领莫贺咄莫何弗的官号来历,及蒙古黄金家族祖先朵奔蔑儿干的姓氏来历,蔑儿干在后世又译作孛儿止根、包尔之金。

当然,越到后世,鄚及莫日根就越演化成官号及姓氏,与原来的血脉已经大有不同了。百濮族群M95高频,所以由颛顼族带到东北的人群也存在部分M95,比如达斡尔族O1B达21%,满族达11% 。西南彝族也尊颛顼为祖先之一,许多现代东北人就有不低的彝族成份。
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神话传说故事就不要拿到这里来说了,想讲神话故事请去故事论坛
探究人类学真相,为南方民族发声
15# imvivi001
华南有C1我不觉得奇怪,但C1跟C2不是一回事,C1在华南的历史很悠久不代表C2也在华南很久
探究人类学真相,为南方民族发声
本帖最后由 岭南处士 于 2018-3-1 15:33 编辑
7# 岭南处士
那请解释一下为什么东南亚,马来,印尼,还有印度都有M95,莫非都是伟大的黄汗国曾经征服过的地区?
MNOPS 发表于 2018-3-1 12:19
早就解释过。东南亚诸国最早的居民,是来自印度的原居民,主体成份是K、F、C、D(见下图)。后来又从中国大陆南迁了O3、O2,并日渐占据了南岛居民主体。但因最初的南岛居民来自印支大陆的K、F、C、D,所以印尼、马来西亚的文化是印度文化。O3、O2都是添油战术,每次迁入都不大,所以无法从文化上改变其属性。而印度M95主要分布于印度东北部的蒙达人,从地理上就明显可知来自中国云南、藏南的南迁人群。如果M95在印度有二三万年,又怎可能只局限于印度东北部?

不要说南岛,按照史书记载,便是东汉时期的越南南部、柬埔寨一带,居民都是拳发黑肤(注:拳发,即卷发)的印度人种。这可能也是秦始皇50万兵力都没征服越南南部的原因之一,因为本就不同种类。而远在东南亚的马来诸岛,人种差异就更大了。
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2018-3-1 14:43
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