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6.9千年前诞生的mt-F1d

本帖最后由 ranhaer 于 2009-9-26 13:34 编辑

修改一下,看走眼了,是F1d,很独特的一个类型,并不是常见的f1b,有点失望,还是不容易找到一个常见单倍体类型诞生于冰河期之后的。






Mitochondrial and Y-chromosome diversity of the Tharus (Nepal): a reservoir of genetic variation,一文中对F1b的诞生年代有了一估算,认为一个携有F1b突变的女性诞生于6.9+/-4.2千年,即新石器时代,对跟踪新石器时期以来人群的迁徙有着重要意义。收集一些文献中有关F1b在人群中的发生频度的信息。

The evidence of mtDNA haplogroup F in a European population and its ethnohistoric implications. vbn ,下图出自这篇克罗地亚人mtdna分析的文献,克罗地亚adriatic岛上的封闭人群有着8.3%的F1b发生频度,是现代人群中发生频度最高的人群之一。文献估计F1b在克罗地亚adriatic人群中的存在于蒙古-突厥人群的扩张有关,而因为在隔离人群中的奠基人效应造成F1b在这个人群中的高频。
克罗地亚f1b.jpg
本帖最后由 Yungsiyebu 于 2009-9-6 13:21 编辑

Mitochondrial and Y-chromosome diversity of the Tharus (Nepal): a reservoir of genetic variation,尼泊尔Th-E(Terai Tharus)人群中有2.5%F1b的频度,同时F1c在所有的三个组的Tharus人群中都有一定频度。
尼泊尔f1b.jpg
尼泊尔mtdna.jpg
Phylogeographic analysis of mitochondrial DNA in northern Asian populations,文献中给出了F1在西伯利亚人群中的发生频度,其中Shor塔塔尔人有着最高40%的发生频度。
西伯利亚F1.jpg
The Peopling of Korea Revealed by Analyses of Mitochondrial DNA and Y-Chromosomal Markers,这篇文献中给出了韩国以及其他6个亚洲人群的F发生频度。
韩国F1b.jpg
本帖最后由 Yungsiyebu 于 2009-9-6 13:47 编辑

Traces of Archaic Mitochondrial Lineages Persist in Austronesian-Speaking Formosan Populations. 台湾原著民mtdna分析,其中给出了F在台湾土著和一些亚太族群的发生频度。其中,泰国人6%的发生频度最高。
台湾-f1b.jpg
Diversity of Mitochondrial DNA Haplogroups in Ethnic Populations of the Volga-Ural Region,伏尔加-乌拉尔地区突厥、乌拉尔人的F发生频度,值得注意的是仅巴什卡尔人有14%的发生频度,其他人群均缺失。
伏尔加-乌拉尔mtdna.jpg
Mitochondrial Genome Variation in Eastern Asia and the Peopling of Japan,这篇东亚和日本人群的mtdna分析,其中图瓦人8.33%的发生频度最高,布里亚特5%的频度次之。
f1b-东亚2.jpg
f1b-东亚3.jpg
f1b-东亚4.jpg
Nuclear and Mitochondrial DNA Analysis of a 2000-Year-Old Necropolis in the Egyin Gol Valley of Mongolia,匈奴egyin gol人群中也存在一定频度的F1b。
匈奴mtdna_f1b.jpg
Mitochondrial DNA Evidence for a Diversified Origin of Workers Building Mausoleum for First Emperor of China,秦陵劳工的mtdna的类型与频度情况,其中包括F1b和其他F分支。
秦-mtdna.jpg
本帖最后由 Yungsiyebu 于 2009-9-6 14:24 编辑

Population affinities of Neolithic Siberians: A snapshot from prehistoric Lake Baikal,西伯利亚古文化人群的mtdna,其中Lokomotiv的48%频度最高,现代人群shorian塔塔尔最高43%,乌拉尔人Kets24%次之。

Matrilineal affinities and prehistoric Siberian mortuary practices: a case study from Neolithic Lake Baikal,Lokomotiv人群的mtdna分析。
西伯利亚Lokomotiv等人群F.jpg
Lokomotiv人群F.jpg
目前手上相关的资料就是这样,欢迎各位补充,F当生于3-4万年前的旧石器时代,目前的证据支持F诞生于东南亚地区,此时还是冰河期,南方族群尚未发生大规模的人口扩张。F1b诞生于6.9+/-4.2千年前后,是冰河期结束后的新石器时代,这样可能存在几种可能。

其一,即F诞生之后不久,她所在族群在旧石器时代就迁徙到北方,甚至远及西伯利亚西部地区,这批人群的后裔在最后一次冰河期结束之后的大约6900年前诞生了第一位携有F1b遗传标记的女性,她的后裔支繁叶茂,主要分布在今天Shor塔塔尔人、Ket乌拉尔人,以及图瓦突厥、布里亚特蒙古、巴什卡尔突厥等西伯利亚人群,并伴随着乌拉尔-突厥-蒙古人的扩张而向欧洲延伸;同时,在日韩、中国、东南亚人群也有不同频度的分布,或许也为新石器时期之后西伯利亚人群迁徙的结果。

其二,在F诞生于3-4万年之后,直到6900年前F1b诞生之前,在这漫长的历史时期内,南方人群都没有形成有利的扩张,而F1b也诞生于东南亚人群之中,并在其后的历史时期内,F1b所在的南方族群才开始向北方迁徙,并在中国、日韩留下印记,而在西伯利亚地区或许因为小人口规模族群的奠基人效应,而造成F1b在西伯利亚部分族群的高频,又因为乌拉尔-突厥-蒙古的扩张,为西欧亚地区带来低频的F,除了克罗地亚adriatic岛人群8.3%频度这样一个例外,或许也是隔绝人群奠基人效应而造成的结果。
永谢布标题党,没见1楼原文说"6.9+/-4.2千年",这个误差也太大了吧
疁殇1958 发表于 2009-9-6 15:28
又小白了吧,误差4.2k这就算了小了的,你看看那么mt单倍体类型,一估算n多前后都差了1万年,这里6.9K是最可能的时间,不排除4.2左右的可能浮动。
F1b还是F1d?
F1b还是F1d?
hercules 发表于 2009-9-6 21:54
吆,看走眼了,f1d以前见都没见过,直接就当成f1b了,不过这就更稀有了,印象中再没在哪看到过f1d,哎,我这个想找个诞生于冰川期之后的y聊上两句的愿望还真不容易实现。
这个工作没白做,刚刚接到poly博士通知,我的也mtdna也测了一部分,16189C, 16232A, 16249C, 16291T, 16304C, 16311C ,我还没去匹配,poly判断F1b。先贴出来。

P.S. 老鲜同学啊,我算是跟你干上了!
新技术方案尝试:低覆盖全基因组,最低成本深度解析父系源流,略有成效,大家一起摸索。微博@好奇云怪 QQ群:387100816。
本帖最后由 baiyueren 于 2011-3-18 10:56 编辑

看样子永谢布的父母系不是真的北亚蒙古,而是新石器北上的南人后裔啊!
NRY: O2a1c1a1a1a1a1a1-002611,F11,F17,F856,F1495(源自粤西云浮)
mtDNA:B4d1(源自浙北慈溪)
百越人的人类学文集 http://blog.sina.com.cn/baiyueren
看样子永谢布的父母系不是真的北亚蒙古,而是新石器从沿海路线北上的南人后裔啊!
baiyueren 发表于 2011-3-18 10:50
可能伴随群N*,与西伯利亚的乌拉尔系族群相关。
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永谢布老扯什么乌拉尔,不会是想数典忘祖,而跟金发美女和斯基泰人扯上点什么姻亲关系吧?
NRY: O2a1c1a1a1a1a1a1-002611,F11,F17,F856,F1495(源自粤西云浮)
mtDNA:B4d1(源自浙北慈溪)
百越人的人类学文集 http://blog.sina.com.cn/baiyueren
我对诸位动辄万年以上的云里雾里,没兴趣,F1b高频见于shorian塔塔尔最高43%,Kets24%,巴什科尔人14%,图瓦8%+,布里亚特5%,而东亚很少见,古代DNA见于egyin gol匈奴4例,而西伯利亚目前已知最早的新石器文化古代dna高达48%,不出意外应为F1b。此群在北方,新石器时代之后从北方向南迁徙,是问题不大的。
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什么叫“问题不大”呢?永谢布既然知道南方F1b很少,为什么认定是“新石器时代之后从北方向南迁徙”。还有永谢布是否分析过HVI数据,是否支持F1b的南方类型是北方类型的下游分支呢?
NRY: O2a1c1a1a1a1a1a1-002611,F11,F17,F856,F1495(源自粤西云浮)
mtDNA:B4d1(源自浙北慈溪)
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