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标题: 羌人(牧羊人)何时大规模进入西南?来自绵羊的基因证据 [打印本页]

作者: Yungsiyebu    时间: 2018-3-16 20:40     标题: 羌人(牧羊人)何时大规模进入西南?来自绵羊的基因证据

羊,3000-5000年前,由蒙古进入西北,2000-2600年前,由西北进入西藏和云南,伴随牧羊人西羌。
Genomic Reconstruction of the History of Native Sheep Reveals the Peopling Patterns of Nomads and the Expansion of Early Pastoralism in East Asia

Originating from the Mongolian Plateau ~5,000‒5,700 years ago, Chinese sheep were inferred to spread in the upper and middle reaches of the Yellow River ~3,000‒5,000 years ago following the expansions of the Di-Qiang people. Afterwards, sheep were then inferred to reach the Qinghai-Tibetan and Yunnan-Kweichow plateaus ~2,000‒2,600 years ago by following the north-to-southwest routes of the Di-Qiang migration.

作者: Yungsiyebu    时间: 2018-3-16 21:50

我们在看西北人骨数据的变化时,是可以普遍观察到一种现象的,即除了部分典型北亚样本之外,甘宁青地区的青铜时代人群要比新石器时代组,相对更偏向北亚组一些,暗示伴随着绵羊迁徙的还有人。同时,也有一些青铜组接近古中原类型,比如甘肃秦人等。

BlueO甘肃永昌沙井组
BlueO甘肃合水九站组,先周早期-西周晚期
BlueO甘肃磨沟墓,寺洼
BlueO甘肃民乐县东灰山,四坝文化
BlueO甘肃磨沟墓,齐家文化
RedO甘肃玉门火烧沟,新石器,3700
BlueO甘肃酒泉干骨崖
BlueO甘肃史前合并组,布达生
BlueO甘肃铜石时代
RedO甘肃鸳鸯池
BlueO甘肃毛家坪秦人
BlueO甘肃礼县西山组,早期秦人,西周-春秋战国,资料来自西北大学陈靓
BlueO甘肃长武庆阳碾子坡,东周
RedO宁夏海原菜园,新石器
BlueO宁夏彭阳大王户村春秋战国组
BlueO宁夏固原县彭堡于家庄春秋战国
BlueO青海阿哈特拉山,卡约
BlueO青海民和核桃庄,辛店
RedO青海民和阳山,新石器
BlueO青海大通上孙家寨 汉代
BlueO青海陶家寨,汉代
BlueO青海大通上孙家寨 卡约
BlueO青海湟中县李家山,卡约
BlueO青海乐都柳湾,齐家
BlueO青海乐都柳湾,马厂
BlueO青海平安大槽子东汉组
RedX伊沃尔匈奴组
RedX蒙古色楞格省匈奴
RedX蒙古中央省匈奴
RedX特罗伊茨基靺鞨
RedX内蒙古清水河县阳畔组
BrownX吉林大安渔场鲜卑
RedX蒙古东部匈奴组
RedX乌布苏省匈奴
RedX阿穆尔特洛伊茨基
RedX外贝加尔石板墓青铜文化
RedX内蒙古新店子
RedX蒙古西部匈奴组
RedX内蒙古乌兰察布兴和县叭沟鲜卑组
RedX内蒙古叭沟鲜卑
RedX蒙古东部石板墓
RedX内蒙古东大井鲜卑
RedX贝加尔新石器组
RedX宁夏彭阳大王户村春秋战国组
RedX蒙古匈奴全组.突出的鼻骨
RedX蒙古中部石板墓
RedX外贝加尔中世纪
RedX内蒙古凉城窑子组春秋战国
BrownX辽西朝阳鲜卑组
RedX前杭爱省组台布希墓匈奴
RedX内蒙古扎赉诺尔A鲜卑
RedX贝加尔中世纪
RedX外贝加尔匈奴.公元前二世纪-公元后三世纪
RedX外贝加尔新石器组
RedX内蒙古南杨家营子
RedX内蒙古赤峰南杨家营子汉代鲜卑组
RedX内蒙古萧氏后族组
RedX内蒙古耶律与之组
RedX蒙古中南部匈奴组
RedX内蒙古三道湾鲜卑组
RedX内蒙古井沟子
RedX内蒙古山嘴子契丹
BrownX吉林白城双塔东周组
BrownX河北张家口白庙II组,春秋组
RedX内蒙古凉城县忻州窑子墓A组,东周时代
BrownX山西忻州窑子坡组,战国晚期至西汉


图片附件: northwest-Mongolia MDS.jpg (2018-3-16 21:50, 167.89 KB) / 下载次数 3
http://ranhaer.com/attachment.php?aid=56709&k=992bdbd88275a57092fd71823bc55f99&t=1531814149&sid=BMZcBK


作者: MNOPS    时间: 2018-3-17 13:13

好文章,不仅证实了藏缅是从西北南迁的理论,而且还初步确定了藏缅大规模南迁的时间。

估计那些坚持汉藏是西南起源的人看到这篇文章之后哭惨了,哈哈
作者: passer-by    时间: 2018-3-17 15:59

3# MNOPS 翻了下发现你这人挺无聊的,老永说一句捧一句完全不像话。
作者: ChinaHistory    时间: 2018-3-17 19:56

http://www.bio1000.com/gnjz/gene/507192.html

Mol Biol Evol:中科院动物院李孟华研究组首次揭示新石器时代晚期以来中国地方绵羊及游牧民族发历史
日期:2017-06-30     来源:生物帮

摘要 : 2017年6月22日,国际分子生物学和进化领域的权威期刊《Molecular Biology and Evolution》杂志在线发表了中国科学院动物研究所李孟华研究组的一篇研究论文,研究报道了新石器时代晚期以来中国地方绵羊及游牧民族发展历史。

2017年6月22日,国际分子生物学和进化领域的权威期刊《molecular Biology and evolution》杂志在线发表了中国科学院动物研究所李孟华研究组的一篇研究论文,研究报道了新石器时代晚期以来中国地方绵羊及游牧民族发展历史。动物所博士研究生赵永欣、助理研究员杨继和吕锋骅为共同第一作者,李孟华研究员为通讯作者。

绵羊作为最早的驯化动物之一,与人类生活,尤其是游牧民族的生活息息相关。通过解析绵羊的种群历史,如迁徙、扩散、品种选育历史,在一定程度上揭示早期人类的活动,尤其是游牧民族迁移扩散历史以及早期畜牧业的扩张和发展模式。

李孟华研究组通过整合世界范围内的2000多个家养绵羊和野生绵羊的基因组数据、考古记录和民族史资料等信息进行了多学科综合研究。在基因组学上,利用多种统计方法重建了中国绵羊的种群历史;在考古记录上,整理了中国境内的古代绵羊遗骸的时间、地点等考古信息;在民族史方面,综述、总结了与绵羊相关的主要游牧民族(如蒙古族,女真族,回族,藏族,中国西南的彝族、拉祜族等少数民族)的起源和迁徙等历史资料。通过比较分析绵羊种群历史、考古记录及民族史料记载的一致性,发现中国绵羊的扩散历史与地方品种形成与游牧民族迁徙显著相关,即绵羊在大约3,000‒5,000年前随着氐羌民族的扩张进入到黄河流域中上游地区,而后在大约2,000‒2,600年前随着氐羌民族的迁移,沿着北方到西南的路线到达青藏和云贵高原,形成目前的地方绵羊品种。研究结果还揭示了随后两次肥尾羊的早期迁移,这两次迁移与12‒13世纪穆斯林祖先的东迁和蒙古族南下的历史吻合,并形成了目前北方地区绵羊品种。此外,本研究还首次检测到家养绵羊基因组中野生盘羊的基因渗入以及与不同表型性状候选基因相关的强烈人工选择信号,反映了早期游牧时期的育种策略。

本研究工作利用家养动物的基因组数据和家养动物的扩散背景首次全面阐释了新石器时代晚期以来中东亚地区游牧民族的扩张历史,为中国绵羊的起源、分化、扩张及混合研究以及早期游牧民族的发展和畜牧业扩张提供了新的见解。



图示:早期东亚地区游牧民族和绵羊发展历史

原文链接:genomic reconstruction of the history of native sheep reveals the peopling patterns of nomads and the expansion of early pastoralism in East Asia

原文摘要:China has a rich resource of native sheep (Ovis aries) breeds associated with historical movements of several nomadic societies. However, the history of sheep and the associated nomadic societies in ancient China remains poorly understood. Here, we studied the genomic diversity of Chinese sheep using genome-wide SNPs, mitochondrial and Y-chromosomal variations in more than 1,000 modern samples. Population genomic analyses combined with archaeological records and historical ethnic demographics data revealed genetic signatures of their origins, secondary expansions and admixtures, thereby revealing the peopling patterns of nomads and the expansion of early pastoralism in East Asia. Originating from the Mongolian Plateau ∼5,000‒5,700 years ago, Chinese sheep were inferred to spread in the upper and middle reaches of the Yellow River ∼3,000‒5,000 years ago following the expansions of the Di-Qiang people. Afterwards, sheep were then inferred to reach the Qinghai-Tibetan and Yunnan-Kweichow plateaus ∼2,000‒2,600 years ago by following the north-to-southwest routes of the Di-Qiang migration. We also unveil two subsequent waves of immigrations of fat-tailed sheep into northern China, which were largely commensurate with the migrations of ancestors of Hui Muslims eastward and Mongols southward during the 12th‒13th centuries. Furthermore, we revealed signs of argali introgression into domestic sheep, extensive historical mixtures among domestic populations and strong artificial selection for tail type and other traits, reflecting various breeding strategies by nomadic societies in ancient China.

DOI:10.1093/molbev/msx181
作者: ChinaHistory    时间: 2018-3-17 20:01

http://m.cssn.cn/lxsx/lsgdxw/201707/t20170712_3578051.shtml

从绵羊扩散看游牧民族迁徙

2017-07-12 14:36 来源:北京日报 作者:科牧

  编者导读

绵羊作为最早的驯化动物之一,与人类生活尤其是游牧民族的生活息息相关。通过解析绵羊的种群历史,如迁徙、扩散、品种选育历史,可以在一定程度上揭示早期人类的活动,尤其是游牧民族迁移扩散历史以及早期畜牧业的扩张和发展模式。

中国科学院动物研究所李孟华研究组,通过整合世界范围内的2000多个家养绵羊和野生绵羊的基因组数据、考古记录和民族史资料等信息进行了多学科综合研究,为我们做了解析。

绵羊在我国的养殖历史超过5000年,许多民族的生活方式和文化传承与绵羊息息相关,如在《说文·羊部》描述羌为“大禹西羌牧羊人也,从人从羊,羊亦声”。但是绵羊是从哪里起源,何时传入我国,在我国又是如何扩散的,以及绵羊的扩散与游牧民族的迁移扩张有没有联系,有何种联系,这一系列的问题有待解决。

  1.基因组DNA揭示绵羊中东起源

基因组DNA为解决这些问题提供了最佳的工具。DNA携带了生命过程大部分信息,控制生命的发育、生长、繁殖等过程。而DNA在传递过程中不同群体的混合、分化在基因组的DNA序列会留下痕迹,这就如传说故事在民间流传经过不同地区或不同年代流传留下了地方语言的痕迹。通过这些痕迹,能够追溯历史过程。

上世纪90年代以前,我国学者认为中国的绵羊是先民驯化的盘羊的后代,并在逐渐的驯养与育种过程中形成不同的地方品种。90年代后,伴随着考古学证据、遗传学证据的增多,改变了我国绵羊驯化自盘羊的说法。大家一般认为,我国绵羊与世界各地的绵羊有共同的祖先(即亚洲摩弗伦羊),可能驯化于1.05万至1.1万年前或更早的伊朗扎格罗斯北部到安纳托利亚东南部的连续地带。

通过比较来自不同地区的绵羊群体的线粒体遗传多样性,研究人员发现,来自中东地区的绵羊群体具有最高的多样性。系统发育树的结构显示,中国绵羊与世界其他地区的绵羊聚类为一个枝,中国绵羊与世界其他地区绵羊表现出相似的遗传组成。

系统发育树相当于这些研究对象的家谱,在系统发育树上,每一个枝的末端代表一个群体,相似的群体就如家谱中的亲戚,在树上的位置也会聚集在比较相近的位置。就如同在现代人类起源研究中,相对于黑猩猩,来自起源地的非洲人和中国人拥有相似的遗传组成一样。据此推断中国绵羊的祖先起源于中东地区。

       2.绵羊在中国经历两次扩散

以DNA信息构建的系统发育树,确定了不同地区绵羊相对关系,这一关系表明中国绵羊是由中东绵羊扩散而来。绵羊首先扩散至蒙古高原地区,而后从蒙古高原地区向南扩散,进入到中国西南、西藏、华东等地区。

对不同地区基因组DNA组成相似性比较——如同比较不同地区方言发音的相似性,可以发现更多历史痕迹。研究人员利用全基因组信息比较发现,我国北方地区绵羊基因组DNA中有一部分与中东地区更相似(大约6%),而其余部分才与中国其他地方绵羊基因组DNA相似。从这些结果,研究人员推断我国北方地区绵羊与中东地区绵羊有基因交流,而西藏和西南地区绵羊自传入后与中东地区绵羊无基因交流。

进一步比较中国与中东地区绵羊古DNA与现代DNA变化,发现了中国北方绵羊从大约3000年前至今DNA组成发生了巨大变化(单倍型组成),中东地区绵羊从历史至今DNA组成模式保持稳定。

通过以上研究结果,研究人员初步勾勒出了中国绵羊形成历史的两个阶段——第一阶段:在古老历史时期中东的绵羊扩散到蒙古高原地区,并进一步向南扩散进入到中国西藏、西南、北方各地;第二个阶段:在较近的历史时期中东的绵羊再一次向东方扩散,进入东亚北部地区,并与中国北方的绵羊混合。

          3.精细研究刻画两次迁移时间

基因组DNA中的痕迹不仅记录着亲疏远近,也如一把尺子能够丈量时间。但如何解读这把尺子存在着很大困难。最直观的想象将DNA的变化看作一辆匀速行驶汽车的行驶距离,在相等时间内不同群体或物种的DNA会产生相同差异(中性理论)。这种理想化的假设往往不够真实,因此衍生出众多的方法模拟基因组中DNA变化与时间的关系。

在对绵羊历史探索过程中,研究人员利用近似贝叶斯方法模拟绵羊的历史,避免了简单的匀速变化假设。通俗地讲,根据已有的研究,建立一系列可能的分化方式、分化时间,通过机器学习的方法模拟出DNA序列,比较模拟DNA序列与实际测序获得的DNA序列一致性。

研究人员利用该方法推断,绵羊约在5000至7000年以前首次扩散到蒙古高原地区,在约4000年前向西南高原方向迁徙,在大约2500年前分两部分,分别向青藏高原和云贵高原两个地区扩散。研究人员也推断出了第二阶段中国绵羊的历史——在大约1600年前中东绵羊再一次穿越广袤的中亚地区扩散到中国北方地区,并与该地区的绵羊混合。

           4.绵羊遗传学证据与游牧民族历史吻合

研究人员整理了我国游牧民族(如蒙古族、女真族、回族、藏族、中国西南的彝族、拉祜族等少数民族)的起源和迁徙等历史资料。这些史料记载5000多年前居住在中国西北部黄土高原的黄河和渭河河谷地区的氐羌部落,在商朝中期(大约3400年前)向东迁移到现在的山西和河南省地区,并于大约2000至2600年前沿着不同的路线大量南迁至青藏和云贵高原,形成了藏族和中国西南的一些少数民族(如彝族和拉祜族)。

通过比较分析绵羊种群历史、考古记录及民族史料记载的一致性,发现中国绵羊的扩散历史与地方品种形成与游牧民族迁徙显著相关,即绵羊在大约3000至5000年前随着氐羌民族的扩张进入到黄河流域中上游地区,而后在大约2000至2600年前随着氐羌民族的迁移,沿着北方到西南的路线到达青藏和云贵高原,形成目前的地方绵羊品种。

研究结果还揭示了随后两次肥尾羊在中国的迁移,这两次迁移与12至13世纪中国穆斯林祖先的东迁和蒙古族南下的历史吻合,并形成了目前北方地区的绵羊品种。
作者: lindberg    时间: 2018-3-17 21:29

其实从内地来说,也不能光研究绵羊,山羊更有意义。

绵羊更喜欢盐碱地,盐碱地长大的羊肉也好吃。

一开始可能绵羊和山羊一起进入内地,山羊更适应中国内地的土壤和气候,绵羊被逐渐淘汰。

内地有很多山羊品种都很有名,记得以前在山东吃过一种,味道甚美。
作者: ChinaHistory    时间: 2018-3-17 21:52

本帖最后由 ChinaHistory 于 2018-3-17 22:04 编辑
其实从内地来说,也不能光研究绵羊,山羊更有意义。

绵羊更喜欢盐碱地,盐碱地长大的羊肉也好吃。

一开始可能绵羊和山羊一起进入内地,山羊更适应中国内地的土壤和气候,绵羊被逐渐淘汰。

内地有很多山羊品 ...
lindberg 发表于 2018-3-17 21:29
你说绵羊被逐渐淘汰与事实不符。

http://www.lascn.net/Item/10554.aspx

中科院昆明动物所领衔完成山羊、绵羊基因组“破译” 揭示反刍动物进化新特征                                                    2014年07月03日                    来源:中科院昆明动物所                    作者:中科院昆明动物所
                                    
                                                                                       
昆明动物所王文研究员领导的团队继2013年解析山羊基因组揭示羊绒生长的基因基础之后,近日再次携手华大基因研究院、澳大利亚联邦科学与工业研究组织等国内外机构“破译”了绵羊基因组。至此,所有重要家畜动物的基因组密码全部告破。


山羊和绵羊是反刍动物的典型代表动物,而瘤胃是反刍动物独有的消化器官。科学家们首次观测到两种在反刍动物中发生特异蛋白结构改变,且仅在瘤胃中特异高表达的结构蛋白。一种是首次报道和命名的毛透明蛋白类似蛋白,另外一种是小脯氨酸丰富蛋白II家族。它们发挥瘤胃表面基板的作用,通过转谷氨酰胺酶介导交联瘤胃表达的角蛋白,从而构成瘤胃壁粘膜层的坚韧的角质化表面。与消化吸收密切联系的是代谢。研究发现除了肝脏,反刍动物的皮肤也是重要的脂类代谢器官。绵羊毛囊的皮脂腺分泌、附着在羊毛的羊毛脂占羊毛重量的10-25%。有意思的是,两个重要脂肪代谢的基因,单酰甘油-O-酰基转移酶MOGAT2和MOGAT3基因,在反刍动物早期以及随后在绵羊中进化出了新的重复基因,在绵羊皮肤中这些基因高度表达。而人体中MOGAT3酶是小肠粘膜细胞通过甘油一酯途径合成脂肪的关键限速酶,也是重要的肝酶,从未发现在皮肤中表达。在绵羊中MOGAT2、3基因仅在皮肤中高表达,提示甘油三脂分解生成羊毛脂所产生的甘油一脂,可在皮肤中直接被回收重新生成甘油三脂,这样就增加了绵羊皮肤中回收甘油骨架的代谢合成效率。这种新基因重复事件也在溶菌酶基因和妊娠糖蛋白基因家族中反复上演。说明新基因的产生对反刍动物和绵羊的特殊生物学性状进化作出了重要贡献。


中国是世界上最大的养羊大国。目前中国绵羊、山羊总存栏数约三亿只,每年进口约26万吨羊肉,占世界羊肉总贸易的20%。但山羊、绵羊基因组解析一直滞后于牛和猪等家畜,严重阻碍了山羊、绵羊的遗传育种和科学研究工作。有鉴于此,2009年王文研究员与华大基因研究院一道发起了山羊、绵羊基因组解析工作,随后跟多个国内外研究机构一道,破译了山羊和绵羊的基因组,不仅解析了这两种小型反刍家养动物的一些生物学特性谜题,也为推动山羊、绵羊经济性状基因的鉴定和新品种的基因组辅助高效育种奠定了重要的基础。


山羊基因组工作于2013年发表在Nature Biotechnology上,绵羊基因组工作成果于近日发表在美国Science杂志上。
作者: lindberg    时间: 2018-3-17 22:29

8# ChinaHistory
我是说中国非干旱地区,感觉绵羊就是西北内蒙多
作者: MNOPS    时间: 2018-3-18 00:44

4# passer-by
说得有道理我才捧呢,说得没道理我连看都懒得看
作者: xavierxh    时间: 2018-6-6 10:10

3# MNOPS 起源一般都要上述到几万年前,三千年内的历史这么清楚还用分析评判。
作者: MNOPS    时间: 2018-6-6 21:25

11# xavierxh

先把几千年前的弄清楚再说上万年前的事吧
作者: xavierxh    时间: 2018-6-7 01:12

本帖最后由 xavierxh 于 2018-6-7 01:13 编辑

12# MNOPS 多看看中国的24史,如果能够看两遍以上就没有那么多疑惑了。
作者: MNOPS    时间: 2018-6-7 18:59

13# xavierxh

24史纪录的只是信史且主要是以中原为中心,至于其他边疆民族的历史很大程度上还是要依靠考古发掘和基因检测才能了解。
作者: 9985916    时间: 2018-6-17 10:11

从旧石器晚期文化遗存看黄河流域人群向川西高原的迁徒
石硕   ( 2009-05-07)    来源: 西藏研究
综上所述,我们可以得出这样的结论:旧石器时代晚期,在川西高原的雅碧江流域、大渡河流域已经存在古人类的活动踪迹,他们主要是从黄河流域地区沿甘青高原南下的北方原始人群系统,正是他们的迁徙和南下,将源自于华北地区的小石器和细石器传统带入了藏彝走廊地区。




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